RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000031823.11

Herc3-201, Transcript of Hect domain and RLD 3, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Herc3, Length 3,596 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rfc3Q8R323 356 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lactb2Q99KR3 288 aa10.66□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pop4Q9CR08 221 aa10.66□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mrps28Q9CY16 186 aa10.66□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Arl5bQ9D4P0 179 aa10.66□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Phf7Q9DAG9 307 aa10.66□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr937Q9EQB4 311 aa10.66□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 RangrfQ9JIB0 185 aa10.66□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ubqln2Q9QZM0 638 aa10.66□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Avpr1bQ9WU02 421 aa10.66□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Aloxe3Q9WV07 711 aa10.66□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dock10Q8BZN6 2150 aa10.66□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Urb1Q571H0 2274 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 A0A286YDU1 74 aa10.65□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 H2-LP01897 362 aa10.65□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Znf271P15620 580 aa10.65□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Elk4P41158 430 aa10.65□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Coq8bQ566J8 533 aa10.65□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ppp3r2Q63811 179 aa10.65□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Baiap2Q8BKX1 535 aa10.65□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gpr107Q8BUV8 551 aa10.65□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Entpd8Q8K0L2 497 aa10.65□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vmn1r23Q8R2D0 302 aa10.65□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Acsm1Q91VA0 573 aa10.65□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sec16bQ91XT4 1051 aa10.65□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gdpd3Q99LY2 330 aa10.65□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 MmachcQ9CZD0 279 aa10.65□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 NaaaQ9D7V9 362 aa10.65□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Krt81Q9ERE2 481 aa10.65□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nkain4Q9JMG4 208 aa10.65□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fbxl6Q9QXW0 535 aa10.65□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Adam25Q9R159 760 aa10.65□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cabin1G3X8Q1 2187 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fam90a1aA2A4E2 429 aa10.65□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zfp870J3QMA4 560 aa10.65□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vmn1r120K7N6J6 305 aa10.65□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 P01795 144 aa10.65□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rpl6P47911 296 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cd53Q61451 219 aa10.65□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pcyt1bQ811Q9 369 aa10.65□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Prox2Q8BII1 593 aa10.65□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Elfn1Q8C8T7 828 aa10.65□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr862Q8VFJ1 306 aa10.65□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ptp4a3Q9D658 173 aa10.65□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sdf2Q9DCT5 211 aa10.65□□□□□ -0.7
Herc3-201ENSMUST00000031823 Trav12n-2A0A075B626 113 aa10.65□□□□□ -0.71
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vmn2r28L7N203 852 aa10.65□□□□□ -0.71
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cox5aP12787 146 aa10.65□□□□□ -0.71
Herc3-201ENSMUST00000031823 Erp29P57759 262 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.71
Herc3-201ENSMUST00000031823 Bbs1Q3V3N7 593 aa10.65□□□□□ -0.71
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tab3Q571K4 716 aa10.65□□□□□ -0.71
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fstl4Q5STE3 841 aa10.65□□□□□ -0.71
Herc3-201ENSMUST00000031823 Clcn4Q61418 747 aa10.65□□□□□ -0.71
Herc3-201ENSMUST00000031823 Taldo1Q93092 337 aa10.65□□□□□ -0.71
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ddah2Q99LD8 285 aa10.65□□□□□ -0.71
Herc3-201ENSMUST00000031823 Spint2Q9WU03 252 aa10.65□□□□□ -0.71
Herc3-201ENSMUST00000031823 KalrnA2CG49 2964 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc3-201ENSMUST00000031823 Spg11Q3UHA3 2430 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ighv1-78A0A0G2JGN3 117 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zfp433A0A0J9YUD4 600 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm32687A0A1W2P6H7 600 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mrap2D3Z1Q2 207 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr723E9PZU2 309 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zbtb25G3UW50 439 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc3-201ENSMUST00000031823 RradO88667 308 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc3-201ENSMUST00000031823 Wipf3P0C7L0 485 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fcer1aP20489 250 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc3-201ENSMUST00000031823 DckP43346 260 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc25a33Q3TZX3 320 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc3-201ENSMUST00000031823 Serpinf2Q61247 491 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lefty1Q64280 368 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zfp9Q8BIS1 454 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cnot2Q8C5L3 540 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
Herc3-201ENSMUST00000031823 GabrpQ8QZW7 440 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr108Q8VFA1 320 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gid4Q9CPY6 217 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc3-201ENSMUST00000031823 Upk3bl1Q9D701 249 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc3-201ENSMUST00000031823 GmfgQ9ERL7 142 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc3-201ENSMUST00000031823 Parp4E9PYK3 1969 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc3-201ENSMUST00000031823 SetxA2AKX3 2646 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ankrd12G5E893 2041 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc3-201ENSMUST00000031823 P06321 130 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc3-201ENSMUST00000031823 GcgP55095 180 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc3-201ENSMUST00000031823 Isg20l2Q3U1G5 368 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr151Q60893 309 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hsh2dQ6VYH9 334 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tas2r117Q7M715 330 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr1135Q7TR42 310 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gpr176Q80WT4 515 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc3-201ENSMUST00000031823 Znf8Q8BGV5 572 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc3-201ENSMUST00000031823 ChdhQ8BJ64 596 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc3-201ENSMUST00000031823 St7lQ8K4P7 559 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr676Q8VGZ9 317 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mrgpra3Q91WW3 302 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zmynd19Q9CQG3 227 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rprd1bQ9CSU0 326 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
Herc3-201ENSMUST00000031823 Toe1Q9D2E2 511 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc3-201ENSMUST00000031823 Syt13Q9EQT6 426 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm28557A0A087WQQ0 336 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vmn2r49D3Z6L3 852 aa10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 29.3 ms