RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511663.5

SH3BP2-220, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 966 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-220ENST00000511663 SYT3Q9BQG1 590 aa16.6■□□□□ 0.25
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SH3BP2-220ENST00000511663 RNF121Q9H920 327 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP2-220ENST00000511663 NANSQ9NR45 359 aa16.6■□□□□ 0.25
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SH3BP2-220ENST00000511663 GPR160Q9UJ42 338 aa16.6■□□□□ 0.25
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SH3BP2-220ENST00000511663 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
SH3BP2-220ENST00000511663 RAB39AQ14964 217 aa16.59■□□□□ 0.25
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SH3BP2-220ENST00000511663 ARHGDIGQ99819 225 aa16.59■□□□□ 0.25
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SH3BP2-220ENST00000511663 TRIP10Q15642 601 aa16.58■□□□□ 0.24
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SH3BP2-220ENST00000511663 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
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SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF75AQ96N20 296 aa16.58■□□□□ 0.24
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SH3BP2-220ENST00000511663 OR6T1Q8NGN1 323 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP2-220ENST00000511663 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
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SH3BP2-220ENST00000511663 TMEM54Q969K7 222 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
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SH3BP2-220ENST00000511663 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP2-220ENST00000511663 CGREF1Q99674 301 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP2-220ENST00000511663 LRMDAQ9H2I8 198 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP2-220ENST00000511663 METRNQ9UJH8 293 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP2-220ENST00000511663 FZR1Q9UM11 496 aa16.57■□□□□ 0.24
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SH3BP2-220ENST00000511663 BCL10O95999 233 aa16.56■□□□□ 0.24
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SH3BP2-220ENST00000511663 CD247P20963 164 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP2-220ENST00000511663 ACHEP22303 614 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP2-220ENST00000511663 COL8A2P25067 703 aa16.56■□□□□ 0.24
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SH3BP2-220ENST00000511663 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
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SH3BP2-220ENST00000511663 SLC36A2Q495M3 483 aa16.56■□□□□ 0.24
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SH3BP2-220ENST00000511663 SLC19A3Q9BZV2 496 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP2-220ENST00000511663 C1orf198Q9H425 327 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP2-220ENST00000511663 CDH20Q9HBT6 801 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP2-220ENST00000511663 TAS2R5Q9NYW4 299 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF224Q9NZL3 707 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF229Q9UJW7 825 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC7A7Q9UM01 511 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP2-220ENST00000511663 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP2-220ENST00000511663 DHHO43323 396 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP2-220ENST00000511663 HPXP02790 462 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP2-220ENST00000511663 PATE4P0C8F1 98 aa16.55■□□□□ 0.24
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