RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292535.11

CUX1-201, Transcript of cut like homeobox 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CUX1, Length 13,747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX1-201ENST00000292535 EDN1P05305 212 aa8.64□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 DEFA6Q01524 100 aa8.64□□□□□ -1.03
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CUX1-201ENST00000292535 OR11A1Q9GZK7 315 aa8.64□□□□□ -1.03
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CUX1-201ENST00000292535 SNED1Q8TER0 1413 aa8.63□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 MEIOCA2RUB1 952 aa8.63□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP8.63□□□□□ -1.031e-8■■■■□ 26.3
CUX1-201ENST00000292535 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa8.63□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 RTL8AQ9BWD3 113 aa8.63□□□□□ -1.03
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CUX1-201ENST00000292535 ST8SIA5O15466 376 aa8.63□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 RPS17P08708 135 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
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