RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 AMD1P17707 334 aa6.21□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 STOMP27105 288 aa6.21□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 SSTR4P31391 388 aa6.21□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 ACVR1BP36896 505 aa6.21□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 MFAP4P55083 255 aa6.21□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 CD81P60033 236 aa6.21□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 HGFACQ04756 655 aa6.21□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 RAB32Q13637 225 aa6.21□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 TPBGQ13641 420 aa6.21□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 TNXAQ16473 311 aa6.21□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 FIGNL1Q6PIW4 674 aa6.21□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC34A3Q8N130 599 aa6.21□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 LYPD6BQ8NI32 183 aa6.21□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 PYCR2Q96C36 320 aa6.21□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 NPY6RQ99463 290 aa6.21□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 TIMM29Q9BSF4 260 aa6.21□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 WWTR1Q9GZV5 400 aa6.21□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 LAT2Q9GZY6 243 aa6.21□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 PPDPFQ9H3Y8 114 aa6.21□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 PLAC1Q9HBJ0 212 aa6.21□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 SEC14L6B5MCN3 397 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 E9PQ18 207 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 COL1A2P08123 1366 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 BPIP17213 487 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 DPP4P27487 766 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 S100GP29377 79 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 SERPINA4P29622 427 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 P2RY2P41231 377 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 LBX1P52954 281 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 DUSP2Q05923 314 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 GINS1Q14691 196 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 RAB35Q15286 201 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 SPATA46Q5T0L3 261 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF585AQ6P3V2 769 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM71Q6P5X7 295 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 Q6ZNB5 142 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 HIST3H2BBQ8N257 126 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 OR2M7Q8NG81 312 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 NODALQ96S42 347 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM43Q9BTV4 400 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 LYRM4Q9HD34 91 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 PXMP2Q9NR77 195 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 OR5H15A6NDH6 313 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 OR5H1A6NKK0 313 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 LAMTOR5O43504 91 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 PRAMEF10O60809 474 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 SC5DO75845 299 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 SERPINE1P05121 402 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM157BP0CG42 384 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 AZU1P20160 251 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 FPR1P21462 350 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 SDHBP21912 280 aa6.21□□□□□ -1.42
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RABGEF1-202ENST00000380828 PCK2Q16822 640 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM201Q5SNT2 666 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM219BQ5XKK7 198 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM198BQ6UWH4 519 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 ADIPOR2Q86V24 386 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 BCORP1Q8N888 145 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 C15orf54Q8N8G6 183 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 OR13C8Q8NGS7 320 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 OR10X1Q8NGY0 326 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 OR51A7Q8NH64 312 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM239Q8WW34 195 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM19Q96HH6 336 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 SMIM8Q96KF7 97 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC35G5Q96KT7 338 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 TPT1P8Q9HAU6 139 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 GKN1Q9NS71 199 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 UBE2QL1A1L167 161 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 ADM5C9JUS6 153 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 CORTO00230 105 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC35E2BP0CK96 405 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC35E2P0CK97 266 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 AKR1C4P17516 323 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 CEBPBP17676 345 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 RAB5AP20339 215 aa6.2□□□□□ -1.42
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RABGEF1-202ENST00000380828 FPR2P25090 351 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 SDC4P31431 198 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 FRKP42685 505 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 PITPNAQ00169 270 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 HLA-BQ31612 363 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 NHLRC1Q6VVB1 395 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 PROSER1Q86XN7 944 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM185AQ8NFB2 350 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 OR4P4Q8NGL7 312 aa6.2□□□□□ -1.42
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