RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000432547.7

TTR-202, Transcript of transthyretin, humanhuman

TSL 2

Gene TTR, Length 745 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTR-202ENST00000432547 PIGTQ969N2 578 aa5.66□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 PIK3IP1Q96FE7 263 aa5.66□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 ADGRG7Q96K78 797 aa5.66□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 ATP6V0BQ99437 205 aa5.66□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 SMR3AQ99954 134 aa5.66□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 PIGQQ9BRB3 760 aa5.66□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 SLC39A3Q9BRY0 314 aa5.66□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 MED18Q9BUE0 208 aa5.66□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 CCDC28BQ9BUN5 200 aa5.66□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 HHATLQ9HCP6 504 aa5.66□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 UBQLN4Q9NRR5 601 aa5.66□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa5.66□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 KLHL28Q9NXS3 571 aa5.66□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 ZNF226Q9NYT6 803 aa5.66□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 CCDC167Q9P0B6 97 aa5.66□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 DNAJB11Q9UBS4 358 aa5.66□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 MKLN1Q9UL63 735 aa5.66□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 USP22Q9UPT9 525 aa5.66□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 VDAC3Q9Y277 283 aa5.66□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa5.66□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 A0A087WZY1 265 aa5.65□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 A0A0G2JND7 137 aa5.65□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 A0A1W2PQD3 144 aa5.65□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 A4D1N5 150 aa5.65□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 AGAP5A6NIR3 686 aa5.65□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 CLDN24A6NM45 220 aa5.65□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 C16orf97H3BN30 126 aa5.65□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 NR5A2O00482 541 aa5.65□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 RFXANKO14593 260 aa5.65□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 CTDSP2O14595 271 aa5.65□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 ARHGEF9O43307 516 aa5.65□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 KIAA0513O60268 411 aa5.65□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 UGT2B17O75795 530 aa5.65□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 SEC14L2O76054 403 aa5.65□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 AQP8O94778 261 aa5.65□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 PRSS23O95084 383 aa5.65□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 HEXAP06865 529 aa5.65□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 CHRM4P08173 479 aa5.65□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 KRT16P08779 473 aa5.65□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 ETFAP13804 333 aa5.65□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 ATP6V1C1P21283 382 aa5.65□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 PTAFRP25105 342 aa5.65□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 LCN1P31025 176 aa5.65□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 KHKP50053 298 aa5.65□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 ATP12AP54707 1039 aa5.65□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 SIRPAP78324 504 aa5.65□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 SQLEQ14534 574 aa5.65□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 ACKR1Q16570 336 aa5.65□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 SGCBQ16585 318 aa5.65□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 PLPPR5Q32ZL2 321 aa5.65□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 TBRG1Q3YBR2 411 aa5.65□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 AGKQ53H12 422 aa5.65□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 PAGE3Q5JUK9 113 aa5.65□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 Q5PR19 223 aa5.65□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 PDZK1Q5T2W1 519 aa5.65□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 KRT80Q6KB66 452 aa5.65□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 BHLHB9Q6PI77 547 aa5.65□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 PRSS57Q6UWY2 283 aa5.65□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 FRRS1Q6ZNA5 592 aa5.65□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 ZNF550Q7Z398 422 aa5.65□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 C16orf62Q7Z3J2 963 aa5.65□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 MSRB3Q8IXL7 192 aa5.65□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 C10orf111Q8N326 155 aa5.65□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 C10orf53Q8N6V4 93 aa5.65□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 ZNF614Q8N883 585 aa5.65□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 ANKFN1Q8N957 763 aa5.65□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 ZNF540Q8NDQ6 660 aa5.65□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 POC1BQ8TC44 478 aa5.65□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 XAGE5Q8WWM1 108 aa5.65□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 IGFBPL1Q8WX77 278 aa5.65□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 GTF2H4Q92759 462 aa5.65□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 ROPN1LQ96C74 230 aa5.65□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 SPDL1Q96EA4 605 aa5.65□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 ITCHQ96J02 903 aa5.65□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 ZNF350Q9GZX5 532 aa5.65□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 SLC38A1Q9H2H9 487 aa5.65□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP5.65□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 MED17Q9NVC6 651 aa5.65□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa5.65□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 PROCRQ9UNN8 238 aa5.65□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 CARD8Q9Y2G2 431 aa5.65□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 POMT1Q9Y6A1 747 aa5.65□□□□□ -1.5
TTR-202ENST00000432547 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa5.65□□□□□ -1.51
TTR-202ENST00000432547 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa5.64□□□□□ -1.51
TTR-202ENST00000432547 TRAV34A0A0B4J273 112 aa5.64□□□□□ -1.51
TTR-202ENST00000432547 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
TTR-202ENST00000432547 DUXAA6NLW8 204 aa5.64□□□□□ -1.51
TTR-202ENST00000432547 TEX22C9J3V5 150 aa5.64□□□□□ -1.51
TTR-202ENST00000432547 LDLRAD4O15165 306 aa5.64□□□□□ -1.51
TTR-202ENST00000432547 ADAMDEC1O15204 470 aa5.64□□□□□ -1.51
TTR-202ENST00000432547 EFNA2O43921 213 aa5.64□□□□□ -1.51
TTR-202ENST00000432547 SMPD2O60906 423 aa5.64□□□□□ -1.51
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