RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 RAB9AP51151 201 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 TMEM52BQ4KMG9 183 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 C5orf47Q569G3 176 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 SAMD13Q5VXD3 122 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 TMEM236Q5W0B7 351 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 CEACAM20Q6UY09 585 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 BHLHA9Q7RTU4 235 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 CLEC14AQ86T13 490 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 MARCH9Q86YJ5 346 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 OR56A4Q8NGH8 313 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 OR5L2Q8NGL0 311 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 OR13C9Q8NGT0 318 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 UBASH3BQ8TF42 649 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 RXFP2Q8WXD0 754 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 KAT5Q92993 513 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 ASB9Q96DX5 294 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 HRASLS5Q96KN8 279 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 LMLNQ96KR4 655 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 KREMEN1Q96MU8 473 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 FUZQ9BT04 418 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP4.17□□□□□ -1.74
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RABGGTB-213ENST00000496055 NEU3Q9UQ49 428 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 KPTNQ9Y664 436 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 ANK1P16157 1881 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 TMEM200CA6NKL6 621 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 C5orf58C9J3I9 102 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 D6RAR5 112 aa4.17□□□□□ -1.74
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RABGGTB-213ENST00000496055 BHLHE40O14503 412 aa4.17□□□□□ -1.74
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RABGGTB-213ENST00000496055 VAPBO95292 243 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 MPC2O95563 127 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 PNMTP11086 282 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 BMP7P18075 431 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 IL1RNP18510 177 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 EPHA3P29320 983 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 PITPNAQ00169 270 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 MC2RQ01718 297 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 AESQ08117 197 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 ABHD18Q0P651 414 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 NTRK2Q16620 822 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 IFI44LQ53G44 452 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 CYBRD1Q53TN4 286 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 LIPMQ5VYY2 423 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP4.17□□□□□ -1.74
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RABGGTB-213ENST00000496055 C1orf87Q8N0U7 546 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 C17orf78Q8N4C9 275 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 TERB2Q8NHR7 220 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 FAR1Q8WVX9 515 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 AKR1E2Q96JD6 320 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF583Q96ND8 569 aa4.17□□□□□ -1.74
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RABGGTB-213ENST00000496055 LRIT1Q9P2V4 623 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 PHF11Q9UIL8 331 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 FKBPLQ9UIM3 349 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 ZFP30Q9Y2G7 519 aa4.17□□□□□ -1.74
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RABGGTB-213ENST00000496055 CDH23Q9H251 3354 aa4.16□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP4.16□□□□□ -1.74
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RABGGTB-213ENST00000496055 LPLP06858 475 aa4.16□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 AOAHP28039 575 aa4.16□□□□□ -1.74
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RABGGTB-213ENST00000496055 CASRP41180 1078 aa4.16□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 AQP2P41181 271 aa4.16□□□□□ -1.74
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RABGGTB-213ENST00000496055 CRISP1P54107 249 aa4.16□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 CLDN18P56856 261 aa4.16□□□□□ -1.74
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RABGGTB-213ENST00000496055 C2orf80Q0P641 193 aa4.16□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC22A10Q63ZE4 541 aa4.16□□□□□ -1.74
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RABGGTB-213ENST00000496055 SIRT6Q8N6T7 355 aa4.16□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 SCMH1Q96GD3 660 aa4.16□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 FCRL1Q96LA6 429 aa4.16□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 ORAI3Q9BRQ5 295 aa4.16□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 FUNDC2Q9BWH2 189 aa4.16□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 LHPPQ9H008 270 aa4.16□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 PIGVQ9NUD9 493 aa4.16□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP4.16□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa4.16□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 MMP24Q9Y5R2 645 aa4.16□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 LRIT2A6NDA9 550 aa4.16□□□□□ -1.74
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