RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577827.5

PTPRM-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 4,640 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-205ENST00000577827 STK17BO94768 372 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 AQP8O94778 261 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 HOXB5P09067 269 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 CEBPBP17676 345 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 SLC6A1P30531 599 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 HOXC12P31275 282 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 PPT1P50897 306 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 NFATC4Q14934 902 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 ZNF750Q32MQ0 723 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 EMC4Q5J8M3 183 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 Q6ZNB5 142 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 FBLIM1Q8WUP2 373 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 WDR34Q96EX3 536 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 ADOQ96SZ5 270 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 POFUT1Q9H488 388 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 EHFQ9NZC4 300 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 LRFN1Q9P244 771 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 NDRG3Q9UGV2 375 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 SCN9AQ15858 1988 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 E9PI62 339 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 DUX1O43812 170 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 SSX4O60224 188 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 SELENOFO60613 162 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 ALDH3B1P43353 468 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 CSRP3P50461 194 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 C1orf61Q13536 156 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 ELFN2Q5R3F8 820 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 SLC25A30Q5SVS4 291 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 CARD17Q5XLA6 110 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 SLC22A25Q6T423 547 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 COX15Q7KZN9 410 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 ZNF695Q8IW36 515 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 CMTM1Q8IZ96 169 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 CLRN3Q8NCR9 226 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 UPRTQ96BW1 309 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 RAB3CQ96E17 227 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 ARHGDIGQ99819 225 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 TMEM59Q9BXS4 323 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 KCND3Q9UK17 655 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 SMCHD1A6NHR9 2005 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 TAAR5O14804 337 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 FBXO24O75426 580 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 ATG12O94817 140 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 S100A8P05109 93 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 IGFBP4P22692 258 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 SLC9A3R2Q15599 337 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 MEP1BQ16820 701 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 GLYATL3Q5SZD4 288 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 C3orf33Q6P1S2 294 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 OR2L13Q8N349 312 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 DCBLD2Q96PD2 775 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 OR52A5Q9H2C5 316 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 PLPP2O43688 288 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 HTR3BO95264 441 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 ACSM4P0C7M7 580 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 CD22P20273 847 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 ACSM1Q08AH1 577 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 DOC2BQ14184 412 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 PLXDC1Q8IUK5 500 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 ZNF160Q9HCG1 818 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 FANCFQ9NPI8 374 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 CLDND1Q9NY35 253 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 DAPP1Q9UN19 280 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 ZNF254O75437 659 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 GZMMP51124 257 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 PLP2Q04941 152 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 SLC22A6Q4U2R8 563 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 UQCC3Q6UW78 93 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 CD300LGQ6UXG3 332 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 LIX1LQ8IVB5 337 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 GABRG1Q8N1C3 465 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 SPICQ8N5J4 248 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 LSMEM1Q8N8F7 131 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 ANKRD53Q8N9V6 530 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 Q96M85 177 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 LPAR4Q99677 370 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 GAREM1Q9H706 876 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 SLC52A3Q9NQ40 469 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 PARPBPQ9NWS1 579 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 FBXL4Q9UKA2 621 aa9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms