RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546248.5

TRDN-205, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,179 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-205ENST00000546248 CHODLQ9H9P2 273 aa4.9□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 MED17Q9NVC6 651 aa4.9□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 C14orf105Q9NVL8 296 aa4.9□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 IL20RAQ9UHF4 553 aa4.9□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 OSGIN1Q9UJX0 560 aa4.9□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 CARD8Q9Y2G2 431 aa4.9□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 MED31Q9Y3C7 131 aa4.9□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 MYO10Q9HD67 2058 aa4.9□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa4.9□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 CROCCQ5TZA2 2017 aa4.89□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa4.89□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 A0A087WUJ7 227 aa4.89□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 CCDC182A6NF36 153 aa4.89□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 METTL15A6NJ78 407 aa4.89□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 VSTM2BA6NLU5 285 aa4.89□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 J3QRE1 110 aa4.89□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 M0R3G1 203 aa4.89□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 WWP2O00308 870 aa4.89□□□□□ -1.63
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TRDN-205ENST00000546248 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 SOCS6O14544 535 aa4.89□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 AIREO43918 545 aa4.89□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 TSPAN2O60636 221 aa4.89□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 CLPXO76031 633 aa4.89□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 RCBTB2O95199 551 aa4.89□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 NADKO95544 446 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 RAB36O95755 333 aa4.89□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 CSTAP01040 98 aa4.89□□□□□ -1.63
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TRDN-205ENST00000546248 LIMS4P0CW20 117 aa4.89□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 HSMCR30P0CW71 290 aa4.89□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 HTR1FP30939 366 aa4.89□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 LCN1P31025 176 aa4.89□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 HOXD12P35452 270 aa4.89□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 CD79BP40259 229 aa4.89□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 OPRL1P41146 370 aa4.89□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 CRYBB2P43320 205 aa4.89□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 DCAF7P61962 342 aa4.89□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 TLE3Q04726 772 aa4.89□□□□□ -1.63
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TRDN-205ENST00000546248 RAB40BQ12829 278 aa4.89□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 ITGADQ13349 1161 aa4.89□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 EBPQ15125 230 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 SPHARQ15513 63 aa4.89□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 MED22Q15528 200 aa4.89□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 NSDHLQ15738 373 aa4.89□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 DGUOKQ16854 277 aa4.89□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 NXNL2Q5VZ03 156 aa4.89□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 MORN5Q5VZ52 161 aa4.89□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa4.89□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 ULK3Q6PHR2 472 aa4.89□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 CBLN3Q6UW01 205 aa4.89□□□□□ -1.63
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TRDN-205ENST00000546248 PRR22Q8IZ63 422 aa4.89□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 CDK20Q8IZL9 346 aa4.89□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 SLC34A3Q8N130 599 aa4.89□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa4.89□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 TMEM105Q8N8V8 129 aa4.89□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 OR2T33Q8NG76 320 aa4.89□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa4.89□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 OR13C2Q8NGS9 318 aa4.89□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 OIT3Q8WWZ8 545 aa4.89□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 THAP4Q8WY91 577 aa4.89□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 TM9SF4Q92544 642 aa4.89□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 SGTBQ96EQ0 304 aa4.89□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 SLC38A2Q96QD8 506 aa4.89□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 DDOQ99489 341 aa4.89□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 CENPOQ9BU64 300 aa4.89□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 HCAR1Q9BXC0 346 aa4.89□□□□□ -1.63
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TRDN-205ENST00000546248 OR8D2Q9GZM6 311 aa4.89□□□□□ -1.63
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TRDN-205ENST00000546248 ISYNA1Q9NPH2 558 aa4.89□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
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TRDN-205ENST00000546248 G6PC2Q9NQR9 355 aa4.89□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 OCIAD1Q9NX40 245 aa4.89□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 CTSFQ9UBX1 484 aa4.89□□□□□ -1.63
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TRDN-205ENST00000546248 ERGIC3Q9Y282 383 aa4.89□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 TMEM5Q9Y2B1 443 aa4.89□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa4.89□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 OR10H1Q9Y4A9 318 aa4.89□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa4.89□□□□□ -1.63
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