RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 ACTA1P68133 377 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 TRAM2Q15035 370 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 TGIF1Q15583 401 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 CTRB2Q6GPI1 263 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 CXCL17Q6UXB2 119 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 USP43Q70EL4 1123 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 SPATA24Q86W54 205 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 NEIL2Q969S2 332 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 ISOC2Q96AB3 205 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM131CQ96AQ9 280 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 RARRES2Q99969 163 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 NAT9Q9BTE0 207 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 LRRC61Q9BV99 259 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 HINT2Q9BX68 163 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 PRRG3Q9BZD7 231 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 SELENOIQ9C0D9 397 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 ADAM22Q9P0K1 906 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 LGALS13Q9UHV8 139 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 ING4Q9UNL4 249 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 FANCIQ9NVI1 1328 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 USP27XA6NNY8 438 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 SHISA9B4DS77 424 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 OR8U8P0C7N1 319 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 NTSP30990 170 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 SPAM1P38567 509 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 NBL1P41271 181 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 KLK7P49862 253 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 PAX8Q06710 450 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 BCL2L1Q07817 233 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 ANGPT1Q15389 498 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 TSC22D1Q15714 1073 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 GABRA6Q16445 453 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 VAX1Q5SQQ9 334 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 OLFML2AQ68BL7 652 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 C11orf71Q6IPW1 123 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF613Q6PF04 617 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 ZBED8Q8IZ13 594 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 CADM2Q8N3J6 435 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 PRELID2Q8N945 189 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 TCP10LQ8TDR4 215 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 CACNG8Q8WXS5 425 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 GLT1D1Q96MS3 346 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 OR5B12Q96R08 314 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 HIST1H4GQ99525 98 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 RAB1BQ9H0U4 201 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 SIAEQ9HAT2 523 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 TREM2Q9NZC2 230 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 ADA2Q9NZK5 511 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 STYXL1Q9Y6J8 313 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 RAB19A4D1S5 217 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 A6NIZ1 184 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 CENPXA8MT69 81 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 GPAA1O43292 621 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 HCRTR1O43613 425 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 CLDN11O75508 207 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 PGAM2P15259 253 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 CXCR2P25025 360 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 OR1E1P30953 314 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 AQP2P41181 271 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 KIR2DS4P43632 304 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 ATP5J2P56134 94 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 RAP1BP61224 184 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 CD47Q08722 323 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 ECH1Q13011 328 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 RUNX3Q13761 415 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 VAMP3Q15836 100 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 LRRC36Q1X8D7 754 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 RPEL1Q2QD12 228 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 C2orf66Q6UXQ4 117 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 COPS6Q7L5N1 327 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 SNX20Q7Z614 316 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 HIPK1Q86Z02 1210 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF547Q8IVP9 402 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 Q8N377 158 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 AGAP11Q8TF27 550 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 FGGYQ96C11 551 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC25A38Q96DW6 304 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 TSSK3Q96PN8 268 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 PSMB7Q99436 277 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms