RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325438.12

PACS2-201, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACS2, Length 3,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS2-201ENST00000325438 SMARCD2Q92925 531 aa21.89■■□□□ 1.1
PACS2-201ENST00000325438 MYADMQ96S97 322 aa21.89■■□□□ 1.1
PACS2-201ENST00000325438 EPHX3Q9H6B9 360 aa21.89■■□□□ 1.1
PACS2-201ENST00000325438 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.1
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PACS2-201ENST00000325438 ZNF208O43345 1280 aa21.89■■□□□ 1.09
PACS2-201ENST00000325438 LAG3P18627 525 aa21.89■■□□□ 1.09
PACS2-201ENST00000325438 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
PACS2-201ENST00000325438 ZPLD1Q8TCW7 415 aa21.89■■□□□ 1.09
PACS2-201ENST00000325438 C2orf42Q9NWW7 574 aa21.89■■□□□ 1.09
PACS2-201ENST00000325438 ACTBP60709 375 aa21.89■■□□□ 1.09
PACS2-201ENST00000325438 ACTG1P63261 375 aa21.89■■□□□ 1.09
PACS2-201ENST00000325438 DEFB103AP81534 67 aa21.89■■□□□ 1.09
PACS2-201ENST00000325438 PEA15Q15121 130 aa21.89■■□□□ 1.09
PACS2-201ENST00000325438 METRNLQ641Q3 311 aa21.89■■□□□ 1.09
PACS2-201ENST00000325438 PXKQ7Z7A4 578 aa21.89■■□□□ 1.09
PACS2-201ENST00000325438 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
PACS2-201ENST00000325438 DMRTA2Q96SC8 542 aa21.89■■□□□ 1.09
PACS2-201ENST00000325438 C20orf24Q9BUV8 137 aa21.89■■□□□ 1.09
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PACS2-201ENST00000325438 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
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PACS2-201ENST00000325438 MGMTP16455 207 aa21.88■■□□□ 1.09
PACS2-201ENST00000325438 ATP1B3P54709 279 aa21.88■■□□□ 1.09
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PACS2-201ENST00000325438 ZAR1Q86SH2 424 aa21.88■■□□□ 1.09
PACS2-201ENST00000325438 MRGPREQ86SM8 312 aa21.88■■□□□ 1.09
PACS2-201ENST00000325438 TCEAL3Q969E4 200 aa21.88■■□□□ 1.09
PACS2-201ENST00000325438 DEFB118Q96PH6 123 aa21.88■■□□□ 1.09
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PACS2-201ENST00000325438 OR2W5A6NFC9 320 aa21.88■■□□□ 1.09
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PACS2-201ENST00000325438 ZNF136P52737 540 aa21.88■■□□□ 1.09
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PACS2-201ENST00000325438 OR52R1Q8NGF1 315 aa21.88■■□□□ 1.09
PACS2-201ENST00000325438 PRSS27Q9BQR3 290 aa21.88■■□□□ 1.09
PACS2-201ENST00000325438 OR6C68A6NDL8 312 aa21.88■■□□□ 1.09
PACS2-201ENST00000325438 TMEM235A6NFC5 223 aa21.88■■□□□ 1.09
PACS2-201ENST00000325438 C1orf196B1AJZ1 125 aa21.88■■□□□ 1.09
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PACS2-201ENST00000325438 SEC13P55735 322 aa21.88■■□□□ 1.09
PACS2-201ENST00000325438 FBXW4P57775 412 aa21.88■■□□□ 1.09
PACS2-201ENST00000325438 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
PACS2-201ENST00000325438 NKAPLQ5M9Q1 402 aa21.88■■□□□ 1.09
PACS2-201ENST00000325438 NAXDQ8IW45 347 aa21.88■■□□□ 1.09
PACS2-201ENST00000325438 SFTPA1Q8IWL2 248 aa21.88■■□□□ 1.09
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PACS2-201ENST00000325438 OR51A4Q8NGJ6 313 aa21.88■■□□□ 1.09
PACS2-201ENST00000325438 FAM3DQ96BQ1 224 aa21.88■■□□□ 1.09
PACS2-201ENST00000325438 C10orf90Q96M02 699 aa21.88■■□□□ 1.09
PACS2-201ENST00000325438 PIGMQ9H3S5 423 aa21.88■■□□□ 1.09
PACS2-201ENST00000325438 AUP1Q9Y679 476 aa21.88■■□□□ 1.09
PACS2-201ENST00000325438 NFYBP25208 207 aa21.87■■□□□ 1.09
PACS2-201ENST00000325438 MEOX2P50222 304 aa21.87■■□□□ 1.09
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PACS2-201ENST00000325438 OR4N2Q8NGD1 307 aa21.87■■□□□ 1.09
PACS2-201ENST00000325438 SULT1B1O43704 296 aa21.87■■□□□ 1.09
PACS2-201ENST00000325438 DNAJB6O75190 326 aa21.87■■□□□ 1.09
PACS2-201ENST00000325438 GABRG1Q8N1C3 465 aa21.87■■□□□ 1.09
PACS2-201ENST00000325438 DHDHQ9UQ10 334 aa21.87■■□□□ 1.09
PACS2-201ENST00000325438 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
PACS2-201ENST00000325438 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa21.87■■□□□ 1.09
PACS2-201ENST00000325438 VWA8A3KMH1 1905 aa21.87■■□□□ 1.09
PACS2-201ENST00000325438 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa21.87■■□□□ 1.09
PACS2-201ENST00000325438 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa21.87■■□□□ 1.09
PACS2-201ENST00000325438 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa21.87■■□□□ 1.09
PACS2-201ENST00000325438 TSPAN11A1L157 253 aa21.87■■□□□ 1.09
PACS2-201ENST00000325438 GGT3PA6NGU5 568 aa21.87■■□□□ 1.09
PACS2-201ENST00000325438 SNAPINO95295 136 aa21.87■■□□□ 1.09
PACS2-201ENST00000325438 FAM180AQ6UWF9 173 aa21.87■■□□□ 1.09
PACS2-201ENST00000325438 NUDT18Q6ZVK8 323 aa21.87■■□□□ 1.09
PACS2-201ENST00000325438 C14orf79Q96F83 325 aa21.87■■□□□ 1.09
PACS2-201ENST00000325438 SARGQ9BW04 601 aa21.87■■□□□ 1.09
PACS2-201ENST00000325438 SMIM3Q9BZL3 60 aa21.87■■□□□ 1.09
PACS2-201ENST00000325438 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
PACS2-201ENST00000325438 SLC22A13Q9Y226 551 aa21.87■■□□□ 1.09
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PACS2-201ENST00000325438 HMSDA8MTL9 139 aa21.86■■□□□ 1.09
PACS2-201ENST00000325438 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa21.86■■□□□ 1.09
PACS2-201ENST00000325438 G3V3Q6 166 aa21.86■■□□□ 1.09
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PACS2-201ENST00000325438 RENP00797 406 aa21.86■■□□□ 1.09
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PACS2-201ENST00000325438 EMDP50402 254 aa21.86■■□□□ 1.09
PACS2-201ENST00000325438 ERV3-1Q14264 604 aa21.86■■□□□ 1.09
PACS2-201ENST00000325438 GLYATL3Q5SZD4 288 aa21.86■■□□□ 1.09
PACS2-201ENST00000325438 C12orf40Q86WS4 652 aa21.86■■□□□ 1.09
PACS2-201ENST00000325438 SNAPC5O75971 98 aa21.86■■□□□ 1.09
PACS2-201ENST00000325438 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
PACS2-201ENST00000325438 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP21.86■■□□□ 1.09
PACS2-201ENST00000325438 SERTAD2Q14140 314 aa21.86■■□□□ 1.09
PACS2-201ENST00000325438 SLC9A3R2Q15599 337 aa21.86■■□□□ 1.09
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