RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM53CQ9NYF3 392 aa17.02■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 CD300AQ9UGN4 299 aa17.02■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 POFUT2Q9Y2G5 429 aa17.02■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 HIF3AQ9Y2N7 669 aa17.02■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A1W2PRG6 482 aa17.01■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 HTR3EA5X5Y0 456 aa17.01■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 BCL10O95999 233 aa17.01■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 CBR1P16152 277 aa17.01■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAKP20794 623 aa17.01■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 NAAAQ02083 359 aa17.01■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRKCDQ05655 676 aa17.01■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 RUNX1T1Q06455 604 aa17.01■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 KRT72Q14CN4 511 aa17.01■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 AGAP6Q5VW22 663 aa17.01■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF544Q6NX49 715 aa17.01■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 C16orf89Q6UX73 402 aa17.01■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 MDP1Q86V88 176 aa17.01■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 DEFB107AQ8IZN7 70 aa17.01■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 NOXO1Q8NFA2 376 aa17.01■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 CDRT15Q96T59 188 aa17.01■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 SEPHS2Q99611 448 aa17.01■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 GORASP2Q9H8Y8 452 aa17.01■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF224Q9NZL3 707 aa17.01■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa17.01■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 C2CD3Q4AC94 2353 aa17■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A087WUU8 490 aa17■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 NPIPB13A6NJU9 1138 aa17■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 NPIPB4C9JG80 1138 aa17■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 MCIDASD6RGH6 385 aa17■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGHG1P01857 330 aa17■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 HLA-HP01893 362 aa17■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 FOSL1P15407 271 aa17■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 CALCRP30988 508 aa17■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 CAPZA2P47755 286 aa17■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 FABP6P51161 128 aa17■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 DAP3P51398 398 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 FHL1Q13642 323 aa17■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 LRFN4Q6PJG9 635 aa17■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa17■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 CYP4Z1Q86W10 505 aa17■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCDC36Q8IYA8 594 aa17■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 FBXL14Q8N1E6 418 aa17■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 MUC15Q8N387 334 aa17■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 C7orf34Q96L11 122 aa17■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 ANKRD19PQ9H560 264 aa17■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 CBLN4Q9NTU7 201 aa17■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 NDE1Q9NXR1 346 aa17■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 B3GNT2Q9NY97 397 aa17■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 NDUFAF4Q9P032 175 aa17■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 V9GYQ6 96 aa17■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRIM64A6NGJ6 449 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRIM64BA6NI03 449 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARPC2O15144 300 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 GMNNO75496 209 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 CRYAAP02489 173 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 SEMG1P04279 462 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARR3P36575 388 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 CLRN1P58418 232 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 MXRA7P84157 204 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 VLDLRP98155 873 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 NPRL3Q12980 569 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 LAPTM4AQ15012 233 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 HIST3H3Q16695 136 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 ALG10Q5BKT4 473 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARMC4Q5T2S8 1044 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 TBPL2Q6SJ96 375 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF730Q6ZMV8 503 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCDC197Q8NCU1 140 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC7A13Q8TCU3 470 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF347Q96SE7 839 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRAV27A0A087WT01 109 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 EFCAB9A8MZ26 197 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 CENPBD1B2RD01 187 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 hCG_2039718K7EN88 272 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 DHHO43323 396 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 NDUFS7O75251 213 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRMUO75648 421 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGHV4-39P01824 125 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 H1F0P07305 194 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 QDPRP09417 244 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 SAGP10523 405 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 ACADSP16219 412 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 GSG1Q2KHT4 349 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 IQCCQ4KMZ1 466 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 HDDC2Q7Z4H3 204 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 LRRC75AQ8NAA5 344 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR13C2Q8NGS9 318 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 MCHR2Q969V1 340 aa16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.4 ms