RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 UCHL1P09936 223 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 SBK2P0C263 348 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 CCL3P10147 92 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 SFTPCP11686 197 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 SPI1P17947 270 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 POU3F4P49335 361 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
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PTPRD-211ENST00000486161 ECH1Q13011 328 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 PAQR6Q6TCH4 344 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 FAM198BQ6UWH4 519 aa7.49□□□□□ -1.21
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PTPRD-211ENST00000486161 PXKQ7Z7A4 578 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 SETD6Q8TBK2 473 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 SMIM30A4D0T7 59 aa7.49□□□□□ -1.21
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PTPRD-211ENST00000486161 NKX2-8O15522 239 aa7.49□□□□□ -1.21
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PTPRD-211ENST00000486161 CDC20Q12834 499 aa7.49□□□□□ -1.21
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PTPRD-211ENST00000486161 MADCAM1Q13477 382 aa7.49□□□□□ -1.21
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PTPRD-211ENST00000486161 LIN54Q6MZP7 749 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 C10orf111Q8N326 155 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 FAM109AQ8N4B1 249 aa7.49□□□□□ -1.21
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PTPRD-211ENST00000486161 SIGLEC7Q9Y286 467 aa7.49□□□□□ -1.21
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PTPRD-211ENST00000486161 IGHV3-9P01782 118 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 PIPP12273 146 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
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PTPRD-211ENST00000486161 NPR2P20594 1047 aa7.48□□□□□ -1.21
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PTPRD-211ENST00000486161 MFAP5Q13361 173 aa7.48□□□□□ -1.21
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PTPRD-211ENST00000486161 ACSM3Q53FZ2 586 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 LRRC17Q8N6Y2 441 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 SAMD12Q8N8I0 201 aa7.48□□□□□ -1.21
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PTPRD-211ENST00000486161 ROBO4Q8WZ75 1007 aa7.48□□□□□ -1.21
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PTPRD-211ENST00000486161 TMEM138Q9NPI0 162 aa7.48□□□□□ -1.21
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PTPRD-211ENST00000486161 ABHD16AO95870 558 aa7.48□□□□□ -1.21
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PTPRD-211ENST00000486161 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa7.48□□□□□ -1.21
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PTPRD-211ENST00000486161 FAM57BQ71RH2 274 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM17Q86X19 198 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 COG8Q96MW5 612 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 MRI1Q9BV20 369 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 IL17BQ9UHF5 180 aa7.48□□□□□ -1.21
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