RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511313.5

POLR2J3-215, Transcript of RNA polymerase II subunit J3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene POLR2J3, Length 4,630 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J3-215ENST00000511313 ACSM5Q6NUN0 579 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 TRAT1Q6PIZ9 186 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 PHYHIPQ92561 330 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 MED30Q96HR3 178 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 FCRL1Q96LA6 429 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 COQ7Q99807 217 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 SPOCK3Q9BQ16 436 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 MND1Q9BWT6 205 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 CD300AQ9UGN4 299 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 HHLA2Q9UM44 414 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 TSC2P49815 1807 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 NDUFB3O43676 98 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 AKR7A3O95154 331 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 IFNA6P05013 189 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 UMODP07911 640 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 CEACAM3P40198 252 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 CDKN2CP42773 168 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 OR3A2P47893 321 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 TESK1Q15569 626 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 OR8B8Q15620 311 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 VASNQ6EMK4 673 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 OR5D14Q8NGL3 314 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 DPF1Q92782 380 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 SLAMF8Q9P0V8 285 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 A0A087WUJ7 227 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 GPRIN2O60269 458 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 TNFAIP8O95379 198 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 IGHG3P01860 377 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 HLA-DPB1P04440 258 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 COX5BP10606 129 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 CBR1P16152 277 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 RAB25P57735 213 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 CORO7P57737 925 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 ATP6AP1Q15904 470 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 HYAL4Q2M3T9 481 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 C9orf40Q8IXQ3 194 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 RNF148Q8N7C7 305 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 SCCPDHQ8NBX0 429 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 NDUFS8O00217 210 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 BMP2P12643 396 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 MLLT10P55197 1068 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 ST3GAL4Q11206 333 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 DRAM2Q6UX65 266 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 NHLRC1Q6VVB1 395 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 COX15Q7KZN9 410 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 DNAAF1Q8NEP3 725 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 TPK1Q9H3S4 243 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 SLC22A11Q9NSA0 550 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 PNPLA3Q9NST1 481 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 ALPK3Q96L96 1907 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 A0A1W2PRQ8 180 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 HSPA12AO43301 675 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 NADKO95544 446 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 FOXA1P55317 472 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 CLDN6P56747 220 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 LSM6P62312 80 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 ZNF117Q03924 483 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 DGCR6Q14129 220 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 RSU1Q15404 277 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 H3F3CQ6NXT2 135 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 NODALQ96S42 347 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 INPP5KQ9BT40 448 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 OR52D1Q9H346 318 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 A0A087WUU8 490 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 ARRDC5A6NEK1 342 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 NPIPA7E9PJI5 369 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 ACTL6BO94805 426 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 CST2P09228 141 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 NPIPA8P0DM63 369 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 CBLP22681 906 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 SDHAP31040 664 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 SMIM21Q3B7S5 101 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 NADK2Q4G0N4 442 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 ZNF615Q8N8J6 731 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 DOK4Q8TEW6 326 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 TXNDC15Q96J42 360 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 NELFAQ9H3P2 528 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 QDPRP09417 244 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 GKN3PP0CG01 181 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 RFC3P40938 356 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 YAP1P46937 504 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 PCYT1AP49585 367 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 VBP1P61758 197 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 ZP4Q12836 540 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 CEACAM16Q2WEN9 425 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 CDH24Q86UP0 819 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR2J3-215ENST00000511313 AMER2Q8N7J2 671 aa8.68□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms