RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 SLC51BQ86UW2 128 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 LGALS14Q8TCE9 139 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 C2orf72A6NCS6 295 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 TSPAN2O60636 221 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 ARL6IP5O75915 188 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 AKR7A3O95154 331 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 MPC2O95563 127 aa11.65□□□□□ -0.54
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PRAME-213ENST00000492657 ZNF671Q8TAW3 534 aa11.65□□□□□ -0.54
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PRAME-213ENST00000492657 HYLS1Q96M11 299 aa11.65□□□□□ -0.54
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PRAME-213ENST00000492657 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
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PRAME-213ENST00000492657 ABCD3P28288 659 aa11.64□□□□□ -0.55
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PRAME-213ENST00000492657 SLC16A9Q7RTY1 509 aa11.64□□□□□ -0.55
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PRAME-213ENST00000492657 PM20D2Q8IYS1 436 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 TOMM5Q8N4H5 51 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 CHRDQ9H2X0 955 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa11.64□□□□□ -0.55
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PRAME-213ENST00000492657 DUX1O43812 170 aa11.64□□□□□ -0.55
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PRAME-213ENST00000492657 HIST1H2ABP04908 130 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 SLC25A1P53007 311 aa11.64□□□□□ -0.55
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PRAME-213ENST00000492657 IL10RAQ13651 578 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 DPY19L4Q7Z388 723 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 OR6N2Q8NGY6 317 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 ST8SIA2Q92186 375 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 HIST1H2ACQ93077 130 aa11.64□□□□□ -0.55
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PRAME-213ENST00000492657 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 ZNF281Q9Y2X9 895 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 ZNF879B4DU55 563 aa11.64□□□□□ -0.55
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PRAME-213ENST00000492657 MAP2K6P52564 334 aa11.64□□□□□ -0.55
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PRAME-213ENST00000492657 OVCH1Q7RTY7 1134 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 SIAH3Q8IW03 269 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 CMTM4Q8IZR5 234 aa11.64□□□□□ -0.55
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PRAME-213ENST00000492657 DUSP19Q8WTR2 217 aa11.63□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 PIGKQ92643 395 aa11.63□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 MVB12AQ96EY5 273 aa11.63□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 CACNG6Q9BXT2 260 aa11.63□□□□□ -0.55
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PRAME-213ENST00000492657 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa11.63□□□□□ -0.55
PRAME-213ENST00000492657 AUNIPQ9H7T9 357 aa11.63□□□□□ -0.55
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