RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440825.6

FAAP20-210, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3

Gene FAAP20, Length 855 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-210ENST00000440825 A0A1W2PRG6 482 aa24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 IGKV3-15P01624 115 aa24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 IGLV1-44P01699 117 aa24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 THRBP10828 461 aa24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 AQP2P41181 271 aa24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 CLRN1P58418 232 aa24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 TMEM54Q969K7 222 aa24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 FNDC11Q9BVV2 318 aa24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 CA10Q9NS85 328 aa24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP24.09■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 NDUFAB1O14561 156 aa24.09■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 HEXAP06865 529 aa24.09■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 BMP4P12644 408 aa24.09■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 ARR3P36575 388 aa24.09■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 C3orf36Q3SXR2 165 aa24.09■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 IFI44LQ53G44 452 aa24.09■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 CBLL1Q75N03 491 aa24.09■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 HSH2DQ96JZ2 352 aa24.09■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 INIPQ9NRY2 104 aa24.09■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 ADA2Q9NZK5 511 aa24.09■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 EGFL7Q9UHF1 273 aa24.09■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa24.09■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 IFI30P13284 250 aa24.08■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 FUT4P22083 530 aa24.08■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 PRDX6P30041 224 aa24.08■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 GSG1Q2KHT4 349 aa24.08■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 FAM169BQ8N8A8 192 aa24.08■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 SYT14Q8NB59 555 aa24.08■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 MOSPD2Q8NHP6 518 aa24.08■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 NOX3Q9HBY0 568 aa24.08■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 IGHG1P01857 330 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-210ENST00000440825 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-210ENST00000440825 MYBPC1Q00872 1141 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-210ENST00000440825 RNF148Q8N7C7 305 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-210ENST00000440825 OR4F15Q8NGB8 312 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-210ENST00000440825 BPIFA2Q96DR5 249 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-210ENST00000440825 MS4A3Q96HJ5 214 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-210ENST00000440825 REG4Q9BYZ8 158 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-210ENST00000440825 SPAG4Q9NPE6 437 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-210ENST00000440825 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-210ENST00000440825 RAB36O95755 333 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-210ENST00000440825 QDPRP09417 244 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-210ENST00000440825 OR4A8P0C604 315 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-210ENST00000440825 PGA4P0DJD7 388 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-210ENST00000440825 PGA3P0DJD8 388 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-210ENST00000440825 SERPINF1P36955 418 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-210ENST00000440825 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-210ENST00000440825 LAPTM4AQ15012 233 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-210ENST00000440825 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-210ENST00000440825 ZNF347Q96SE7 839 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-210ENST00000440825 ABCD2Q9UBJ2 740 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-210ENST00000440825 PATE4P0C8F1 98 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-210ENST00000440825 SAGP10523 405 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-210ENST00000440825 GIPRP48546 466 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-210ENST00000440825 DAP3P51398 398 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-210ENST00000440825 RUNX1T1Q06455 604 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-210ENST00000440825 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-210ENST00000440825 TRAM2Q15035 370 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-210ENST00000440825 KRT80Q6KB66 452 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-210ENST00000440825 LRFN4Q6PJG9 635 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-210ENST00000440825 CLEC2AQ6UVW9 174 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-210ENST00000440825 NRMQ8IXM6 262 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-210ENST00000440825 OFCC1Q8IZS5 231 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-210ENST00000440825 ASB10Q8WXI3 467 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-210ENST00000440825 RHNO1Q9BSD3 238 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-210ENST00000440825 B3GNT2Q9NY97 397 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-210ENST00000440825 H7C417 338 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-210ENST00000440825 DHHO43323 396 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-210ENST00000440825 GMNNO75496 209 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-210ENST00000440825 IGF2P01344 180 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-210ENST00000440825 RAB1AP62820 205 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-210ENST00000440825 HGFACQ04756 655 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-210ENST00000440825 ADIPOQQ15848 244 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-210ENST00000440825 MST1LQ2TV78 715 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-210ENST00000440825 ZNF730Q6ZMV8 503 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-210ENST00000440825 ZNF627Q7L945 461 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-210ENST00000440825 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-210ENST00000440825 SKA3Q8IX90 412 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-210ENST00000440825 SLC22A24Q8N4F4 322 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-210ENST00000440825 NOXO1Q8NFA2 376 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-210ENST00000440825 SH3GL3Q99963 347 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-210ENST00000440825 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-210ENST00000440825 RPS6KA6Q9UK32 745 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-210ENST00000440825 FFAR1O14842 300 aa24.03■■□□□ 1.44
FAAP20-210ENST00000440825 LY6HO94772 140 aa24.03■■□□□ 1.44
FAAP20-210ENST00000440825 UBL3O95164 117 aa24.03■■□□□ 1.44
FAAP20-210ENST00000440825 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
FAAP20-210ENST00000440825 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
FAAP20-210ENST00000440825 MAKP20794 623 aa24.03■■□□□ 1.44
FAAP20-210ENST00000440825 THBS4P35443 961 aa24.03■■□□□ 1.44
FAAP20-210ENST00000440825 DAG1Q14118 895 aa24.03■■□□□ 1.44
FAAP20-210ENST00000440825 SWI5Q1ZZU3 235 aa24.03■■□□□ 1.44
FAAP20-210ENST00000440825 ALG10Q5BKT4 473 aa24.03■■□□□ 1.44
FAAP20-210ENST00000440825 GLYATQ6IB77 296 aa24.03■■□□□ 1.44
FAAP20-210ENST00000440825 HDDC2Q7Z4H3 204 aa24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms