RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485459.5

RABGGTB-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 788 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-210ENST00000485459 BTNL2Q9UIR0 455 aa3.56□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 C3orf18Q9UK00 162 aa3.56□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 PADI2Q9Y2J8 665 aa3.56□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 SLC6A5Q9Y345 797 aa3.56□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 DHRS7Q9Y394 339 aa3.56□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 FIS1Q9Y3D6 152 aa3.56□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 HES2Q9Y543 173 aa3.56□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 NME7Q9Y5B8 376 aa3.56□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 UTRNP46939 3433 aa3.56□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF541Q9H0D2 1346 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 A0A0U1RQK1 487 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 A0A1B0GVI7 797 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF320A2RRD8 509 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 TMEM210A6NLX4 147 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 D6RAR5 112 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 FXYD1O00168 92 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 CLDN4O14493 209 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 PHYHO14832 338 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 LYRM1O43325 122 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 CHP2O43745 196 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 OR10H2O60403 315 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 CBR3O75828 277 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 BEST1O76090 585 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 MBP02144 154 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 APOC2P02655 101 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 C9P02748 559 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 NMBP08949 121 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 SPP1P10451 314 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 ANXA8P13928 327 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 PGAM1P18669 254 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 GPX3P22352 226 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 LHCGRP22888 699 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 PTPN3P26045 913 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 G0S2P27469 103 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 HTR1EP28566 365 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 SHC1P29353 583 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 CCR1P32246 355 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 PTGFRP43088 359 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 MAGEA3P43357 314 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 TGM4P49221 684 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 NAGLUP54802 743 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 OR4D2P58180 307 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 RAB5BP61020 215 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 AP1S1P61966 158 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 OGDHQ02218 1023 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF33AQ06730 810 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF415Q09FC8 603 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 ELP6Q0PNE2 266 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 CDH18Q13634 790 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 SMCO1Q147U7 214 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 IRF4Q15306 451 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 HADHQ16836 314 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 HSDL1Q3SXM5 330 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 VPS26BQ4G0F5 336 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 NHLRC3Q5JS37 347 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 ANXA8L1Q5VT79 327 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 LYSMD4Q5XG99 296 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 TCEAL6Q6IPX3 200 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 SCYL2Q6P3W7 929 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 AFTPHQ6ULP2 937 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 TMEM207Q6UWW9 146 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 C3P1Q6ZMU1 363 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 TPGS1Q6ZTW0 290 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 AHSA2Q719I0 299 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF720Q7Z2F6 126 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 ADGRA1Q86SQ6 560 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 HIPK1Q86Z02 1210 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 FUNDC1Q8IVP5 155 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 LAX1Q8IWV1 398 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 ENTHD1Q8IYW4 607 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 SLC34A3Q8N130 599 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 ZFP82Q8N141 532 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 CAMKVQ8NCB2 501 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 DUSP18Q8NEJ0 188 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 OR9I1Q8NGQ6 314 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 COQ8AQ8NI60 647 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 GLYATL2Q8WU03 294 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 SSMEM1Q8WWF3 244 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 UCN3Q969E3 161 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 NTAN1Q96AB6 310 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 LRRC58Q96CX6 371 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 MCEEQ96PE7 176 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 ACCSQ96QU6 501 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 MAP3K3Q99759 626 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 CPNE1Q99829 537 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 TMEM175Q9BSA9 504 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-210ENST00000485459 MARVELD1Q9BSK0 173 aa3.55□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.1 ms