RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366662.8

TTC13-202, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 13, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC13, Length 3,112 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC13-202ENST00000366662 MPZL1O95297 269 aa15.48■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 ASAH2BP0C7U1 165 aa15.48■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 HLA-DOBP13765 273 aa15.48■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 ZBTB37Q5TC79 503 aa15.48■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 TIGD3Q6B0B8 471 aa15.48■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 OGFOD3Q6PK18 319 aa15.48■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 LRRN1Q6UXK5 716 aa15.48■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 CMIPQ8IY22 773 aa15.48■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 LRRC75AQ8NAA5 344 aa15.48■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 FAM71CQ8NEG0 241 aa15.48■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 WWTR1Q9GZV5 400 aa15.48■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 LIN7BQ9HAP6 207 aa15.48■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 ING3Q9NXR8 418 aa15.48■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 HIF3AQ9Y2N7 669 aa15.48■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 URB1O60287 2271 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 ARPC3O15145 178 aa15.47■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 SLC22A5O76082 557 aa15.47■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 ARSBP15848 533 aa15.47■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 CFL1P23528 166 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 GIFP27352 417 aa15.47■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 SIAH3Q8IW03 269 aa15.47■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 CMTM4Q8IZR5 234 aa15.47■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 POMGNT2Q8NAT1 580 aa15.47■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 PRDM6Q9NQX0 595 aa15.47■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 FRRS1LQ9P0K9 344 aa15.47■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 DUX1O43812 170 aa15.47■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 WNT11O96014 354 aa15.47■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 FBXW4P57775 412 aa15.47■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 NTRK2Q16620 822 aa15.47■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 CCDC74AQ96AQ1 378 aa15.47■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 MS4A3Q96HJ5 214 aa15.47■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa15.47■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 TAS2R5Q9NYW4 299 aa15.47■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa15.46■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 LINC00862A6NCI5 91 aa15.46■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 SDHAP31040 664 aa15.46■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 ACTA2P62736 377 aa15.46■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 ACTG2P63267 376 aa15.46■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 PLXDC1Q8IUK5 500 aa15.46■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 ACOT12Q8WYK0 555 aa15.46■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 LAMP5Q9UJQ1 280 aa15.46■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 HRH3Q9Y5N1 445 aa15.46■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 FRG2CA6NGY1 282 aa15.46■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 HLA-DQB1P01920 261 aa15.46■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 PNMTP11086 282 aa15.46■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 BTCP35070 178 aa15.46■□□□□ 0.07
TTC13-202ENST00000366662 SLC25A12O75746 678 aa15.46■□□□□ 0.06
TTC13-202ENST00000366662 SLC36A2Q495M3 483 aa15.46■□□□□ 0.06
TTC13-202ENST00000366662 GUSBP11Q6P575 273 aa15.46■□□□□ 0.06
TTC13-202ENST00000366662 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.06
TTC13-202ENST00000366662 LINGO2Q7L985 606 aa15.46■□□□□ 0.06
TTC13-202ENST00000366662 WDFY1Q8IWB7 410 aa15.46■□□□□ 0.06
TTC13-202ENST00000366662 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.06
TTC13-202ENST00000366662 STT3BQ8TCJ2 826 aa15.46■□□□□ 0.06
TTC13-202ENST00000366662 A0A0A6YYJ9 748 aa15.45■□□□□ 0.06
TTC13-202ENST00000366662 BET1O15155 118 aa15.45■□□□□ 0.06
TTC13-202ENST00000366662 SLC43A1O75387 559 aa15.45■□□□□ 0.06
TTC13-202ENST00000366662 UCHL1P09936 223 aa15.45■□□□□ 0.06
TTC13-202ENST00000366662 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
TTC13-202ENST00000366662 FOXK1P85037 733 aa15.45■□□□□ 0.06
TTC13-202ENST00000366662 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
TTC13-202ENST00000366662 SLC6A19Q695T7 634 aa15.45■□□□□ 0.06
TTC13-202ENST00000366662 OR5M1Q8NGP8 315 aa15.45■□□□□ 0.06
TTC13-202ENST00000366662 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa15.45■□□□□ 0.06
TTC13-202ENST00000366662 PHF21AQ96BD5 680 aa15.45■□□□□ 0.06
TTC13-202ENST00000366662 APMAPQ9HDC9 416 aa15.45■□□□□ 0.06
TTC13-202ENST00000366662 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa15.45■□□□□ 0.06
TTC13-202ENST00000366662 COPS7AQ9UBW8 275 aa15.45■□□□□ 0.06
TTC13-202ENST00000366662 FLVCR2Q9UPI3 526 aa15.45■□□□□ 0.06
TTC13-202ENST00000366662 SLC22A13Q9Y226 551 aa15.45■□□□□ 0.06
TTC13-202ENST00000366662 NCOR1O75376 2440 aa15.45■□□□□ 0.06
TTC13-202ENST00000366662 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa15.45■□□□□ 0.06
TTC13-202ENST00000366662 ZNF879B4DU55 563 aa15.45■□□□□ 0.06
TTC13-202ENST00000366662 CLDN20P56880 219 aa15.45■□□□□ 0.06
TTC13-202ENST00000366662 POU4F3Q15319 338 aa15.45■□□□□ 0.06
TTC13-202ENST00000366662 TPRA1Q86W33 373 aa15.45■□□□□ 0.06
TTC13-202ENST00000366662 TIGD4Q8IY51 512 aa15.45■□□□□ 0.06
TTC13-202ENST00000366662 TOMM5Q8N4H5 51 aa15.45■□□□□ 0.06
TTC13-202ENST00000366662 YIPF5Q969M3 257 aa15.45■□□□□ 0.06
TTC13-202ENST00000366662 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
TTC13-202ENST00000366662 ARL5BQ96KC2 179 aa15.45■□□□□ 0.06
TTC13-202ENST00000366662 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
TTC13-202ENST00000366662 TMEM185BQ9H7F4 350 aa15.45■□□□□ 0.06
TTC13-202ENST00000366662 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
TTC13-202ENST00000366662 KLK11Q9UBX7 282 aa15.45■□□□□ 0.06
TTC13-202ENST00000366662 EPHA6Q9UF33 1036 aa15.45■□□□□ 0.06
TTC13-202ENST00000366662 CACNG2Q9Y698 323 aa15.45■□□□□ 0.06
TTC13-202ENST00000366662 SUSD5O60279 629 aa15.44■□□□□ 0.06
TTC13-202ENST00000366662 SLC16A7O60669 478 aa15.44■□□□□ 0.06
TTC13-202ENST00000366662 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40 ms