RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503501.1

SENP6-212, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 2

Gene SENP6, Length 2,041 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-212ENST00000503501 CSMD3Q7Z407 3707 aa-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 A0A1B0GUS0 222 aa-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 STX7O15400 261 aaKnown RBP-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 CNMDO75829 334 aa-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 H6PDO95479 791 aa-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 IGLV3-25P01717 112 aa-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 HLA-DQB1P01920 261 aa-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 ALDOBP05062 364 aa-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 HEXBP07686 556 aa-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 ZNF688P0C7X2 276 aa-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 P0DMU3 169 aa-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 FAM231AP0DMU4 169 aa-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 FAM231CP0DMU5 169 aa-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 PAICSP22234 425 aaKnown RBP-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 CALCRP30988 508 aa-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 PRDX2P32119 198 aa-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 APLNRP35414 380 aa-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 KRT20P35900 424 aa-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 CSNK1A1P48729 337 aa-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 ZNF138P52744 262 aa-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 CDH4P55283 916 aa-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 NTHL1P78549 312 aa-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 RBP5P82980 135 aa-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 MYBPC1Q00872 1141 aa-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 PARP15Q460N3 678 aa-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 IFI44LQ53G44 452 aa-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 SMUG1Q53HV7 270 aa-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 CARD16Q5EG05 197 aa-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 GORABQ5T7V8 394 aa-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 C12orf60Q5U649 245 aa-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 ZNF470Q6ECI4 717 aa-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 ZFAND6Q6FIF0 208 aa-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 PLBD1Q6P4A8 553 aa-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 TMEM270Q6UE05 265 aa-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 AFTPHQ6ULP2 937 aa-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 FBXW12Q6X9E4 464 aa-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 C16orf62Q7Z3J2 963 aa-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 EFCAB13Q8IY85 973 aa-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 OR5AU1Q8NGC0 362 aa-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 OR9A2Q8NGT5 310 aa-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 OR13G1Q8NGZ3 307 aa-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 COQ8AQ8NI60 647 aa-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 CMTM2Q8TAZ6 248 aa-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 RAPGEF5Q92565 580 aa-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 ELMO2Q96JJ3 720 aa-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 TSSK3Q96PN8 268 aa-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 SLC6A7Q99884 636 aa-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 SMR3AQ99954 134 aa-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 RHOXF2Q9BQY4 288 aa-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 SLC35A5Q9BS91 424 aa-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 GABARAPL3Q9BY60 117 aa-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 SMYD3Q9H7B4 428 aa-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 FN3KRPQ9HA64 309 aa-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 LPAR2Q9HBW0 351 aa-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 ISYNA1Q9NPH2 558 aa-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 GLRX2Q9NS18 164 aa-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 CALYQ9NYX4 217 aa-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 ZNF492Q9P255 531 aa-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 IL20RAQ9UHF4 553 aa-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 RNF6Q9Y252 685 aa-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 AP4B1Q9Y6B7 739 aa-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP-0.22□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 MTORP42345 2549 aa-0.22□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 STRCP1A6NGW2 1772 aa-0.22□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 CLSPNQ9HAW4 1339 aa-0.22□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 REV3LO60673 3130 aa-0.22□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 GBF1Q92538 1859 aa-0.22□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa-0.22□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 DNAH5Q8TE73 4624 aa-0.22□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 TRIP11Q15643 1979 aa-0.22□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa-0.22□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa-0.22□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa-0.22□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 K7EMT4 169 aa-0.22□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP-0.22□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 HCRTO43612 131 aa-0.22□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 CXCL13O43927 109 aa-0.22□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 UGT2B17O75795 530 aa-0.22□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 GABARAPO95166 117 aa-0.22□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP-0.22□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 LGALS2P05162 132 aa-0.22□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 ASGR1P07306 291 aa-0.22□□□□□ -2.44
SENP6-212ENST00000503501 PFN1P07737 140 aaKnown RBP-0.22□□□□□ -2.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms