RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487500.2

RPL7-208, Transcript of ribosomal protein L7, human

TSL 1 (best)

Gene RPL7, Length 534 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell body (neuron), Dendrite .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPL7-208	ENST00000487500	RNF133	Q8WVZ7	376 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	TRUB1	Q8WWH5	349 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	RAB40A	Q8WXH6	277 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	DAZL	Q92904	295 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	SMIM10	Q96HG1	83 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	LRR1	Q96L50	414 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	SENP8	Q96LD8	212 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	GPR78	Q96P69	363 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	MCCC1	Q96RQ3	725 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	INPP5K	Q9BT40	448 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	STRADB	Q9C0K7	418 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	WDR41	Q9HAD4	459 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	MEAF6	Q9HAF1	191 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	ZNF556	Q9HAH1	456 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	POLD4	Q9HCU8	107 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	LYRM4	Q9HD34	91 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	APMAP	Q9HDC9	416 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	TMEM138	Q9NPI0	162 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	ALKBH4	Q9NXW9	302 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	USE1	Q9NZ43	259 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	RSL24D1	Q9UHA3	163 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	MRM2	Q9UI43	246 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	NENF	Q9UMX5	172 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	PLXNA2	O75051	1894 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	CELSR2	Q9HCU4	2923 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	KCNE1B	A0A087WTH5	132 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500		A0A1W2PQF6	199 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	FAM90A7P	A6NKC0	464 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	FAM90A22P	A8MWA6	464 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	FAM90A12P	A8MX19	464 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	FAM90A23P	A8MXZ1	464 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	RNASEK-C17orf49	H0YIS7	233 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	SGK494	L7N484	410 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	PSTPIP1	O43586	416 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	UGT2B11	O75310	529 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	CS	O75390	466 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	SLC22A5	O76082	557 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	CTDNEP1	O95476	244 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	GOT2	P00505	430 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	CXCL8	P10145	99 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	SLC2A4	P14672	509 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	ZNF25	P17030	456 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	NELFE	P18615	380 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	CD22	P20273	847 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	BGN	P21810	368 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	PCMT1	P22061	227 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	TNFSF9	P41273	254 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	MAP2K4	P45985	399 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	MTNR1A	P48039	350 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	GABRA4	P48169	554 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	MRPL19	P49406	292 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	BLK	P51451	505 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	ZNF84	P51523	738 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	DNA2	P51530	1060 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	NDST1	P52848	882 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	TAS2R50	P59544	299 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	ZP1	P60852	638 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	COPZ1	P61923	177 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	HERVK_113	P63132	956 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	ZXDB	P98169	803 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	GTF2B	Q00403	316 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	OGDH	Q02218	1023 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	MZT1	Q08AG7	82 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	4.55	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	ANKRD55	Q3KP44	614 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	COX19	Q49B96	90 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	AKIRIN2	Q53H80	203 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	ACSBG2	Q5FVE4	666 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	RNASE10	Q5GAN6	216 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	SLC25A53	Q5H9E4	307 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	ZNF766	Q5HY98	468 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	C9orf64	Q5T6V5	341 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	HES3	Q5TGS1	186 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	C11orf63	Q6NUN7	778 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	SLC27A4	Q6P1M0	643 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	TMPRSS11F	Q6ZWK6	438 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	RRM2B	Q7LG56	351 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	TECPR1	Q7Z6L1	1165 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	ISCA2	Q86U28	154 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	TSPAN33	Q86UF1	283 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	SATL1	Q86VE3	508 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	FUNDC1	Q8IVP5	155 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	APCDD1	Q8J025	514 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	GTPBP8	Q8N3Z3	284 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	RNF148	Q8N7C7	305 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	OR10W1	Q8NGF6	305 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	OR8J3	Q8NGG0	315 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	OR4K15	Q8NH41	348 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	OCC1	Q8TAD7	63 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	LRRC15	Q8TF66	581 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	SFT2D1	Q8WV19	159 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	NRGN	Q92686	78 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	ULK4	Q96C45	1275 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	ZHX1-C8orf76	Q96EF9	292 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	HARBI1	Q96MB7	349 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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