RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 RNF121Q9H920 327 aa4.91□□□□□ -1.62
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
CLSTN3-215ENST00000544584 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
CLSTN3-215ENST00000544584 TAGLN3Q9UI15 199 aa4.91□□□□□ -1.62
CLSTN3-215ENST00000544584 AURKCQ9UQB9 309 aa4.91□□□□□ -1.62
CLSTN3-215ENST00000544584 CHST2Q9Y4C5 530 aa4.91□□□□□ -1.62
CLSTN3-215ENST00000544584 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.62
CLSTN3-215ENST00000544584 FREM1Q5H8C1 2179 aa4.9□□□□□ -1.62
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CLSTN3-215ENST00000544584 A0A1W2PPZ6 126 aa4.9□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 A0A1W2PRQ8 180 aa4.9□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 EFCAB9A8MZ26 197 aa4.9□□□□□ -1.63
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CLSTN3-215ENST00000544584 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 SIAH2O43255 324 aa4.9□□□□□ -1.63
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CLSTN3-215ENST00000544584 ASAH2BP0C7U1 165 aa4.9□□□□□ -1.63
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CLSTN3-215ENST00000544584 SLC25A16P16260 332 aa4.9□□□□□ -1.63
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CLSTN3-215ENST00000544584 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
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CLSTN3-215ENST00000544584 CLEC9AQ6UXN8 241 aa4.9□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF627Q7L945 461 aa4.9□□□□□ -1.63
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CLSTN3-215ENST00000544584 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
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CLSTN3-215ENST00000544584 SLC7A8Q9UHI5 535 aa4.9□□□□□ -1.63
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CLSTN3-215ENST00000544584 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 F12P00748 615 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 IGKV3-15P01624 115 aa4.89□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 H1F0P07305 194 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 QDPRP09417 244 aa4.89□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 IFI30P13284 250 aa4.89□□□□□ -1.63
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