RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473257.1

ACTB-209, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 3

Gene ACTB, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-209ENST00000473257 GALK2Q01415 458 aa9.58□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 NKPD1Q17RQ9 610 aa9.58□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 ULK3Q6PHR2 472 aa9.58□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 LRFN4Q6PJG9 635 aa9.58□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa9.58□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 LSMEM1Q8N8F7 131 aa9.58□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa9.58□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 IL17RDQ8NFM7 739 aa9.58□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 C22orf15Q8WYQ4 148 aa9.58□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 SLC47A1Q96FL8 570 aa9.58□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 VAPAQ9P0L0 249 aa9.58□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 LYPD3O95274 346 aa9.57□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 CH25HO95992 272 aa9.57□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 THY1P04216 161 aa9.57□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 ADORA3P0DMS8 318 aa9.57□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 ETS2P15036 469 aa9.57□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 EPHA1P21709 976 aa9.57□□□□□ -0.88
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ACTB-209ENST00000473257 PAX7P23759 505 aa9.57□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 EVX1P49640 407 aa9.57□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 NCALDP61601 193 aa9.57□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 MYBPC1Q00872 1141 aa9.57□□□□□ -0.88
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ACTB-209ENST00000473257 TMEM255AQ5JRV8 349 aa9.57□□□□□ -0.88
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ACTB-209ENST00000473257 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa9.57□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 ZNF627Q7L945 461 aa9.57□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 CCDC36Q8IYA8 594 aa9.57□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 KIRREL3Q8IZU9 778 aa9.57□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 SLC22A24Q8N4F4 322 aa9.57□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa9.57□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 OR4D11Q8NGI4 311 aa9.57□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 OR51F2Q8NH61 342 aa9.57□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 TMEM54Q969K7 222 aa9.57□□□□□ -0.88
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ACTB-209ENST00000473257 SLC6A7Q99884 636 aa9.57□□□□□ -0.88
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ACTB-209ENST00000473257 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa9.57□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 MS4A5Q9H3V2 200 aa9.57□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 ZNF665Q9H7R5 613 aa9.57□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 C12orf10Q9HB07 376 aa9.57□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 TMEM27Q9HBJ8 222 aa9.57□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa9.57□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 ESM1Q9NQ30 184 aa9.57□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 GLTPQ9NZD2 209 aa9.57□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa9.57□□□□□ -0.88
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ACTB-209ENST00000473257 MPZL1O95297 269 aa9.56□□□□□ -0.88
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ACTB-209ENST00000473257 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 FADDQ13158 208 aa9.56□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 SELPLGQ14242 412 aa9.56□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 TSTQ16762 297 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 SPRNQ5BIV9 151 aa9.56□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 SPATA46Q5T0L3 261 aa9.56□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 FAM91A1Q658Y4 838 aa9.56□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 EPGNQ6UW88 154 aa9.56□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 SLC35D2Q76EJ3 337 aa9.56□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 ARMC8Q8IUR7 673 aa9.56□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 C3orf56Q8N813 242 aa9.56□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 SCAIQ8N9R8 606 aa9.56□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 SLC30A7Q8NEW0 376 aa9.56□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 GPR32P1Q8NGA4 272 aa9.56□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 OR4K5Q8NGD3 323 aa9.56□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP9.56□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 SLC35B4Q969S0 331 aa9.56□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 MCHR1Q99705 422 aa9.56□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa9.56□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 SLC52A3Q9NQ40 469 aa9.56□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 G6PC2Q9NQR9 355 aa9.56□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 TAS2R5Q9NYW4 299 aa9.56□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 SELENONQ9NZV5 590 aa9.56□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 CCDC167Q9P0B6 97 aa9.56□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 PCDHB10Q9UN67 800 aa9.56□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 CORINQ9Y5Q5 1042 aa9.56□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 USH1CQ9Y6N9 552 aa9.56□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa9.55□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 C17orf100A8MU93 164 aa9.55□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 SLCO1B7G3V0H7 640 aa9.55□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 UBL3O95164 117 aa9.55□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 PNPP00491 289 aa9.55□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 TFP02787 698 aa9.55□□□□□ -0.88
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