RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533628.5

RPUSD4-208, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RPUSD4, Length 2,053 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD4-208ENST00000533628 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa11.3□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 KDM8Q8N371 416 aa11.3□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 OR4K5Q8NGD3 323 aa11.3□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 OR5J2Q8NH18 312 aa11.3□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 BPIFA2Q96DR5 249 aa11.3□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 NANSQ9NR45 359 aa11.3□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 TAS2R5Q9NYW4 299 aa11.3□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 COQ3Q9NZJ6 369 aa11.3□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 RASD1Q9Y272 281 aa11.3□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa11.3□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 PCNX1Q96RV3 2341 aa11.3□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 VAMP5O95183 116 aa11.29□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 SIRPAP78324 504 aa11.29□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 ZP4Q12836 540 aa11.29□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa11.29□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa11.29□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 ZER1Q7Z7L7 766 aa11.29□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 EPHX4Q8IUS5 362 aa11.29□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 MCEMP1Q8IX19 187 aa11.29□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 C10orf53Q8N6V4 93 aa11.29□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 OR9K2Q8NGE7 335 aa11.29□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 OR6K3Q8NGY3 331 aa11.29□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 GPA33Q99795 319 aa11.29□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 ASPNQ9BXN1 380 aa11.29□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 UCK2Q9BZX2 261 aa11.29□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 NTN4Q9HB63 628 aa11.29□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa11.29□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 TNFRSF11BO00300 401 aa11.29□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 CDC42EP2O14613 210 aa11.29□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 IDH3BO43837 385 aa11.29□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 CRYZL1O95825 349 aa11.29□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 CST1P01037 141 aa11.29□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 EDNRAP25101 427 aa11.29□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 CTAG1AP78358 180 aa11.29□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 PMS2P3Q13401 168 aa11.29□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 SLX4IPQ5VYV7 408 aa11.29□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 TMEM225Q6GV28 225 aa11.29□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 CREB3L2Q70SY1 520 aa11.29□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa11.29□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 OXGR1Q96P68 337 aa11.29□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 PKP2Q99959 881 aa11.29□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 DVL2O14641 736 aa11.28□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 TIPRLO75663 272 aa11.28□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 CLDN14O95500 239 aa11.28□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 PLGP00747 810 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 CD8BP10966 210 aa11.28□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 HLA-DOBP13765 273 aa11.28□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 BMP5P22003 454 aa11.28□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 UQCRC1P31930 480 aa11.28□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 TFF3Q07654 80 aa11.28□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa11.28□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 TMEM201Q5SNT2 666 aa11.28□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa11.28□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa11.28□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 ANGPTL6Q8NI99 470 aa11.28□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 TMEM45BQ96B21 275 aa11.28□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 CENPOQ9BU64 300 aa11.28□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 PIGMQ9H3S5 423 aa11.28□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 MARCH7Q9H992 704 aa11.28□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 FKBP14Q9NWM8 211 aa11.28□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 DNAJB9Q9UBS3 223 aa11.28□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 EMC9Q9Y3B6 208 aa11.28□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 GPR171O14626 319 aa11.28□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 PTP4A3O75365 173 aa11.28□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 CLPXO76031 633 aa11.28□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 PRKACBP22694 351 aa11.28□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 GPR4P46093 362 aa11.28□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 IST1P53990 364 aa11.28□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 CDH15P55291 814 aa11.28□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 TPTEP56180 551 aa11.28□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa11.28□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 C1orf94Q6P1W5 598 aa11.28□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 PGBD2Q6P3X8 592 aa11.28□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 GALNT5Q7Z7M9 940 aa11.28□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 LRRC75AQ8NAA5 344 aa11.28□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 REEP1Q9H902 201 aa11.28□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 EMC3Q9P0I2 261 aa11.28□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 TMEM5Q9Y2B1 443 aa11.28□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 HIF3AQ9Y2N7 669 aa11.28□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
RPUSD4-208ENST00000533628 NKX2-6A6NCS4 301 aa11.27□□□□□ -0.61
RPUSD4-208ENST00000533628 A8MXE2 369 aa11.27□□□□□ -0.61
RPUSD4-208ENST00000533628 EFCAB9A8MZ26 197 aa11.27□□□□□ -0.61
RPUSD4-208ENST00000533628 MSTNO14793 375 aa11.27□□□□□ -0.61
RPUSD4-208ENST00000533628 OR3A2P47893 321 aa11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.7 ms