RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437028.5

SNHG11-208, Transcript of small nucleolar RNA host gene 11, human

TSL 3

Gene SNHG11, Length 1,169 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG11-208	ENST00000437028	NR4A2	P43354	598 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	RGS8	P57771	180 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	ROR2	Q01974	943 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	NAAA	Q02083	359 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	EFNB3	Q15768	340 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	NPTX1	Q15818	432 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	CARTPT	Q16568	116 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	MTX3	Q5HYI7	312 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	EPHX4	Q8IUS5	362 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	OR4D11	Q8NGI4	311 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	VANGL1	Q8TAA9	524 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	BCL2L2	Q92843	193 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	UTP4	Q969X6	686 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	SLC25A36	Q96CQ1	311 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	SORCS2	Q96PQ0	1159 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	PRR14	Q9BWN1	585 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	C12orf10	Q9HB07	376 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	DCAF13	Q9NV06	445 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	SH3GLB1	Q9Y371	365 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	LOC100289279	A0A1B0GTE1	492 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	ACOT8	O14734	319 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	TPST2	O60704	377 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	SLC43A1	O75387	559 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	UPK3A	O75631	287 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	C8B	P07358	591 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	OR4A8	P0C604	315 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	CECR9	P0C854	216 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	PNMT	P11086	282 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	RPS5	P46782	204 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	PPOX	P50336	477 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	CLDN17	P56750	224 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	C1D	Q13901	141 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	IQCC	Q4KMZ1	466 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	IFI44L	Q53G44	452 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	VHLL	Q6RSH7	139 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	VTCN1	Q7Z7D3	282 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	CCDC36	Q8IYA8	594 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	GPR137C	Q8N3F9	429 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	NUP37	Q8NFH4	326 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	RSRC1	Q96IZ7	334 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	HSH2D	Q96JZ2	352 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	PLK3	Q9H4B4	646 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	ZNF442	Q9H7R0	627 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	ARFGEF3	Q5TH69	2177 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028		A0A096LPE4	126 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028		A0A1W2PPZ6	126 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	FTCDNL1	E5RQL4	147 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	RPL36A-HNRNPH2	H7BZ11	118 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	IGKV3-15	P01624	115 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	IGLV1-44	P01699	117 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	TNFRSF1B	P20333	461 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	ARR3	P36575	388 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	ERF	P50548	548 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	IDH3G	P51553	393 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	LGALS3BP	Q08380	585 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	ADIPOQ	Q15848	244 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	RANBP3L	Q86VV4	465 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	CARM1	Q86X55	608 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	PIK3C3	Q8NEB9	887 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	IL17RD	Q8NFM7	739 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	GEMIN6	Q8WXD5	167 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	POP5	Q969H6	163 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	SLC38A4	Q969I6	547 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	PYURF	Q96I23	114 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	OXGR1	Q96P68	337 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	SEPHS2	Q99611	448 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	ARHGDIG	Q99819	225 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	EVA1A	Q9H8M9	152 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	CHODL	Q9H9P2	273 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	SELENON	Q9NZV5	590 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SNHG11-208	ENST00000437028	IGKV1D-42	A0A075B6H8	117 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SNHG11-208	ENST00000437028		A0A1B0GWA3	101 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SNHG11-208	ENST00000437028	AQP12B	A6NM10	295 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SNHG11-208	ENST00000437028	CBR1	P16152	277 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SNHG11-208	ENST00000437028	OR1E2	P47887	323 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SNHG11-208	ENST00000437028	IL1RL1	Q01638	556 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SNHG11-208	ENST00000437028	MFSD13A	Q14CX5	517 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SNHG11-208	ENST00000437028	FAM98B	Q52LJ0	330 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
SNHG11-208	ENST00000437028	FAM69A	Q5T7M9	428 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SNHG11-208	ENST00000437028	DEF8	Q6ZN54	512 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SNHG11-208	ENST00000437028	LINGO2	Q7L985	606 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SNHG11-208	ENST00000437028	RBM45	Q8IUH3	476 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
SNHG11-208	ENST00000437028	AQP12A	Q8IXF9	295 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SNHG11-208	ENST00000437028	DNAJA4	Q8WW22	397 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
SNHG11-208	ENST00000437028	NEU4	Q8WWR8	484 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
SNHG11-208	ENST00000437028	SLC47A1	Q96FL8	570 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SNHG11-208	ENST00000437028	FOXN4	Q96NZ1	517 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SNHG11-208	ENST00000437028	PTDSS2	Q9BVG9	487 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SNHG11-208	ENST00000437028	TES	Q9UGI8	421 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
SNHG11-208	ENST00000437028	TCRBV5S2	A0A599	114 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SNHG11-208	ENST00000437028	hCG_2039718	K7EN88	272 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SNHG11-208	ENST00000437028	ZNF432	O94892	652 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SNHG11-208	ENST00000437028	IFNW1	P05000	195 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SNHG11-208	ENST00000437028	ZNF23	P17027	643 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SNHG11-208	ENST00000437028	NPR2	P20594	1047 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SNHG11-208	ENST00000437028	IGFBP5	P24593	272 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SNHG11-208	ENST00000437028	TUBA1B	P68363	451 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SNHG11-208	ENST00000437028	TUBA4A	P68366	448 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SNHG11-208	ENST00000437028	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
SNHG11-208	ENST00000437028	EGR4	Q05215	589 aa		13.38	□□□□□ -0.27

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