RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 TXNIPQ9H3M7 391 aa29.19■■■□□ 2.26
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
CTDNEP1-209ENST00000574205 CTXN1P60606 82 aa29.18■■■□□ 2.26
CTDNEP1-209ENST00000574205 LGALS3BPQ08380 585 aa29.18■■■□□ 2.26
CTDNEP1-209ENST00000574205 GPR137CQ8N3F9 429 aa29.18■■■□□ 2.26
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
CTDNEP1-209ENST00000574205 AQP11Q8NBQ7 271 aa29.18■■■□□ 2.26
CTDNEP1-209ENST00000574205 STEAP2Q8NFT2 490 aa29.18■■■□□ 2.26
CTDNEP1-209ENST00000574205 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
CTDNEP1-209ENST00000574205 ARRDC5A6NEK1 342 aa29.17■■■□□ 2.26
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CTDNEP1-209ENST00000574205 FCGR1AP12314 374 aa29.17■■■□□ 2.26
CTDNEP1-209ENST00000574205 IL32P24001 234 aa29.17■■■□□ 2.26
CTDNEP1-209ENST00000574205 MPGP29372 298 aa29.17■■■□□ 2.26
CTDNEP1-209ENST00000574205 CARD17Q5XLA6 110 aa29.17■■■□□ 2.26
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGFN1Q86VF2 1251 aa29.17■■■□□ 2.26
CTDNEP1-209ENST00000574205 WDFY1Q8IWB7 410 aa29.17■■■□□ 2.26
CTDNEP1-209ENST00000574205 C20orf196Q8IYI0 205 aa29.17■■■□□ 2.26
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR10G2Q8NGC3 310 aa29.17■■■□□ 2.26
CTDNEP1-209ENST00000574205 LINC01560Q8TB33 94 aa29.17■■■□□ 2.26
CTDNEP1-209ENST00000574205 GIPC3Q8TF64 312 aa29.17■■■□□ 2.26
CTDNEP1-209ENST00000574205 ASB10Q8WXI3 467 aa29.17■■■□□ 2.26
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF566Q969W8 418 aa29.17■■■□□ 2.26
CTDNEP1-209ENST00000574205 ACTR6Q9GZN1 396 aa29.17■■■□□ 2.26
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CTDNEP1-209ENST00000574205 FASP25445 335 aa29.16■■■□□ 2.26
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CTDNEP1-209ENST00000574205 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa29.16■■■□□ 2.26
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CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa29.16■■■□□ 2.26
CTDNEP1-209ENST00000574205 C10orf67Q8IYJ2 551 aa29.16■■■□□ 2.26
CTDNEP1-209ENST00000574205 DACH2Q96NX9 599 aa29.16■■■□□ 2.26
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CTDNEP1-209ENST00000574205 SH3D21A4FU49 640 aa29.15■■■□□ 2.26
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CTDNEP1-209ENST00000574205 FXYD6P3P58550 94 aa29.15■■■□□ 2.26
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CTDNEP1-209ENST00000574205 TSC22D1Q15714 1073 aa29.15■■■□□ 2.26
CTDNEP1-209ENST00000574205 ATP6AP1Q15904 470 aa29.15■■■□□ 2.26
CTDNEP1-209ENST00000574205 ARMC4Q5T2S8 1044 aa29.15■■■□□ 2.26
CTDNEP1-209ENST00000574205 SMARCD3Q6STE5 483 aa29.15■■■□□ 2.26
CTDNEP1-209ENST00000574205 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
CTDNEP1-209ENST00000574205 KATNB1Q9BVA0 655 aa29.15■■■□□ 2.26
CTDNEP1-209ENST00000574205 DGCR6LQ9BY27 220 aa29.15■■■□□ 2.26
CTDNEP1-209ENST00000574205 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
CTDNEP1-209ENST00000574205 NTN4Q9HB63 628 aa29.15■■■□□ 2.26
CTDNEP1-209ENST00000574205 CRIM1Q9NZV1 1036 aa29.15■■■□□ 2.26
CTDNEP1-209ENST00000574205 KCNN3Q9UGI6 736 aa29.15■■■□□ 2.26
CTDNEP1-209ENST00000574205 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa29.15■■■□□ 2.26
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ANKRD34AQ69YU3 496 aa29.15■■■□□ 2.26
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CTDNEP1-209ENST00000574205 OR6N1Q8NGY5 312 aa29.15■■■□□ 2.26
CTDNEP1-209ENST00000574205 FANK1Q8TC84 345 aa29.15■■■□□ 2.26
CTDNEP1-209ENST00000574205 PYDC1Q8WXC3 89 aa29.15■■■□□ 2.26
CTDNEP1-209ENST00000574205 S100PBPQ96BU1 408 aa29.15■■■□□ 2.26
CTDNEP1-209ENST00000574205 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa29.15■■■□□ 2.26
CTDNEP1-209ENST00000574205 MED18Q9BUE0 208 aa29.15■■■□□ 2.26
CTDNEP1-209ENST00000574205 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa29.15■■■□□ 2.26
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CTDNEP1-209ENST00000574205 CENPBD1B2RD01 187 aa29.14■■■□□ 2.25
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CTDNEP1-209ENST00000574205 PGA3P0DJD8 388 aa29.14■■■□□ 2.25
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CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM222BQ8WU58 562 aa29.14■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 BDH2Q9BUT1 245 aa29.14■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR52D1Q9H346 318 aa29.14■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 CRLF2Q9HC73 371 aa29.14■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP29.14■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP29.14■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 M0R3G1 203 aa29.13■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 RAD51DO75771 328 aa29.13■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 ACADSP16219 412 aa29.13■■■□□ 2.25
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CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM205BPQ63HN1 556 aa29.13■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR7E24Q6IFN5 339 aa29.13■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF620Q6ZNG0 422 aa29.13■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 NRBF2Q96F24 287 aa29.13■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 TSPAN32Q96QS1 320 aa29.13■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 FEVQ99581 238 aa29.13■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 GPR35Q9HC97 309 aa29.13■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 NRIP3Q9NQ35 241 aa29.13■■■□□ 2.25
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