RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597656.5

KHSRP-208, Transcript of KH-type splicing regulatory protein, human

TSL 5

Gene KHSRP, Length 328 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KHSRP-208	ENST00000597656	COL8A1	P27658	744 aa		7.38	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	CCKAR	P32238	428 aa		7.38	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	UGT2B10	P36537	528 aa		7.38	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	CD79B	P40259	229 aa		7.38	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	BID	P55957	195 aa		7.38	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	PRPS1	P60891	318 aa		7.38	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	RUNX1T1	Q06455	604 aa		7.38	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	FAP	Q12884	760 aa		7.38	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	SNTB1	Q13884	538 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	P2RY6	Q15077	328 aa		7.38	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	ACKR1	Q16570	336 aa		7.38	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	ARMC4	Q5T2S8	1044 aa		7.38	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	CRYBG3	Q68DQ2	2970 aa		7.38	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	HMBOX1	Q6NT76	420 aa		7.38	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	ZFP1	Q6P2D0	407 aa		7.38	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	NIPAL3	Q6P499	406 aa		7.38	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	SHQ1	Q6PI26	577 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	MYO7B	Q6PIF6	2116 aa		7.38	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	SLC35D2	Q76EJ3	337 aa		7.38	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	LINGO2	Q7L985	606 aa		7.38	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	AMIGO2	Q86SJ2	522 aa		7.38	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	IGFN1	Q86VF2	1251 aa		7.38	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	CXorf67	Q86X51	503 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	C10orf67	Q8IYJ2	551 aa		7.38	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	UBE2J2	Q8N2K1	259 aa		7.38	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	OR10G2	Q8NGC3	310 aa		7.38	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	OR6X1	Q8NH79	312 aa		7.38	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		7.38	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	GIPC3	Q8TF64	312 aa		7.38	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	GTPBP3	Q969Y2	492 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	NRBF2	Q96F24	287 aa		7.38	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	FEV	Q99581	238 aa		7.38	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	BDH2	Q9BUT1	245 aa		7.38	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	DGCR6L	Q9BY27	220 aa		7.38	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	MRPL13	Q9BYD1	178 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	LINC00470	Q9BZP3	86 aa		7.38	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	SLCO5A1	Q9H2Y9	848 aa		7.38	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	ASB6	Q9NWX5	421 aa		7.38	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	ELOVL5	Q9NYP7	299 aa		7.38	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	PDP1	Q9P0J1	537 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	IL20RA	Q9UHF4	553 aa		7.38	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	FOXD3	Q9UJU5	478 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	MGAT4B	Q9UQ53	548 aa		7.38	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	DOCK7	Q96N67	2140 aa		7.37	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656		A0A1W2PRG6	482 aa		7.37	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	OR6C65	A6NJZ3	312 aa		7.37	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	ZNF726	A6NNF4	738 aa		7.37	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	C16orf97	H3BN30	126 aa		7.37	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	SLC43A1	O75387	559 aa		7.37	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	UPK3A	O75631	287 aa		7.37	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	NDUFB2	O95178	105 aa		7.37	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	BCL10	O95999	233 aa		7.37	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	IGHM	P01871	453 aa		7.37	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	TP53	P04637	393 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	CD14	P08571	375 aa		7.37	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	IGFBP1	P08833	259 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	PGA4	P0DJD7	388 aa		7.37	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	PGA3	P0DJD8	388 aa		7.37	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	FCGR1A	P12314	374 aa		7.37	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	PSMB1	P20618	241 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	COX5A	P20674	150 aa		7.37	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	IGHV1-2	P23083	117 aa		7.37	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	DAP3	P51398	398 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	CTXN1	P60606	82 aa		7.37	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	SORD	Q00796	357 aa		7.37	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	COX10	Q12887	443 aa		7.37	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	ITGAD	Q13349	1161 aa		7.37	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	CAMK2D	Q13557	499 aa		7.37	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	MELK	Q14680	651 aa		7.37	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	HIST3H3	Q16695	136 aa		7.37	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	RFX4	Q33E94	735 aa		7.37	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	PHYHD1	Q5SRE7	291 aa		7.37	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	SFRP5	Q5T4F7	317 aa		7.37	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	CARD17	Q5XLA6	110 aa		7.37	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	ANKRD34A	Q69YU3	496 aa		7.37	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	SMARCD3	Q6STE5	483 aa		7.37	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	CD300LD	Q6UXZ3	194 aa		7.37	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	ZNF620	Q6ZNG0	422 aa		7.37	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	RASSF6	Q6ZTQ3	369 aa		7.37	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	C22orf34	Q6ZV56	151 aa		7.37	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	FAM122B	Q7Z309	247 aa		7.37	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	KIF18B	Q86Y91	864 aa		7.37	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	DMRTC2	Q8IXT2	367 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	C20orf196	Q8IYI0	205 aa		7.37	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	ZNF433	Q8N7K0	673 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	POMGNT2	Q8NAT1	580 aa		7.37	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	ZNF519	Q8TB69	540 aa		7.37	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	ASB10	Q8WXI3	467 aa		7.37	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	LRRC46	Q96FV0	321 aa		7.37	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	CENPN	Q96H22	339 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	SLC25A44	Q96H78	314 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	LRR1	Q96L50	414 aa		7.37	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	SAMD8	Q96LT4	415 aa		7.37	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	ADAD1	Q96M93	576 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	GPX7	Q96SL4	187 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	PKP2	Q99959	881 aa		7.37	□□□□□ -1.23
KHSRP-208	ENST00000597656	NIPSNAP1	Q9BPW8	284 aa		7.37	□□□□□ -1.23

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