RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 CENPAP49450 140 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 SELENBP1Q13228 472 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 DCDC5Q6ZRR9 648 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 CENPSQ8N2Z9 138 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 KDM8Q8N371 416 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 ASB10Q8WXI3 467 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 C5orf34Q96MH7 638 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 FANCFQ9NPI8 374 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 P4HTMQ9NXG6 502 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 SLC35F4A4IF30 521 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 PFDN1O60925 122 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 EDNRAP25101 427 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 BLVRAP53004 296 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 ATP1A4Q13733 1029 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 LAX1Q8IWV1 398 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 OR5M1Q8NGP8 315 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 OR6N2Q8NGY6 317 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 PCNX2A6NKB5 2137 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa24.08■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 C21orf140B9A014 251 aa24.08■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 NPIPA5E9PKD4 350 aa24.08■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 SERPINA3P01011 423 aa24.08■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 CAV3P56539 151 aa24.08■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 FOXK1P85037 733 aa24.08■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 FAM205BPQ63HN1 556 aa24.08■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 H3F3CQ6NXT2 135 aa24.08■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 PXKQ7Z7A4 578 aa24.08■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa24.08■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 RPS4Y2Q8TD47 263 aa24.08■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 SGCZQ96LD1 299 aa24.08■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 GPR87Q9BY21 358 aa24.08■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 NPIPA1Q9UND3 350 aa24.08■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 PCSK5Q92824 1860 aa24.08■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa24.08■■□□□ 1.44
HOXD8-201ENST00000313173 A0A1W2PNV4 684 aa24.08■■□□□ 1.44
HOXD8-201ENST00000313173 SLC16A7O60669 478 aa24.08■■□□□ 1.44
HOXD8-201ENST00000313173 SERPINA7P05543 415 aa24.08■■□□□ 1.44
HOXD8-201ENST00000313173 HSF1Q00613 529 aa24.08■■□□□ 1.44
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF181Q2M3W8 571 aa24.08■■□□□ 1.44
HOXD8-201ENST00000313173 CEACAM19Q7Z692 300 aa24.08■■□□□ 1.44
HOXD8-201ENST00000313173 TMEM185BQ9H7F4 350 aa24.08■■□□□ 1.44
HOXD8-201ENST00000313173 LAMP5Q9UJQ1 280 aa24.08■■□□□ 1.44
HOXD8-201ENST00000313173 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa24.08■■□□□ 1.44
HOXD8-201ENST00000313173 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXD8-201ENST00000313173 TACSTD2P09758 323 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXD8-201ENST00000313173 LIFP15018 202 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXD8-201ENST00000313173 IFNGR1P15260 489 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXD8-201ENST00000313173 PSMB10P40306 273 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXD8-201ENST00000313173 ACSM3Q53FZ2 586 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
HOXD8-201ENST00000313173 FAM220AQ7Z4H9 259 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXD8-201ENST00000313173 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
HOXD8-201ENST00000313173 MROQ9BYG7 248 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXD8-201ENST00000313173 RNF32Q9H0A6 362 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXD8-201ENST00000313173 DAPK2Q9UIK4 370 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXD8-201ENST00000313173 PHYHO14832 338 aa24.06■■□□□ 1.44
HOXD8-201ENST00000313173 GPANK1O95872 356 aa24.06■■□□□ 1.44
HOXD8-201ENST00000313173 CTLA4P16410 223 aa24.06■■□□□ 1.44
HOXD8-201ENST00000313173 ALOX5APP20292 161 aa24.06■■□□□ 1.44
HOXD8-201ENST00000313173 CFL1P23528 166 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
HOXD8-201ENST00000313173 DLSTP36957 453 aa24.06■■□□□ 1.44
HOXD8-201ENST00000313173 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
HOXD8-201ENST00000313173 DDI2Q5TDH0 399 aa24.06■■□□□ 1.44
HOXD8-201ENST00000313173 SLC35D2Q76EJ3 337 aa24.06■■□□□ 1.44
HOXD8-201ENST00000313173 TEX19Q8NA77 164 aa24.06■■□□□ 1.44
HOXD8-201ENST00000313173 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa24.06■■□□□ 1.44
HOXD8-201ENST00000313173 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
HOXD8-201ENST00000313173 MIXL1Q9H2W2 232 aa24.06■■□□□ 1.44
HOXD8-201ENST00000313173 ABCB9Q9NP78 766 aa24.06■■□□□ 1.44
HOXD8-201ENST00000313173 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
HOXD8-201ENST00000313173 PSMD9O00233 223 aa24.06■■□□□ 1.44
HOXD8-201ENST00000313173 TERTO14746 1132 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
HOXD8-201ENST00000313173 TBX1O43435 398 aa24.06■■□□□ 1.44
HOXD8-201ENST00000313173 GPRIN2O60269 458 aa24.06■■□□□ 1.44
HOXD8-201ENST00000313173 NCR1O76036 304 aa24.06■■□□□ 1.44
HOXD8-201ENST00000313173 MYL9P24844 172 aa24.06■■□□□ 1.44
HOXD8-201ENST00000313173 DPP4P27487 766 aa24.06■■□□□ 1.44
HOXD8-201ENST00000313173 CRABP1P29762 137 aa24.06■■□□□ 1.44
HOXD8-201ENST00000313173 C19orf57Q0VDD7 668 aa24.06■■□□□ 1.44
HOXD8-201ENST00000313173 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
HOXD8-201ENST00000313173 PAMR1Q6UXH9 720 aa24.06■■□□□ 1.44
HOXD8-201ENST00000313173 DPY19L4Q7Z388 723 aa24.06■■□□□ 1.44
HOXD8-201ENST00000313173 OR1J4Q8NGS1 313 aa24.06■■□□□ 1.44
HOXD8-201ENST00000313173 TMEM41AQ96HV5 264 aa24.06■■□□□ 1.44
HOXD8-201ENST00000313173 COX4I2Q96KJ9 171 aa24.06■■□□□ 1.44
HOXD8-201ENST00000313173 OR5B2Q96R09 309 aa24.06■■□□□ 1.44
HOXD8-201ENST00000313173 ABCB10Q9NRK6 738 aa24.06■■□□□ 1.44
HOXD8-201ENST00000313173 SNX4O95219 450 aa24.05■■□□□ 1.44
HOXD8-201ENST00000313173 ABHD16AO95870 558 aa24.05■■□□□ 1.44
HOXD8-201ENST00000313173 OR8G3PP0DMU2 310 aa24.05■■□□□ 1.44
HOXD8-201ENST00000313173 SHC1P29353 583 aa24.05■■□□□ 1.44
HOXD8-201ENST00000313173 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
HOXD8-201ENST00000313173 EGR3Q06889 387 aa24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms