RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557439.5

XRCC3-218, Transcript of X-ray repair cross complementing 3, humanhuman

TSL 5

Gene XRCC3, Length 2,599 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC3-218ENST00000557439 KLHDC7BQ96G42 594 aa16.08■□□□□ 0.17
XRCC3-218ENST00000557439 CA10Q9NS85 328 aa16.08■□□□□ 0.17
XRCC3-218ENST00000557439 GRHPRQ9UBQ7 328 aa16.08■□□□□ 0.17
XRCC3-218ENST00000557439 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.17
XRCC3-218ENST00000557439 SCDO00767 359 aa16.08■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 KRT33AO76009 404 aa16.08■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 ABHD16AO95870 558 aa16.08■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 RAF1P04049 648 aa16.08■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 HRGP04196 525 aa16.08■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 IFI6P09912 130 aa16.08■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 SDHAP31040 664 aa16.08■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 CENPAP49450 140 aa16.08■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 DYRK1AQ13627 763 aa16.08■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP16.08■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 FAM220AQ7Z4H9 259 aa16.08■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 CMIPQ8IY22 773 aa16.08■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 SLC43A2Q8N370 569 aa16.08■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 RPS4Y2Q8TD47 263 aa16.08■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 LMX1AQ8TE12 382 aa16.08■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 LRFN5Q96NI6 719 aa16.08■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 UBQLN4Q9NRR5 601 aa16.08■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 KCNG2Q9UJ96 466 aa16.08■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 LAMP5Q9UJQ1 280 aa16.08■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa16.08■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 UNC13CQ8NB66 2214 aa16.07■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 CIB4A0PJX0 185 aa16.07■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 ZNF264O43296 627 aa16.07■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 ITGA10O75578 1167 aa16.07■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 SLC22A5O76082 557 aa16.07■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 ASAH2BP0C7U1 165 aa16.07■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 ADH7P40394 386 aa16.07■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 EFNB2P52799 333 aa16.07■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 SLC37A1P57057 533 aa16.07■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 Q499Y3 187 aa16.07■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 ELMOD2Q8IZ81 293 aa16.07■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 FAM71CQ8NEG0 241 aa16.07■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 OR52B4Q8NGK2 314 aa16.07■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 FAM174AQ8TBP5 190 aa16.07■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 SLC25A36Q96CQ1 311 aa16.07■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 SLC38A3Q99624 504 aa16.07■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 GAL3ST1Q99999 423 aa16.07■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 COPZ2Q9P299 210 aa16.07■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 KLHL9Q9P2J3 617 aa16.07■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa16.07■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 SLC6A5Q9Y345 797 aa16.07■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 ABCA7Q8IZY2 2146 aa16.07■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 CTDSPLO15194 276 aa16.07■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 ITPKBP27987 946 aa16.07■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 CAPZBP47756 277 aa16.07■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 GABRA4P48169 554 aa16.07■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 CHRDL2Q6WN34 429 aa16.07■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 MAMSTRQ6ZN01 415 aa16.07■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa16.07■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 MARCH3Q86UD3 253 aa16.07■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 GABARAPH6UMI1 98 aa16.06■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 PDCD5O14737 125 aa16.06■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 ZNF749O43361 778 aa16.06■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 HCRTR2O43614 444 aa16.06■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 NUDT14O95848 222 aa16.06■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 TPOP07202 933 aa16.06■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 BLVRAP53004 296 aa16.06■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 ZNF117Q03924 483 aa16.06■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 ZP2Q05996 745 aa16.06■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 ANGPT1Q15389 498 aa16.06■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 DEFB133Q30KQ1 61 aa16.06■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 LRRN1Q6UXK5 716 aa16.06■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 LRRTM1Q86UE6 522 aa16.06■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 PRSS35Q8N3Z0 413 aa16.06■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 ZNF676Q8N7Q3 588 aa16.06■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 FCAMRQ8WWV6 532 aa16.06■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 NSMAFQ92636 917 aa16.06■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 TMEM106AQ96A25 262 aa16.06■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 MSRAQ9UJ68 235 aa16.06■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 SCO1O75880 301 aa16.06■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 TAS2R20P59543 309 aa16.06■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 GUCA2AQ02747 115 aa16.06■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 ETFDHQ16134 617 aa16.06■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 CDC20BQ86Y33 519 aa16.06■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 FTMTQ8N4E7 242 aa16.06■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 TCTN2Q96GX1 697 aa16.06■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 EVA1AQ9H8M9 152 aa16.06■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 NOX3Q9HBY0 568 aa16.06■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 TAS2R10Q9NYW0 307 aa16.06■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa16.06■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 C2CD4DB7Z1M9 353 aa16.05■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 HLA-DQA2P01906 255 aa16.05■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 HSD17B7P56937 341 aa16.05■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 C19orf57Q0VDD7 668 aa16.05■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms