RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	CELA3B	P08861	270 aa		18.91	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	IFNGR1	P15260	489 aa		18.91	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC46A3	Q7Z3Q1	461 aa		18.91	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	OR2T12	Q8NG77	320 aa		18.91	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	POLR2J2	Q9GZM3	115 aa	Known RBP	18.91	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	POLR2J3	Q9H1A7	115 aa	Known RBP	18.91	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	CA10	Q9NS85	328 aa		18.91	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	CMTM6	Q9NX76	183 aa		18.91	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	B3GNT2	Q9NY97	397 aa		18.91	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF726	A6NNF4	738 aa		18.91	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	C11orf98	E9PRG8	122 aa		18.91	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	IFNA14	P01570	189 aa		18.91	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	KDELR2	P33947	212 aa		18.91	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	CYBRD1	Q53TN4	286 aa		18.91	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	NKAIN4	Q8IVV8	208 aa		18.91	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	MAPK1IP1L	Q8NDC0	245 aa		18.91	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	OR10H5	Q8NGA6	315 aa		18.91	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	OR6X1	Q8NH79	312 aa		18.91	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	HTRA1	Q92743	480 aa		18.91	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	SHOX2	O60902	331 aa	Predicted RBP	18.9	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	SERPINI2	O75830	405 aa		18.9	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	OR5F1	O95221	314 aa		18.9	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	OR6A2	O95222	327 aa		18.9	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	IGF2	P01344	180 aa		18.9	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	MT-ND1	P03886	318 aa		18.9	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	ARR3	P36575	388 aa		18.9	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	RBM34	P42696	430 aa	Known RBP	18.9	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	OR1E2	P47887	323 aa		18.9	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	BID	P55957	195 aa		18.9	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	HGFAC	Q04756	655 aa		18.9	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	CHRNB3	Q05901	458 aa		18.9	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	18.9	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	RAB35	Q15286	201 aa		18.9	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC35D2	Q76EJ3	337 aa		18.9	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	MDP1	Q86V88	176 aa		18.9	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC15A3	Q8IY34	581 aa		18.9	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	MICU2	Q8IYU8	434 aa		18.9	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	OR6N1	Q8NGY5	312 aa		18.9	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM54	Q969K7	222 aa		18.9	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	KCNS3	Q9BQ31	491 aa		18.9	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	B3GAT2	Q9NPZ5	323 aa		18.9	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF224	Q9NZL3	707 aa		18.9	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	GMPR2	Q9P2T1	348 aa	Known RBP	18.9	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	RIMS3	Q9UJD0	308 aa		18.9	■□□□□ 0.62
PPP4C-205	ENST00000563200	SVEP1	Q4LDE5	3571 aa		18.89	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A096LNT2	108 aa		18.89	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	COX4I1	P13073	169 aa		18.89	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	IDH3G	P51553	393 aa	Predicted RBP	18.89	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	NUDT6	P53370	316 aa		18.89	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	UGT2B15	P54855	530 aa		18.89	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	TAS2R41	P59536	307 aa		18.89	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	SELENOW	P63302	87 aa		18.89	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	ADIPOQ	Q15848	244 aa		18.89	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	C8orf82	Q6P1X6	216 aa	Predicted RBP	18.89	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	DEF8	Q6ZN54	512 aa		18.89	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	TREML1	Q86YW5	311 aa		18.89	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	NUP37	Q8NFH4	326 aa		18.89	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM255B	Q8WV15	326 aa		18.89	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF75A	Q96N20	296 aa		18.89	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	ULBP2	Q9BZM5	246 aa		18.89	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	NOX3	Q9HBY0	568 aa		18.89	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	YLPM1	P49750	1951 aa	Known RBP	18.88	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	IGHV4-30-2	A0A087WSY4	118 aa		18.88	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	IGHV2OR16-5	A0A0B4J2B6	119 aa		18.88	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	ELOVL7	A1L3X0	281 aa		18.88	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	ATP8B1	O43520	1251 aa		18.88	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC22	O60826	627 aa		18.88	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	PDE5A	O76074	875 aa		18.88	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	THRB	P10828	461 aa		18.88	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	BMP4	P12644	408 aa		18.88	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	SERPINF1	P36955	418 aa		18.88	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	CSNK1A1	P48729	337 aa		18.88	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	LRRC23	Q53EV4	343 aa	Predicted RBP	18.88	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF813	Q6ZN06	617 aa		18.88	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	ARPIN	Q7Z6K5	226 aa		18.88	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	OR4F15	Q8NGB8	312 aa		18.88	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	PFN4	Q8NHR9	129 aa		18.88	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	LIPH	Q8WWY8	451 aa		18.88	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	FBXO17	Q96EF6	278 aa		18.88	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	C20orf141	Q9NUB4	165 aa		18.88	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	AP3M1	Q9Y2T2	418 aa		18.88	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	PMF1-BGLAP	U3KQ54	211 aa		18.88	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	DNHD1	Q96M86	4753 aa		18.88	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	RNF13	O43567	381 aa		18.87	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	HLA-H	P01893	362 aa		18.87	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	TSPAN19	P0C672	248 aa		18.87	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	B4GALT1	P15291	398 aa		18.87	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	EFNA4	P52798	201 aa		18.87	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	DSCR9	P59020	149 aa		18.87	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	EFNB3	Q15768	340 aa		18.87	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	LRFN4	Q6PJG9	635 aa		18.87	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF525	Q8N782	197 aa		18.87	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM239	Q8WW34	195 aa		18.87	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC25A44	Q96H78	314 aa	Predicted RBP	18.87	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	FOXB1	Q99853	325 aa		18.87	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	GLTP	Q9NZD2	209 aa		18.87	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	POFUT2	Q9Y2G5	429 aa		18.87	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	INAFM1	C9JVW0	142 aa		18.86	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	HIST1H2AB	P04908	130 aa		18.86	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	OR4A8	P0C604	315 aa		18.86	■□□□□ 0.61

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