RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549221.5

CS-216, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-216ENST00000549221 CNBD2Q96M20 576 aa7.24□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 TRIB1Q96RU8 372 aa7.24□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 NMNAT3Q96T66 252 aa7.24□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 DDOQ99489 341 aa7.24□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 TXNIPQ9H3M7 391 aa7.24□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 FN3KQ9H479 309 aa7.24□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 MED20Q9H944 212 aa7.24□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 RNF122Q9H9V4 155 aa7.24□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 TIGARQ9NQ88 270 aa7.24□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 CMC2Q9NRP2 79 aa7.24□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 RASSF1Q9NS23 344 aa7.24□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 ENOPH1Q9UHY7 261 aa7.24□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 TINAGQ9UJW2 476 aa7.24□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 RAB26Q9ULW5 256 aa7.24□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 RASD1Q9Y272 281 aa7.24□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 ZNF835Q9Y2P0 537 aa7.24□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 ZNF175Q9Y473 711 aa7.24□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa7.24□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 ZGRF1Q86YA3 2104 aa7.24□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 A0A1W2PRG6 482 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 SLC35F4A4IF30 521 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 OR6C68A6NDL8 312 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 NPIPB13A6NJU9 1138 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 AHRRA9YTQ3 701 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 NPIPB4C9JG80 1138 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 DCTN6O00399 190 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 DENRO43583 198 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 SLC19A2O60779 497 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 TRMUO75648 421 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 ZNF432O94892 652 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 CLUP10909 449 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 APEHP13798 732 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 PLA2G2AP14555 144 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 ABOP16442 354 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 ZNF43P17038 809 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 ACVR1BP36896 505 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 PCYT1AP49585 367 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 SELENOPP49908 381 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 RPS6KA3P51812 740 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 CLDN17P56750 224 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 IL5RAQ01344 420 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 FMODQ06828 376 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP7.23□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 ITGADQ13349 1161 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 C1DQ13901 141 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 GUSBP1Q15486 140 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 SNAPC1Q16533 368 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 PHYHD1Q5SRE7 291 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 CARD17Q5XLA6 110 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 GPR139Q6DWJ6 353 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 LEG1Q6P5S2 330 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 DOLPP1Q86YN1 238 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 MED12LQ86YW9 2145 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 TUSC5Q8IXB3 177 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 GCNT2Q8N0V5 402 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 TMEM123Q8N131 208 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 SLC43A2Q8N370 569 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 MARVELD2Q8N4S9 558 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 NAXEQ8NCW5 288 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 NPEPL1Q8NDH3 523 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 RHOXF1Q8NHV9 184 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 TSSK2Q96PF2 358 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 OR2M2Q96R28 347 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 RHNO1Q9BSD3 238 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 BCO1Q9HAY6 547 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 BAIAP2Q9UQB8 552 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 NOX1Q9Y5S8 564 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 COL6A6A6NMZ7 2263 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 FBN2P35556 2912 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 PRSS37A4D1T9 235 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 CCDC182A6NF36 153 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 CD8B2A6NJW9 211 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 ARHGEF9O43307 516 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 IDH3BO43837 385 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 WDR1O75083 606 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 ENTPD6O75354 484 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 C1QL1O75973 258 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 VAMP5O95183 116 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 BCL10O95999 233 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 HMGN1P05114 100 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 GYPBP06028 91 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 PGA4P0DJD7 388 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 PGA3P0DJD8 388 aa7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms