RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306177.9

USP42-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 42, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene USP42, Length 5,155 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP42-201ENST00000306177 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
USP42-201ENST00000306177 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa14.65□□□□□ -0.06
USP42-201ENST00000306177 SLAMF7Q9NQ25 335 aa14.65□□□□□ -0.06
USP42-201ENST00000306177 SLC22A23A1A5C7 686 aa14.65□□□□□ -0.06
USP42-201ENST00000306177 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
USP42-201ENST00000306177 SBK3P0C264 359 aa14.65□□□□□ -0.06
USP42-201ENST00000306177 BSGP35613 385 aa14.65□□□□□ -0.06
USP42-201ENST00000306177 LUMP51884 338 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
USP42-201ENST00000306177 DUSP8Q13202 625 aa14.65□□□□□ -0.06
USP42-201ENST00000306177 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
USP42-201ENST00000306177 ZNF529Q6P280 563 aa14.65□□□□□ -0.06
USP42-201ENST00000306177 ZNF546Q86UE3 836 aa14.65□□□□□ -0.06
USP42-201ENST00000306177 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa14.65□□□□□ -0.06
USP42-201ENST00000306177 BCORP1Q8N888 145 aa14.65□□□□□ -0.06
USP42-201ENST00000306177 FGF14Q92915 247 aa14.65□□□□□ -0.06
USP42-201ENST00000306177 S100PBPQ96BU1 408 aa14.65□□□□□ -0.06
USP42-201ENST00000306177 TMEM100Q9NV29 134 aa14.65□□□□□ -0.06
USP42-201ENST00000306177 PCDHB10Q9UN67 800 aa14.65□□□□□ -0.06
USP42-201ENST00000306177 GABRA2P47869 451 aa14.65□□□□□ -0.06
USP42-201ENST00000306177 IKZF1Q13422 519 aa14.65□□□□□ -0.06
USP42-201ENST00000306177 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
USP42-201ENST00000306177 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
USP42-201ENST00000306177 TEAD3Q99594 435 aa14.65□□□□□ -0.06
USP42-201ENST00000306177 SELENOIQ9C0D9 397 aa14.65□□□□□ -0.06
USP42-201ENST00000306177 NGBQ9NPG2 151 aa14.65□□□□□ -0.06
USP42-201ENST00000306177 A3GALT2U3KPV4 340 aa14.65□□□□□ -0.06
USP42-201ENST00000306177 LINC01565O15544 149 aa14.64□□□□□ -0.07
USP42-201ENST00000306177 SRFP11831 508 aa14.64□□□□□ -0.07
USP42-201ENST00000306177 ST6GAL1P15907 406 aa14.64□□□□□ -0.07
USP42-201ENST00000306177 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
USP42-201ENST00000306177 MSMO1Q15800 293 aa14.64□□□□□ -0.07
USP42-201ENST00000306177 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
USP42-201ENST00000306177 GPR155Q7Z3F1 870 aa14.64□□□□□ -0.07
USP42-201ENST00000306177 DCXRQ7Z4W1 244 aa14.64□□□□□ -0.07
USP42-201ENST00000306177 OR5D18Q8NGL1 313 aa14.64□□□□□ -0.07
USP42-201ENST00000306177 MBOAT4Q96T53 435 aa14.64□□□□□ -0.07
USP42-201ENST00000306177 GON7Q9BXV9 100 aa14.64□□□□□ -0.07
USP42-201ENST00000306177 SLC23A2Q9UGH3 650 aa14.64□□□□□ -0.07
USP42-201ENST00000306177 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
USP42-201ENST00000306177 RNF212BA8MTL3 300 aa14.64□□□□□ -0.07
USP42-201ENST00000306177 KCNK2O95069 426 aa14.64□□□□□ -0.07
USP42-201ENST00000306177 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
USP42-201ENST00000306177 GRB2P62993 217 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
USP42-201ENST00000306177 ADPRMQ3LIE5 342 aa14.64□□□□□ -0.07
USP42-201ENST00000306177 WDR88Q6ZMY6 472 aa14.64□□□□□ -0.07
USP42-201ENST00000306177 OR6M1Q8NGM8 313 aa14.64□□□□□ -0.07
USP42-201ENST00000306177 SMIM3Q9BZL3 60 aa14.64□□□□□ -0.07
USP42-201ENST00000306177 MED16Q9Y2X0 877 aa14.64□□□□□ -0.07
USP42-201ENST00000306177 C2orf72A6NCS6 295 aa14.64□□□□□ -0.07
USP42-201ENST00000306177 H0YIG0 161 aa14.64□□□□□ -0.07
USP42-201ENST00000306177 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
USP42-201ENST00000306177 GLULP15104 373 aa14.64□□□□□ -0.07
USP42-201ENST00000306177 SRMP19623 302 aa14.64□□□□□ -0.07
USP42-201ENST00000306177 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
USP42-201ENST00000306177 TMEM196Q5HYL7 178 aa14.64□□□□□ -0.07
USP42-201ENST00000306177 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
USP42-201ENST00000306177 WDSUB1Q8N9V3 476 aa14.64□□□□□ -0.07
USP42-201ENST00000306177 GJC3Q8NFK1 279 aa14.64□□□□□ -0.07
USP42-201ENST00000306177 GABARAPL3Q9BY60 117 aa14.64□□□□□ -0.07
USP42-201ENST00000306177 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
USP42-201ENST00000306177 FBXO7Q9Y3I1 522 aa14.64□□□□□ -0.07
USP42-201ENST00000306177 UBR3Q6ZT12 1888 aa14.64□□□□□ -0.07
USP42-201ENST00000306177 F10P00742 488 aa14.64□□□□□ -0.07
USP42-201ENST00000306177 CLEC2LP0C7M8 214 aa14.64□□□□□ -0.07
USP42-201ENST00000306177 UBBP0CG47 229 aa14.64□□□□□ -0.07
USP42-201ENST00000306177 CAPZBP47756 277 aa14.64□□□□□ -0.07
USP42-201ENST00000306177 SLC35A2P78381 396 aa14.64□□□□□ -0.07
USP42-201ENST00000306177 IHHQ14623 411 aa14.64□□□□□ -0.07
USP42-201ENST00000306177 AGBL4Q5VU57 503 aa14.64□□□□□ -0.07
USP42-201ENST00000306177 FBXW12Q6X9E4 464 aa14.64□□□□□ -0.07
USP42-201ENST00000306177 Q6ZTK2 550 aa14.64□□□□□ -0.07
USP42-201ENST00000306177 COMTD1Q86VU5 262 aa14.64□□□□□ -0.07
USP42-201ENST00000306177 CA13Q8N1Q1 262 aa14.64□□□□□ -0.07
USP42-201ENST00000306177 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
USP42-201ENST00000306177 FGGYQ96C11 551 aa14.64□□□□□ -0.07
USP42-201ENST00000306177 WBP1LQ9NX94 342 aa14.64□□□□□ -0.07
USP42-201ENST00000306177 MICAL3Q7RTP6 2002 aa14.64□□□□□ -0.07
USP42-201ENST00000306177 AGPAT2O15120 278 aa14.63□□□□□ -0.07
USP42-201ENST00000306177 CPT2P23786 658 aa14.63□□□□□ -0.07
USP42-201ENST00000306177 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
USP42-201ENST00000306177 UBA52P62987 128 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
USP42-201ENST00000306177 SORDQ00796 357 aa14.63□□□□□ -0.07
USP42-201ENST00000306177 FCRL6Q6DN72 434 aa14.63□□□□□ -0.07
USP42-201ENST00000306177 FAM26EQ8N5C1 309 aa14.63□□□□□ -0.07
USP42-201ENST00000306177 CCL4L1Q8NHW4 92 aa14.63□□□□□ -0.07
USP42-201ENST00000306177 FAM3DQ96BQ1 224 aa14.63□□□□□ -0.07
USP42-201ENST00000306177 CSF3RQ99062 836 aa14.63□□□□□ -0.07
USP42-201ENST00000306177 TEX101Q9BY14 249 aa14.63□□□□□ -0.07
USP42-201ENST00000306177 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
USP42-201ENST00000306177 KCNJ16Q9NPI9 418 aa14.63□□□□□ -0.07
USP42-201ENST00000306177 NPAP1Q9NZP6 1156 aa14.63□□□□□ -0.07
USP42-201ENST00000306177 MYOTQ9UBF9 498 aa14.63□□□□□ -0.07
USP42-201ENST00000306177 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa14.63□□□□□ -0.07
USP42-201ENST00000306177 OR6C76A6NM76 312 aa14.63□□□□□ -0.07
USP42-201ENST00000306177 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
USP42-201ENST00000306177 DOK2O60496 412 aa14.63□□□□□ -0.07
USP42-201ENST00000306177 SBK2P0C263 348 aa14.63□□□□□ -0.07
USP42-201ENST00000306177 NAGAP17050 411 aa14.63□□□□□ -0.07
USP42-201ENST00000306177 MSR1P21757 451 aa14.63□□□□□ -0.07
USP42-201ENST00000306177 SSTR2P30874 369 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms