RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258962.4

SRSF1-201, Transcript of serine and arginine rich splicing factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SRSF1, Length 1,513 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF1-201ENST00000258962 SVILO95425 2214 aa15.62■□□□□ 0.09
SRSF1-201ENST00000258962 A0A1W2PNR3 127 aa15.62■□□□□ 0.09
SRSF1-201ENST00000258962 H7C1C5 153 aa15.62■□□□□ 0.09
SRSF1-201ENST00000258962 OR6A2O95222 327 aa15.62■□□□□ 0.09
SRSF1-201ENST00000258962 BCL10O95999 233 aa15.62■□□□□ 0.09
SRSF1-201ENST00000258962 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
SRSF1-201ENST00000258962 SBK2P0C263 348 aa15.62■□□□□ 0.09
SRSF1-201ENST00000258962 RFPL3SP0C7P2 107 aa15.62■□□□□ 0.09
SRSF1-201ENST00000258962 HLA-DOBP13765 273 aa15.62■□□□□ 0.09
SRSF1-201ENST00000258962 ZNF17P17021 662 aa15.62■□□□□ 0.09
SRSF1-201ENST00000258962 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
SRSF1-201ENST00000258962 SRD5A2P31213 254 aa15.62■□□□□ 0.09
SRSF1-201ENST00000258962 ATP6V1E1P36543 226 aa15.62■□□□□ 0.09
SRSF1-201ENST00000258962 B3GALT5-AS1P59052 145 aa15.62■□□□□ 0.09
SRSF1-201ENST00000258962 RPL27P61353 136 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
SRSF1-201ENST00000258962 LCN6P62502 163 aa15.62■□□□□ 0.09
SRSF1-201ENST00000258962 PUDPQ08623 228 aa15.62■□□□□ 0.09
SRSF1-201ENST00000258962 FOXO1Q12778 655 aa15.62■□□□□ 0.09
SRSF1-201ENST00000258962 SSX1Q16384 188 aa15.62■□□□□ 0.09
SRSF1-201ENST00000258962 TSTQ16762 297 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
SRSF1-201ENST00000258962 RAET1LQ5VY80 246 aa15.62■□□□□ 0.09
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SRSF1-201ENST00000258962 LHFPL3Q86UP9 236 aa15.62■□□□□ 0.09
SRSF1-201ENST00000258962 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa15.62■□□□□ 0.09
SRSF1-201ENST00000258962 OR51L1Q8NGJ5 315 aa15.62■□□□□ 0.09
SRSF1-201ENST00000258962 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
SRSF1-201ENST00000258962 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
SRSF1-201ENST00000258962 TXNIPQ9H3M7 391 aa15.62■□□□□ 0.09
SRSF1-201ENST00000258962 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
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SRSF1-201ENST00000258962 C12orf71A8MTZ7 269 aa15.61■□□□□ 0.09
SRSF1-201ENST00000258962 AKR7A3O95154 331 aa15.61■□□□□ 0.09
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SRSF1-201ENST00000258962 GADD45AP24522 165 aa15.61■□□□□ 0.09
SRSF1-201ENST00000258962 SFTPDP35247 375 aa15.61■□□□□ 0.09
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SRSF1-201ENST00000258962 PMP22Q01453 160 aa15.61■□□□□ 0.09
SRSF1-201ENST00000258962 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa15.61■□□□□ 0.09
SRSF1-201ENST00000258962 SLC35D3Q5M8T2 416 aa15.61■□□□□ 0.09
SRSF1-201ENST00000258962 LINC01590Q5TEZ4 76 aa15.61■□□□□ 0.09
SRSF1-201ENST00000258962 KDM8Q8N371 416 aa15.61■□□□□ 0.09
SRSF1-201ENST00000258962 ACBD7Q8N6N7 88 aa15.61■□□□□ 0.09
SRSF1-201ENST00000258962 TSSK2Q96PF2 358 aa15.61■□□□□ 0.09
SRSF1-201ENST00000258962 OR5B2Q96R09 309 aa15.61■□□□□ 0.09
SRSF1-201ENST00000258962 FANCFQ9NPI8 374 aa15.61■□□□□ 0.09
SRSF1-201ENST00000258962 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa15.61■□□□□ 0.09
SRSF1-201ENST00000258962 A0A1W2PNV4 684 aa15.6■□□□□ 0.09
SRSF1-201ENST00000258962 DCTN6O00399 190 aa15.6■□□□□ 0.09
SRSF1-201ENST00000258962 TFP02787 698 aa15.6■□□□□ 0.09
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SRSF1-201ENST00000258962 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
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SRSF1-201ENST00000258962 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
SRSF1-201ENST00000258962 LCN1P1Q5VSP4 162 aa15.6■□□□□ 0.09
SRSF1-201ENST00000258962 SULF2Q8IWU5 870 aa15.6■□□□□ 0.09
SRSF1-201ENST00000258962 OR2M7Q8NG81 312 aa15.6■□□□□ 0.09
SRSF1-201ENST00000258962 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
SRSF1-201ENST00000258962 TBX5Q99593 518 aa15.6■□□□□ 0.09
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SRSF1-201ENST00000258962 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa15.6■□□□□ 0.09
SRSF1-201ENST00000258962 MYO18BQ8IUG5 2567 aa15.59■□□□□ 0.09
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SRSF1-201ENST00000258962 OR2B6P58173 313 aa15.59■□□□□ 0.09
SRSF1-201ENST00000258962 POU4F2Q12837 409 aa15.59■□□□□ 0.09
SRSF1-201ENST00000258962 MELKQ14680 651 aa15.59■□□□□ 0.09
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SRSF1-201ENST00000258962 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa15.59■□□□□ 0.09
SRSF1-201ENST00000258962 OR52N1Q8NH53 320 aa15.59■□□□□ 0.09
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SRSF1-201ENST00000258962 SMPDL3BQ92485 455 aa15.59■□□□□ 0.09
SRSF1-201ENST00000258962 SNX18Q96RF0 628 aa15.59■□□□□ 0.09
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SRSF1-201ENST00000258962 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa15.59■□□□□ 0.09
SRSF1-201ENST00000258962 ZFP64Q9NPA5 681 aa15.59■□□□□ 0.09
SRSF1-201ENST00000258962 B3GAT1Q9P2W7 334 aa15.59■□□□□ 0.09
SRSF1-201ENST00000258962 A0A1W2PRG6 482 aa15.58■□□□□ 0.09
SRSF1-201ENST00000258962 FAM171A2A8MVW0 826 aa15.58■□□□□ 0.09
SRSF1-201ENST00000258962 ZNF814B7Z6K7 855 aa15.58■□□□□ 0.09
SRSF1-201ENST00000258962 CCRL2O00421 344 aa15.58■□□□□ 0.09
SRSF1-201ENST00000258962 LALBAP00709 142 aa15.58■□□□□ 0.09
SRSF1-201ENST00000258962 RENP00797 406 aa15.58■□□□□ 0.09
SRSF1-201ENST00000258962 KLK2P20151 261 aa15.58■□□□□ 0.09
SRSF1-201ENST00000258962 UQCRFS1P47985 274 aa15.58■□□□□ 0.09
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