RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 UBBP0CG47 229 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM217Q8N7C4 229 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 LUZP4Q9P127 313 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 MYH7BA7E2Y1 1941 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 ADAM23O75077 832 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 TRIM23P36406 574 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 UBA52P62987 128 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 AARDQ4LEZ3 155 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 CLVS2Q5SYC1 327 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 ASB16Q96NS5 453 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 CENPOQ9BU64 300 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 PLPP1O14494 284 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 TSSK2Q96PF2 358 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 CLDN24A6NM45 220 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 NSA2O95478 260 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 GPLD1P80108 840 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 ST7LQ8TDW4 575 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 PBX4Q9BYU1 374 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 I6L893 689 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 DEFA4P12838 97 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 EPHA5P54756 1037 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 OVCH1Q7RTY7 1134 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 SLC22A24Q8N4F4 322 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 DEFB123Q8N688 67 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 KCNG3Q8TAE7 436 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 EMC6Q9BV81 110 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 HTR1FP30939 366 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 SERPINF1P36955 418 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 APH1AQ96BI3 265 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 TPPP3Q9BW30 176 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 A8MVM7 634 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 RPL11P62913 178 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 PRTGQ2VWP7 1150 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 MAVSQ7Z434 540 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 NIPAL2Q9H841 368 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 A6NHS1 94 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 EPHX3Q9H6B9 360 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 SCG5P05408 212 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 CALCBP10092 127 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 PHLDA2Q53GA4 152 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 S100A7AQ86SG5 101 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 FJX1Q86VR8 437 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 FAM71CQ8NEG0 241 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 LRIT2A6NDA9 550 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 CDK4P11802 303 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 GLYATL3Q5SZD4 288 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 LIPHQ8WWY8 451 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 OR5M11Q96RB7 305 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 BCKDHBP21953 392 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 TDHQ8IZJ6 230 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 SUMF1Q8NBK3 374 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 IMPA2O14732 288 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 KIAA1024LP59773 190 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 CLINT1Q14677 625 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 FAM71E1Q6IPT2 247 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 PGAP1Q75T13 922 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 TEX37Q96LM6 180 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 A0A1W2PPE2 198 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 A0A1W2PR64 198 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 A0A1W2PRV1 198 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 CLEC3BP05452 202 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 METRNLQ641Q3 311 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 ALKAL2Q6UX46 152 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 OR2M2Q96R28 347 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 CHST8Q9H2A9 424 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 MICAL3Q7RTP6 2002 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 DMWDQ09019 674 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 FAM213BQ8TBF2 198 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 C8orf44Q96CB5 159 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 ABHD6Q9BV23 337 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 NPBWR1P48145 328 aa20.58■□□□□ 0.88
PTPRM-201ENST00000332175 DUSP5Q16690 384 aa20.58■□□□□ 0.88
PTPRM-201ENST00000332175 OR51D1Q8NGF3 324 aa20.58■□□□□ 0.88
PTPRM-201ENST00000332175 SHISA7A6NL88 538 aa20.58■□□□□ 0.88
PTPRM-201ENST00000332175 NDUFB7P17568 137 aa20.58■□□□□ 0.88
PTPRM-201ENST00000332175 SSTP61278 116 aa20.58■□□□□ 0.88
PTPRM-201ENST00000332175 YIF1BQ5BJH7 314 aa20.58■□□□□ 0.88
PTPRM-201ENST00000332175 NHSL2Q5HYW2 709 aa20.58■□□□□ 0.88
PTPRM-201ENST00000332175 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms