RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229307.8

NANOG-201, Transcript of Nanog homeobox, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NANOG, Length 5,183 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOG-201ENST00000229307 NMNAT3Q96T66 252 aa7.28□□□□□ -1.24
NANOG-201ENST00000229307 SYT4Q9H2B2 425 aa7.28□□□□□ -1.24
NANOG-201ENST00000229307 APMAPQ9HDC9 416 aa7.28□□□□□ -1.24
NANOG-201ENST00000229307 TMEM74BQ9NUR3 256 aa7.28□□□□□ -1.24
NANOG-201ENST00000229307 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa7.28□□□□□ -1.24
NANOG-201ENST00000229307 PTTG2Q9NZH5 202 aa7.28□□□□□ -1.24
NANOG-201ENST00000229307 HIF3AQ9Y2N7 669 aa7.28□□□□□ -1.24
NANOG-201ENST00000229307 GMEB1Q9Y692 573 aa7.28□□□□□ -1.24
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NANOG-201ENST00000229307 H7C1Q1 480 aa7.27□□□□□ -1.25
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NANOG-201ENST00000229307 ZNF718Q3SXZ3 478 aa7.27□□□□□ -1.25
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NANOG-201ENST00000229307 C12orf10Q9HB07 376 aa7.27□□□□□ -1.25
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NANOG-201ENST00000229307 AASSQ9UDR5 926 aa7.27□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 ZNF281Q9Y2X9 895 aa7.27□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 HRH3Q9Y5N1 445 aa7.27□□□□□ -1.25
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NANOG-201ENST00000229307 A0A1W2PQD3 144 aa7.27□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 XRCC2O43543 280 aa7.27□□□□□ -1.25
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NANOG-201ENST00000229307 PRR7Q8TB68 274 aa7.27□□□□□ -1.25
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NANOG-201ENST00000229307 S100A1P23297 94 aa7.26□□□□□ -1.25
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NANOG-201ENST00000229307 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
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NANOG-201ENST00000229307 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa7.26□□□□□ -1.25
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NANOG-201ENST00000229307 VAMP1P23763 118 aa7.26□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 MLF1P58340 268 aa7.26□□□□□ -1.25
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