RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 B3GALT4O96024 378 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 BMP1P13497 986 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 GABRR1P24046 479 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 GPR18Q14330 331 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 SOHLH1Q5JUK2 328 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 AADACL3Q5VUY0 350 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 SLC35D2Q76EJ3 337 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 SSX9Q7RTT3 188 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 BAGE3Q86Y29 109 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 BAGE2Q86Y30 109 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 TARM1B6A8C7 271 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 OMGP23515 440 aa8.2□□□□□ -1.1
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PTPRM-202ENST00000400053 KCNJ10P78508 379 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 TNFRSF17Q02223 184 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 ASAH1Q13510 395 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 XKR7Q5GH72 579 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 H3F3CQ6NXT2 135 aa8.2□□□□□ -1.1
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PTPRM-202ENST00000400053 MMP21Q8N119 569 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 FAM58AQ8N1B3 248 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 L3MBTL4Q8NA19 623 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 LFNGQ8NES3 379 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 DTD2Q96FN9 168 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 GINS3Q9BRX5 216 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 C20orf85Q9H1P6 137 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 ARV1Q9H2C2 271 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 NRIP3Q9NQ35 241 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 B3GAT1Q9P2W7 334 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 CAMK2AQ9UQM7 478 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM221A6NGB7 291 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 C4orf47A7E2U8 309 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 M0QYG6 137 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 C1orf105O95561 183 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 ATP1B1P05026 303 aa8.2□□□□□ -1.1
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PTPRM-202ENST00000400053 H7C1C5 153 aa8.2□□□□□ -1.1
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PTPRM-202ENST00000400053 DMWDQ09019 674 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 CAMK2BQ13554 666 aa8.2□□□□□ -1.1
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PTPRM-202ENST00000400053 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
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PTPRM-202ENST00000400053 KCNG3Q8TAE7 436 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 PHYHIPQ92561 330 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 LURAP1Q96LR2 239 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM59Q9BXS4 323 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 AKIP1Q9NQ31 210 aa8.2□□□□□ -1.1
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PTPRM-202ENST00000400053 STARD5Q9NSY2 213 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa8.2□□□□□ -1.1
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PTPRM-202ENST00000400053 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 C1SP09871 688 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 SBK3P0C264 359 aa8.19□□□□□ -1.1
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PTPRM-202ENST00000400053 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 SAXO2Q658L1 398 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF321PQ8N8H1 164 aa8.19□□□□□ -1.1
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