RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530579.6

NEDD8-MDP1-201, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 2

Gene NEDD8-MDP1, Length 471 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MYRFQ9Y2G1 1151 aa7.56□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TPRKBQ9Y3C4 175 aa7.56□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NINQ8N4C6 2090 aa7.56□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IGF2RP11717 2491 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PTGES3LE9PB15 166 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PRODHO43272 600 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 XPNPEP2O43895 674 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 QDPRP09417 244 aa7.55□□□□□ -1.2
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SPI1P17947 270 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PYCR1P32322 319 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ATP6V1E1P36543 226 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SLC25A1P53007 311 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CASP6P55212 293 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CDH11P55287 796 aa7.55□□□□□ -1.2
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 AADACL4Q5VUY2 407 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NXNL2Q5VZ03 156 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LAIR2Q6ISS4 152 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DNM1P34Q6PK57 102 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 B3GLCTQ6Y288 498 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa7.55□□□□□ -1.2
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GCNT2Q8N0V5 402 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 UBE2J2Q8N2K1 259 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GPR137CQ8N3F9 429 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C9orf106Q8NAJ2 232 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR6K6Q8NGW6 343 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FBLIM1Q8WUP2 373 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NSMAFQ92636 917 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMEM54Q969K7 222 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMEM45BQ96B21 275 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RNFT2Q96EX2 444 aa7.55□□□□□ -1.2
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TSSK2Q96PF2 358 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SNX18Q96RF0 628 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KCNK17Q96T54 332 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DDOQ99489 341 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TEAD3Q99594 435 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ALG12Q9BV10 488 aa7.55□□□□□ -1.2
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C12orf49Q9H741 205 aa7.55□□□□□ -1.2
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GP6Q9HCN6 339 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ASB6Q9NWX5 421 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP7.55□□□□□ -1.2
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RCE1Q9Y256 329 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF835Q9Y2P0 537 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 EMC9Q9Y3B6 208 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HEATR5AQ86XA9 2040 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ACACAQ13085 2346 aa7.54□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 EML6Q6ZMW3 1958 aa7.54□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa7.54□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SLC22A31A6NKX4 558 aa7.54□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CENPBD1B2RD01 187 aa7.54□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 UPK3AO75631 287 aa7.54□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IL2RAP01589 272 aa7.54□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HLA-DQA2P01906 255 aa7.54□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PGA4P0DJD7 388 aa7.54□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PGA3P0DJD8 388 aa7.54□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NR2C1P13056 603 aa7.54□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CRABP1P29762 137 aa7.54□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 AGTR1P30556 359 aa7.54□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HTR1FP30939 366 aa7.54□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NTF4P34130 210 aa7.54□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MTNR1AP48039 350 aa7.54□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CXCR4P61073 352 aa7.54□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FMODQ06828 376 aa7.54□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KLHL22Q53GT1 634 aa7.54□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SLC35D3Q5M8T2 416 aa7.54□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LCN1P1Q5VSP4 162 aa7.54□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RTL6Q6ICC9 239 aa7.54□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LRFN4Q6PJG9 635 aa7.54□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMEM123Q8N131 208 aa7.54□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR6V1Q8N148 313 aa7.54□□□□□ -1.2
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