RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534730.5

BBS1-224, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 627 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-224	ENST00000534730	DNM1P34	Q6PK57	102 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	TFAP2E	Q6VUC0	442 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	ARIH2OS	Q8N7S6	290 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	ZIC4	Q8N9L1	334 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	MOSPD2	Q8NHP6	518 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	ITLN2	Q8WWU7	325 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	RNASE6	Q93091	150 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF385A	Q96PM9	386 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	SLC38A2	Q96QD8	506 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	ENKD1	Q9H0I2	346 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	SMURF2	Q9HAU4	748 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	RNPEPL1	Q9HAU8	725 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	JKAMP	Q9P055	326 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	SEC14L4	Q9UDX3	406 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	MALT1	Q9UDY8	824 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	PDZD2	O15018	2839 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	SAC3D1	A6NKF1	404 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	TXNDC12	O95881	172 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	REN	P00797	406 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	PPP3CB	P16298	524 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	PAICS	P22234	425 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	PRKACG	P22612	351 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	MPG	P29372	298 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	ACVR1B	P36896	505 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	SORD	Q00796	357 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	SLC34A1	Q06495	639 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	TRIP10	Q15642	601 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	THEM4	Q5T1C6	240 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	KDM4D	Q6B0I6	523 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	OR7E24	Q6IFN5	339 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	VWA1	Q6PCB0	445 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	KLHL17	Q6TDP4	642 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	NUFIP2	Q7Z417	695 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	TMEM179B	Q7Z7N9	219 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	JAZF1	Q86VZ6	243 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	CCDC36	Q8IYA8	594 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	C20orf196	Q8IYI0	205 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	LRRC75A	Q8NAA5	344 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	C1orf162	Q8NEQ5	155 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	STEAP2	Q8NFT2	490 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	ASB10	Q8WXI3	467 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	PLEKHA8	Q96JA3	519 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	SAMD8	Q96LT4	415 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	ERMAP	Q96PL5	475 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	OR2M2	Q96R28	347 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	CIB1	Q99828	191 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	NIPSNAP1	Q9BPW8	284 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	RBM24	Q9BX46	236 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	TSSK6	Q9BXA6	273 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	TAS2R16	Q9NYV7	291 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	GLTP	Q9NZD2	209 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	KLHL21	Q9UJP4	597 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	GPR52	Q9Y2T5	361 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	RIIAD1	A6NNX1	92 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	KDM4E	B2RXH2	506 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	RPL36A-HNRNPH2	H7BZ11	118 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF432	O94892	652 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	CGA	P01215	116 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	HLA-DOB	P13765	273 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	HOXB1	P14653	301 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF3	P17036	446 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	KLK2	P20151	261 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	CRABP1	P29762	137 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	HOXC12	P31275	282 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	GRK5	P34947	590 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	CD79B	P40259	229 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	CENPA	P49450	140 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF84	P51523	738 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	ERVK-25	P63136	954 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	PPP2R2B	Q00005	443 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	MYBPC1	Q00872	1141 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	TOP3A	Q13472	1001 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	SLC36A3	Q495N2	470 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	ARMC4	Q5T2S8	1044 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	PLXDC2	Q6UX71	529 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	P2RY8	Q86VZ1	359 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	MEX3D	Q86XN8	651 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	LNX2	Q8N448	690 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF610	Q8N9Z0	462 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	MAGEE2	Q8TD90	523 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF775	Q96BV0	537 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	GPA33	Q99795	319 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	ULBP2	Q9BZM5	246 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	MED29	Q9NX70	200 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	NDRG3	Q9UGV2	375 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF346	Q9UL40	294 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	RRP15	Q9Y3B9	282 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	IER3IP1	Q9Y5U9	82 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	ADGRG4	Q8IZF6	3080 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	FAM90A27P	A6NNH2	459 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	C16orf97	H3BN30	126 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	CASQ2	O14958	399 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	ALPL	P05186	524 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	PSMB1	P20618	241 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	IL32	P24001	234 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	POU1F1	P28069	291 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	GIPR	P48546	466 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	SELENOP	P49908	381 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	DAP	P51397	102 aa		13.5	□□□□□ -0.25

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