RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366686.1

CCSAP-202, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCSAP, Length 4,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-202ENST00000366686 OR1C1Q15619 314 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF77Q15935 545 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 SLC5A12Q1EHB4 618 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 OR2B11Q5JQS5 317 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 PPM1LQ5SGD2 360 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 FAM46CQ5VWP2 391 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 RAB43Q86YS6 212 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 RNF149Q8NC42 400 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 BPIFCQ8NFQ6 507 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 KCNG3Q8TAE7 436 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ARRDC2Q8TBH0 407 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 NPRL2Q8WTW4 380 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM125Q96AQ2 219 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 MBOAT7Q96N66 472 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 DUX5Q96PT3 197 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 TPSD1Q9BZJ3 242 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 MAP6D1Q9H9H5 199 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 GALNT9Q9HCQ5 603 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 TREM1Q9NP99 234 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 CTPS2Q9NRF8 586 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 B3GAT1Q9P2W7 334 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 LHX3Q9UBR4 397 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 GMPPBQ9Y5P6 360 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ETV7Q9Y603 341 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa2.22□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP2.21□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 EFCAB9A8MZ26 197 aa2.21□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa2.21□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 NR5A2O00482 541 aa2.21□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 LAD1O00515 517 aa2.21□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 SLC28A2O43868 658 aa2.21□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 EFNA2O43921 213 aa2.21□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 KIAA0513O60268 411 aa2.21□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 TRAPPC6AO75865 159 aa2.21□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP2.21□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 LATS1O95835 1130 aa2.21□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 NUDT14O95848 222 aa2.21□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 GLUD1P00367 558 aa2.21□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP2.21□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 GLAP06280 429 aa2.21□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ALOX5P09917 674 aa2.21□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 DPEP1P16444 411 aa2.21□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 AMD1P17707 334 aa2.21□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ENGP17813 658 aa2.21□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 PI3P19957 117 aa2.21□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 FOLR3P41439 243 aa2.21□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 AKR1C2P52895 323 aa2.21□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 CACNG7P62955 275 aa2.21□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 CDK16Q00536 496 aa2.21□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 AKR1C1Q04828 323 aa2.21□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 FOXM1Q08050 763 aa2.21□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 UBE2V1Q13404 147 aa2.21□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 GRM7Q14831 915 aa2.21□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 KYAT1Q16773 422 aa2.21□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa2.21□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 LCN1P1Q5VSP4 162 aa2.21□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 C9orf135Q5VTT2 229 aa2.21□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 PRSS57Q6UWY2 283 aa2.21□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa2.21□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 Q6ZRM9 215 aa2.21□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 COX8CQ7Z4L0 72 aa2.21□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 AKAP14Q86UN6 197 aa2.21□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 VRK2Q86Y07 508 aa2.21□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 XAGE5Q8WWM1 108 aa2.21□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 SCRN2Q96FV2 425 aa2.21□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 VSTM2LQ96N03 204 aa2.21□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 SLC30A2Q9BRI3 323 aa2.21□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ALG9Q9H6U8 611 aa2.21□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP2.21□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 PCDH9Q9HC56 1237 aa2.21□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF225Q9UK10 706 aa2.21□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 PILRAQ9UKJ1 303 aa2.21□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP2.21□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 PLXNA2O75051 1894 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 NCANO14594 1321 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 CLUHO75153 1309 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 A0A0G2JMP0 313 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 P2RX6O15547 441 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 VAPBO95292 243 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 SYNGR4O95473 234 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 F10P00742 488 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 HOXB7P09629 217 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 SMIM18P0DKX4 95 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 OGNP20774 298 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 BGNP21810 368 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 AKR1C3P42330 323 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 THBS3P49746 956 aa2.21□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms