RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506464.5

ABCC3-208, Transcript of ATP binding cassette subfamily C member 3, human

TSL 4

Gene ABCC3, Length 540 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCC3-208	ENST00000506464		B2RBV5	119 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	LRRN3	E7EW58	273 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	NDUFS7	O75251	213 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	CRLF1	O75462	422 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	IGF2	P01344	180 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	CECR9	P0C854	216 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	CALB2	P22676	271 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	CBL	P22681	906 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	PPOX	P50336	477 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	LGALS3BP	Q08380	585 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	ZP4	Q12836	540 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	IFI44L	Q53G44	452 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	GLYAT	Q6IB77	296 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	TRPM8	Q7Z2W7	1104 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	FAM86B1	Q8N7N1	296 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	PRRC1	Q96M27	445 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	NELFA	Q9H3P2	528 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	GORASP2	Q9H8Y8	452 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	MEPE	Q9NQ76	525 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	MAGEL2	Q9UJ55	1249 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	RIMS3	Q9UJD0	308 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	ZNF229	Q9UJW7	825 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	RPS6KA6	Q9UK32	745 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	IGHV4-30-2	A0A087WSY4	118 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	SLC35F4	A4IF30	521 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	HTR3E	A5X5Y0	456 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464		M0R3G1	203 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	KPNA4	O00629	521 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	PLPP3	O14495	311 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	FFAR1	O14842	300 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	ARPC2	O15144	300 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	PRSS23	O95084	383 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	HIST1H2AB	P04908	130 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	IFNW1	P05000	195 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	ADORA3	P0DMS8	318 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	THRB	P10828	461 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	FUT4	P22083	530 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	MSX2	P35548	267 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	RBM34	P42696	430 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	PDLIM4	P50479	330 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	UGT2B15	P54855	530 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	VLDLR	P98155	873 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	ZNF74	Q16587	644 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	SPATS1	Q496A3	300 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	RINL	Q6ZS11	566 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	HIST3H2A	Q7L7L0	130 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	HDDC2	Q7Z4H3	204 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	TSEN54	Q7Z6J9	526 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	NKAIN4	Q8IVV8	208 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	OFCC1	Q8IZS5	231 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	ZNF540	Q8NDQ6	660 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	OR6N1	Q8NGY5	312 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	OR6X1	Q8NH79	312 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	TMEM255B	Q8WV15	326 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	HIST1H2AC	Q93077	130 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	FBXO17	Q96EF6	278 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	TNFRSF13C	Q96RJ3	184 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	ULBP2	Q9BZM5	246 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	NANS	Q9NR45	359 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	MAN2C1	Q9NTJ4	1040 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	DCAF13	Q9NV06	445 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	POFUT2	Q9Y2G5	429 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	SPEF1	Q9Y4P9	236 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	TLN2	Q9Y4G6	2542 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	CSPG4	Q6UVK1	2322 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	CHD3	Q12873	2000 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	CENPBD1	B2RD01	187 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464		J3KTA2	159 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	MGRN1	O60291	552 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	UBL3	O95164	117 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	HPR	P00739	348 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	AHCY	P23526	432 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	YAP1	P46937	504 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	CAPZA2	P47755	286 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	CSNK1A1	P48729	337 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	ST3GAL3	Q11203	375 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	GSG1	Q2KHT4	349 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	MST1L	Q2TV78	715 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	NHLRC1	Q6VVB1	395 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	FKBP9P1	Q75LS8	142 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	SLC46A3	Q7Z3Q1	461 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	PIWIL3	Q7Z3Z3	882 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	DPPA2	Q7Z7J5	298 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	ZNF525	Q8N782	197 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	PFN4	Q8NHR9	129 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	C10orf105	Q8TEF2	133 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	PIMREG	Q9BSJ6	248 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	RAB1B	Q9H0U4	201 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	PLK3	Q9H4B4	646 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	TMEM160	Q9NX00	188 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	STX18	Q9P2W9	335 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	SAMD4A	Q9UPU9	718 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464		A0A096LNT2	108 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	IGHV2OR16-5	A0A0B4J2B6	119 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	LOC390937	A0A1W2PQ73	354 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464		A8MV72	311 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	PIP5K1C	O60331	668 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ABCC3-208	ENST00000506464	UBOX5	O94941	541 aa		10.61	□□□□□ -0.71

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