RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514552.5

PDE4D-222, Transcript of phosphodiesterase 4D, human

TSL 3

Gene PDE4D, Length 494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF117	Q03924	483 aa		5.94	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	SELENBP1	Q13228	472 aa		5.94	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	ITGAD	Q13349	1161 aa		5.94	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	NRF1	Q16656	503 aa		5.94	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	DUSP5	Q16690	384 aa		5.94	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	CLEC12B	Q2HXU8	276 aa		5.94	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	5.94	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	KLHL26	Q53HC5	615 aa		5.94	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	FAM219B	Q5XKK7	198 aa		5.94	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552		Q6ZSV7	163 aa		5.94	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	FCRLA	Q7L513	359 aa		5.94	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF367	Q7RTV3	350 aa		5.94	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	P2RY8	Q86VZ1	359 aa		5.94	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	IFT20	Q8IY31	132 aa		5.94	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	BANP	Q8N9N5	519 aa		5.94	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	SFXN5	Q8TD22	340 aa		5.94	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	ZFP90	Q8TF47	636 aa		5.94	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	ST8SIA4	Q92187	359 aa		5.94	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	OSTF1	Q92882	214 aa		5.94	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	S100PBP	Q96BU1	408 aa		5.94	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	FAM120B	Q96EK7	910 aa	Known RBP	5.94	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	RADIL	Q96JH8	1075 aa		5.94	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	EGLN2	Q96KS0	407 aa		5.94	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	C16orf45	Q96MC5	204 aa	Predicted RBP	5.94	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	TXLNGY	Q9BZA5	131 aa		5.94	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	PIGU	Q9H490	435 aa		5.94	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	EQTN	Q9NQ60	294 aa		5.94	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	ATAD3A	Q9NVI7	634 aa		5.94	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		5.94	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	ATP6V1H	Q9UI12	483 aa		5.94	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	ICAM5	Q9UMF0	924 aa		5.94	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	PLCE1	Q9P212	2302 aa		5.94	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	CBY3	A6NI87	242 aa		5.93	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF724	A8MTY0	619 aa		5.93	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	NPIPB9	F8W1W9	429 aa		5.93	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	TSPAN4	O14817	238 aa		5.93	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	LSM1	O15116	133 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	SCAMP2	O15127	329 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	CD5L	O43866	347 aa		5.93	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	LYPLA1	O75608	230 aa	Predicted RBP	5.93	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	AGR2	O95994	175 aa		5.93	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	AK1	P00568	194 aa		5.93	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	HMGN2	P05204	90 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	ATP6V1C1	P21283	382 aa		5.93	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	FKBP2	P26885	142 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	ARRB2	P32121	409 aa		5.93	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	SERPINB5	P36952	375 aa		5.93	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	OR3A2	P47893	321 aa		5.93	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	RPL38	P63173	70 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	FOXF1	Q12946	379 aa		5.93	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	TNK1	Q13470	666 aa		5.93	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	VEZF1	Q14119	521 aa		5.93	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	PDK3	Q15120	406 aa		5.93	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	TAB1	Q15750	504 aa		5.93	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	CD226	Q15762	336 aa		5.93	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	TIMM23B	Q5SRD1	257 aa		5.93	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	INTS11	Q5TA45	600 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	CDC73	Q6P1J9	531 aa		5.93	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	C3orf33	Q6P1S2	294 aa		5.93	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	BHLHB9	Q6PI77	547 aa		5.93	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552		Q6ZSR9	355 aa		5.93	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	MOB3C	Q70IA8	216 aa		5.93	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	SZRD1	Q7Z422	152 aa		5.93	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	C17orf53	Q8N3J3	647 aa	Predicted RBP	5.93	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	CEP112	Q8N8E3	955 aa		5.93	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	C11orf65	Q8NCR3	313 aa		5.93	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	LILRB1	Q8NHL6	650 aa	Predicted RBP	5.93	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	ABHD3	Q8WU67	409 aa		5.93	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	SMAP2	Q8WU79	429 aa	Predicted RBP	5.93	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	DGCR8	Q8WYQ5	773 aa	Known RBP eCLIP	5.93	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	ST8SIA1	Q92185	356 aa		5.93	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	CIDEC	Q96AQ7	238 aa	Predicted RBP	5.93	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	RNF125	Q96EQ8	232 aa		5.93	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	SH3YL1	Q96HL8	342 aa	Predicted RBP	5.93	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	PSD2	Q9BQI7	771 aa		5.93	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	TRAF4	Q9BUZ4	470 aa	Predicted RBP	5.93	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	NMUR2	Q9GZQ4	415 aa		5.93	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	SLCO5A1	Q9H2Y9	848 aa		5.93	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	COQ10B	Q9H8M1	238 aa		5.93	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	ZCCHC3	Q9NUD5	404 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	KIAA1456	Q9P272	454 aa		5.93	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	CLEC4A	Q9UMR7	237 aa		5.93	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	DNAJC15	Q9Y5T4	150 aa		5.93	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	MAGED1	Q9Y5V3	778 aa	Predicted RBP	5.93	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	CHD3	Q12873	2000 aa	Known RBP	5.92	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	ABCA1	O95477	2261 aa		5.92	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	IGKV3D-15	A0A087WSY6	115 aa		5.92	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552		A0A1W2PP18	115 aa		5.92	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	COPE	O14579	308 aa		5.92	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF195	O14628	629 aa		5.92	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	CYTIP	O60759	359 aa		5.92	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	PGM3	O95394	542 aa		5.92	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	SOD3	P08294	240 aa		5.92	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	FGF4	P08620	206 aa		5.92	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	BCKDHA	P12694	445 aa		5.92	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	CPA3	P15088	417 aa		5.92	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	5.92	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	RYK	P34925	604 aa		5.92	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	ATP12A	P54707	1039 aa		5.92	□□□□□ -1.46
PDE4D-222	ENST00000514552	DSCR9	P59020	149 aa		5.92	□□□□□ -1.46

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