RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504294.5

SH3BP2-208, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-208ENST00000504294 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 TXNDC15Q96J42 360 aa12.8□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP12.8□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 BDH2Q9BUT1 245 aa12.8□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 EMC6Q9BV81 110 aa12.8□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 CRLF2Q9HC73 371 aa12.8□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 RASSF1Q9NS23 344 aa12.8□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 ARMC1Q9NVT9 282 aa12.8□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 FBXL3Q9UKT7 428 aa12.8□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 SIGLEC7Q9Y286 467 aa12.8□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 NAV2Q8IVL1 2488 aa12.79□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 TRAV27A0A087WT01 109 aa12.79□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 FAM221AA4D161 298 aa12.79□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 CTAG2O75638 210 aa12.79□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 NPR2P20594 1047 aa12.79□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 FASP25445 335 aa12.79□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 CCKARP32238 428 aa12.79□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 GSSP48637 474 aa12.79□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 SEC23BQ15437 767 aa12.79□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 TAB1Q15750 504 aa12.79□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 CEACAM16Q2WEN9 425 aa12.79□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 RFX4Q33E94 735 aa12.79□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 C3orf36Q3SXR2 165 aa12.79□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 CARD17Q5XLA6 110 aa12.79□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 ANKRD34AQ69YU3 496 aa12.79□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 TMEM108Q6UXF1 575 aa12.79□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 ZER1Q7Z7L7 766 aa12.79□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 ADCK1Q86TW2 530 aa12.79□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 WFDC8Q8IUA0 241 aa12.79□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa12.79□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 CLDN22Q8N7P3 220 aa12.79□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa12.79□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 FAM169BQ8N8A8 192 aa12.79□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 NOXO1Q8NFA2 376 aa12.79□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 OR1K1Q8NGR3 316 aa12.79□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 OR13C2Q8NGS9 318 aa12.79□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 MOSPD2Q8NHP6 518 aa12.79□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 GIPC3Q8TF64 312 aa12.79□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 ASB10Q8WXI3 467 aa12.79□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 DGCR6LQ9BY27 220 aa12.79□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 KCNN2Q9H2S1 579 aa12.79□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC17A5Q9NRA2 495 aa12.79□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 BAIAP2Q9UQB8 552 aa12.79□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 AP4S1Q9Y587 144 aa12.79□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa12.78□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 CDC42EP2O14613 210 aa12.78□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 DHHO43323 396 aa12.78□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 KLF4O43474 513 aa12.78□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 TRMUO75648 421 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 PGA4P0DJD7 388 aa12.78□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 PGA3P0DJD8 388 aa12.78□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 ANXA8P13928 327 aa12.78□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 PTAFRP25105 342 aa12.78□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 SDHAP31040 664 aa12.78□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 ACVR1BP36896 505 aa12.78□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 ARMC4Q5T2S8 1044 aa12.78□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 PGBD2Q6P3X8 592 aa12.78□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF627Q7L945 461 aa12.78□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 IL17RDQ8NFM7 739 aa12.78□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 OR4C15Q8NGM1 316 aa12.78□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 FANK1Q8TC84 345 aa12.78□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 WACQ9BTA9 647 aa12.78□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 TEX12Q9BXU0 123 aa12.78□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
SH3BP2-208ENST00000504294 ARPC3O15145 178 aa12.77□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 CD3EP07766 207 aa12.77□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 QDPRP09417 244 aa12.77□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP12.77□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 EDNRAP25101 427 aa12.77□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 NOS3P29474 1203 aa12.77□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 ARF1P84077 181 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 CD47Q08722 323 aa12.77□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 MELKQ14680 651 aa12.77□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 HIST3H3Q16695 136 aa12.77□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 TBRG1Q3YBR2 411 aa12.77□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa12.77□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 DNM1P34Q6PK57 102 aa12.77□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 CD300LDQ6UXZ3 194 aa12.77□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa12.77□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 HIPK1Q86Z02 1210 aa12.77□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 LRRC75AQ8NAA5 344 aa12.77□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 OR10G2Q8NGC3 310 aa12.77□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF570Q96NI8 536 aa12.77□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 FOXB1Q99853 325 aa12.77□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 KCNS3Q9BQ31 491 aa12.77□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 KATNB1Q9BVA0 655 aa12.77□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 OSBPL10Q9BXB5 764 aa12.77□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 NRIP3Q9NQ35 241 aa12.77□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 ENOPH1Q9UHY7 261 aa12.77□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC25A15Q9Y619 301 aa12.77□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 U3KQV3 271 aa12.77□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 PKDREJQ9NTG1 2253 aa12.76□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 UBL3O95164 117 aa12.76□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 TXNDC12O95881 172 aa12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms