RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531967.5

ECHDC1-222, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene ECHDC1, Length 2,585 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ECHDC1-222	ENST00000531967	SLC25A19	Q9HC21	320 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ECHDC1-222	ENST00000531967	NYAP2	Q9P242	653 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ECHDC1-222	ENST00000531967	TFR2	Q9UP52	801 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ECHDC1-222	ENST00000531967	GMPPB	Q9Y5P6	360 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ECHDC1-222	ENST00000531967	ABCC6	O95255	1503 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ECHDC1-222	ENST00000531967	TVP23A	A6NH52	213 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ECHDC1-222	ENST00000531967	HIDE1	A8MVS5	230 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ECHDC1-222	ENST00000531967		H3BNH8	94 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ECHDC1-222	ENST00000531967	AP2A1	O95782	977 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ECHDC1-222	ENST00000531967	APOC1	P02654	83 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ECHDC1-222	ENST00000531967	ORM1	P02763	201 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ECHDC1-222	ENST00000531967	MELTF	P08582	738 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ECHDC1-222	ENST00000531967	CR2	P20023	1033 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ECHDC1-222	ENST00000531967	OMP	P47874	163 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ECHDC1-222	ENST00000531967	CTF1	Q16619	201 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ECHDC1-222	ENST00000531967	UPP1	Q16831	310 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ECHDC1-222	ENST00000531967	ATP6V1F	Q16864	119 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ECHDC1-222	ENST00000531967	IRAK1BP1	Q5VVH5	260 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ECHDC1-222	ENST00000531967	SLC23A3	Q6PIS1	610 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ECHDC1-222	ENST00000531967	CALHM1	Q8IU99	346 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ECHDC1-222	ENST00000531967	ZNF547	Q8IVP9	402 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ECHDC1-222	ENST00000531967	WDFY1	Q8IWB7	410 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ECHDC1-222	ENST00000531967	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ECHDC1-222	ENST00000531967	KIF2B	Q8N4N8	673 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ECHDC1-222	ENST00000531967	CATSPER1	Q8NEC5	780 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ECHDC1-222	ENST00000531967	OR5M9	Q8NGP3	310 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ECHDC1-222	ENST00000531967	ART4	Q93070	314 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ECHDC1-222	ENST00000531967	CXorf40B	Q96DE9	158 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ECHDC1-222	ENST00000531967	HOXD1	Q9GZZ0	328 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ECHDC1-222	ENST00000531967	MSL2	Q9HCI7	577 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ECHDC1-222	ENST00000531967	CUTC	Q9NTM9	273 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ECHDC1-222	ENST00000531967	SERTAD4	Q9NUC0	356 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ECHDC1-222	ENST00000531967	PAK1IP1	Q9NWT1	392 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ECHDC1-222	ENST00000531967	DUS2	Q9NX74	493 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ECHDC1-222	ENST00000531967	CMTM6	Q9NX76	183 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ECHDC1-222	ENST00000531967	TCF19	Q9Y242	345 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ECHDC1-222	ENST00000531967	ABCB11	O95342	1321 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ECHDC1-222	ENST00000531967	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ECHDC1-222	ENST00000531967	KIAA0232	Q92628	1395 aa		4.59	□□□□□ -1.68
ECHDC1-222	ENST00000531967	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.68
ECHDC1-222	ENST00000531967	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
ECHDC1-222	ENST00000531967		C9J4A7	227 aa		4.59	□□□□□ -1.68
ECHDC1-222	ENST00000531967		J3KR12	359 aa		4.59	□□□□□ -1.68
ECHDC1-222	ENST00000531967		M0QZ92	97 aa		4.59	□□□□□ -1.68
ECHDC1-222	ENST00000531967	EPHB6	O15197	1021 aa		4.59	□□□□□ -1.68
ECHDC1-222	ENST00000531967	SLC22A1	O15245	554 aa		4.59	□□□□□ -1.68
ECHDC1-222	ENST00000531967	C1orf105	O95561	183 aa		4.59	□□□□□ -1.68
ECHDC1-222	ENST00000531967	SERPINA1	P01009	418 aa		4.59	□□□□□ -1.68
ECHDC1-222	ENST00000531967	TIMP1	P01033	207 aa		4.59	□□□□□ -1.68
ECHDC1-222	ENST00000531967	IFNA16	P05015	189 aa		4.59	□□□□□ -1.68
ECHDC1-222	ENST00000531967	RHOC	P08134	193 aa		4.59	□□□□□ -1.68
ECHDC1-222	ENST00000531967	HOXC6	P09630	235 aa		4.59	□□□□□ -1.68
ECHDC1-222	ENST00000531967	MYOG	P15173	224 aa		4.59	□□□□□ -1.68
ECHDC1-222	ENST00000531967	CBL	P22681	906 aa		4.59	□□□□□ -1.68
ECHDC1-222	ENST00000531967	C21orf33	P30042	268 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.68
ECHDC1-222	ENST00000531967	HCAR3	P49019	387 aa		4.59	□□□□□ -1.68
ECHDC1-222	ENST00000531967	DLX5	P56178	289 aa		4.59	□□□□□ -1.68
ECHDC1-222	ENST00000531967	OR2B8P	P59922	312 aa		4.59	□□□□□ -1.68
ECHDC1-222	ENST00000531967	TLE4	Q04727	773 aa		4.59	□□□□□ -1.68
ECHDC1-222	ENST00000531967	GPR17	Q13304	367 aa		4.59	□□□□□ -1.68
ECHDC1-222	ENST00000531967	TAF1A	Q15573	450 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.68
ECHDC1-222	ENST00000531967	BSX	Q3C1V8	233 aa		4.59	□□□□□ -1.68
ECHDC1-222	ENST00000531967	TMEM52B	Q4KMG9	183 aa		4.59	□□□□□ -1.68
ECHDC1-222	ENST00000531967	DCAF12	Q5T6F0	453 aa		4.59	□□□□□ -1.68
ECHDC1-222	ENST00000531967	OR4C11	Q6IEV9	310 aa		4.59	□□□□□ -1.68
ECHDC1-222	ENST00000531967	DNM1P34	Q6PK57	102 aa		4.59	□□□□□ -1.68
ECHDC1-222	ENST00000531967	DRAM2	Q6UX65	266 aa		4.59	□□□□□ -1.68
ECHDC1-222	ENST00000531967	ACOT7L	Q6ZUV0	252 aa		4.59	□□□□□ -1.68
ECHDC1-222	ENST00000531967	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
ECHDC1-222	ENST00000531967	ATP6V1C2	Q8NEY4	427 aa		4.59	□□□□□ -1.68
ECHDC1-222	ENST00000531967	OR10J5	Q8NHC4	309 aa		4.59	□□□□□ -1.68
ECHDC1-222	ENST00000531967	APH1B	Q8WW43	257 aa		4.59	□□□□□ -1.68
ECHDC1-222	ENST00000531967	GTF3A	Q92664	365 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
ECHDC1-222	ENST00000531967	MARC2	Q969Z3	335 aa		4.59	□□□□□ -1.68
ECHDC1-222	ENST00000531967	PNPLA2	Q96AD5	504 aa		4.59	□□□□□ -1.68
ECHDC1-222	ENST00000531967	PPWD1	Q96BP3	646 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
ECHDC1-222	ENST00000531967	NXPE2	Q96DL1	559 aa		4.59	□□□□□ -1.68
ECHDC1-222	ENST00000531967	MBD6	Q96DN6	1003 aa		4.59	□□□□□ -1.68
ECHDC1-222	ENST00000531967	COPS4	Q9BT78	406 aa		4.59	□□□□□ -1.68
ECHDC1-222	ENST00000531967	TMEM121	Q9BTD3	319 aa		4.59	□□□□□ -1.68
ECHDC1-222	ENST00000531967	APOO	Q9BUR5	198 aa		4.59	□□□□□ -1.68
ECHDC1-222	ENST00000531967	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		4.59	□□□□□ -1.68
ECHDC1-222	ENST00000531967	BARHL1	Q9BZE3	327 aa		4.59	□□□□□ -1.68
ECHDC1-222	ENST00000531967	ZYG11B	Q9C0D3	744 aa		4.59	□□□□□ -1.68
ECHDC1-222	ENST00000531967	TRABD	Q9H4I3	376 aa		4.59	□□□□□ -1.68
ECHDC1-222	ENST00000531967	MOV10	Q9HCE1	1003 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
ECHDC1-222	ENST00000531967	S100A14	Q9HCY8	104 aa		4.59	□□□□□ -1.68
ECHDC1-222	ENST00000531967	FGF20	Q9NP95	211 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.68
ECHDC1-222	ENST00000531967	ISYNA1	Q9NPH2	558 aa		4.59	□□□□□ -1.68
ECHDC1-222	ENST00000531967	IL36A	Q9UHA7	158 aa		4.59	□□□□□ -1.68
ECHDC1-222	ENST00000531967	ST6GALNAC2	Q9UJ37	374 aa		4.59	□□□□□ -1.68
ECHDC1-222	ENST00000531967	STUB1	Q9UNE7	303 aa		4.59	□□□□□ -1.68
ECHDC1-222	ENST00000531967	NRCAM	Q92823	1304 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ECHDC1-222	ENST00000531967	AKAP12	Q02952	1782 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ECHDC1-222	ENST00000531967	TCRBV5S1A1T	A0A578	114 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ECHDC1-222	ENST00000531967	TM9SF1	O15321	606 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ECHDC1-222	ENST00000531967	MAGEC1	O60732	1142 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ECHDC1-222	ENST00000531967	KHDRBS3	O75525	346 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ECHDC1-222	ENST00000531967	CCNK	O75909	580 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ECHDC1-222	ENST00000531967	PLAU	P00749	431 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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