RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490500.5

RBBP4-213, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, human

TSL 3

Gene RBBP4, Length 632 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBBP4-213	ENST00000490500	FAM157A	C9JC47	383 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500		M0R3H8	397 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	WNT9B	O14905	357 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	ZNF500	O60304	480 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	ERLIN1	O75477	346 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	SERPINI2	O75830	405 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	UBL3	O95164	117 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	RAB36	O95755	333 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	THY1	P04216	161 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	SERPINA5	P05154	406 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	ITGA2	P17301	1181 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	ACHE	P22303	614 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	GPR6	P46095	362 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	CSNK1A1	P48729	337 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	BID	P55957	195 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	TMEM33	P57088	247 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	RPS23	P62266	143 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	MRPS11	P82912	194 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	ZP4	Q12836	540 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	NPTX1	Q15818	432 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	ZNF74	Q16587	644 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	DUSP7	Q16829	419 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	RUNDC3A	Q59EK9	446 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	ZNF613	Q6PF04	617 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	LRFN4	Q6PJG9	635 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	DEF8	Q6ZN54	512 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	PIWIL3	Q7Z3Z3	882 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	RANBP3L	Q86VV4	465 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	C10orf53	Q8N6V4	93 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	GPR32P1	Q8NGA4	272 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	OR6X1	Q8NH79	312 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	CLDND2	Q8NHS1	167 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	YIPF5	Q969M3	257 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	MCHR1	Q99705	422 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	ARHGDIG	Q99819	225 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	TAS2R5	Q9NYW4	299 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	GLTP	Q9NZD2	209 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	NIPSNAP3A	Q9UFN0	247 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	SLC13A4	Q9UKG4	626 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	FBXL3	Q9UKT7	428 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	FZR1	Q9UM11	496 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	CORO2B	Q9UQ03	480 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	EVPLL	A8MZ36	301 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	C11orf98	E9PRG8	122 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500		M0QX08	132 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	CHP2	O43745	196 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	RP2	O75695	350 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	NCR1	O76036	304 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	ADORA3	P0DMS8	318 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	PCMT1	P22061	227 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	ATP4B	P51164	291 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	AGK	Q53H12	422 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	BEND6	Q5SZJ8	279 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	GKAP1	Q5VSY0	366 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	RINL	Q6ZS11	566 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	SLC35D2	Q76EJ3	337 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	TSPYL5	Q86VY4	417 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	MEX3D	Q86XN8	651 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	SLC22A24	Q8N4F4	322 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	OR4D11	Q8NGI4	311 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	OR6T1	Q8NGN1	323 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	ZNF275	Q9NSD4	429 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	TMEM38B	Q9NVV0	291 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	SLC7A8	Q9UHI5	535 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	DUSP13	Q9UII6	198 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	METRN	Q9UJH8	293 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	ANGPT4	Q9Y264	503 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	DHH	O43323	396 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	VENTX	O95231	258 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	CH25H	O95992	272 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	TF	P02787	698 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	OPN1SW	P03999	348 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	OR8G3P	P0DMU2	310 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	GAA	P10253	952 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	SAG	P10523	405 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	NAT2	P11245	290 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	LMO4	P61968	165 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	GALK2	Q01415	458 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	RBBP4	Q09028	425 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	ENTPD8	Q5MY95	495 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	REP15	Q6BDI9	236 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	GLCCI1	Q86VQ1	547 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	RBM45	Q8IUH3	476 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	PAQR4	Q8N4S7	273 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	LRRC17	Q8N6Y2	441 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	C11orf65	Q8NCR3	313 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	TMEM186	Q96B77	213 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	SLC25A44	Q96H78	314 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	SH3GL3	Q99963	347 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	ZNF426	Q9BUY5	554 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	ZNF385D	Q9H6B1	395 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	NARFL	Q9H6Q4	476 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	HIF1AN	Q9NWT6	349 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	TREM2	Q9NZC2	230 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	IGLV3-9	A0A075B6K5	115 aa		10.6	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500		A0A0A6YYJ9	748 aa		10.6	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500		A0A1W2PPW3	197 aa		10.6	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	CPSF4L	A6NMK7	179 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	OR6A2	O95222	327 aa		10.6	□□□□□ -0.71
RBBP4-213	ENST00000490500	MSMB	P08118	114 aa		10.6	□□□□□ -0.71

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