RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533451.1

UBASH3B-208, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 2

Gene UBASH3B, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-208ENST00000533451 EFCAB9A8MZ26 197 aa10.06□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 ABCD4O14678 606 aa10.06□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 FZD7O75084 574 aa10.06□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 BCL10O95999 233 aa10.06□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 AQP2P41181 271 aa10.06□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 GPR4P46093 362 aa10.06□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 CDH11P55287 796 aa10.06□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 CLRN1P58418 232 aa10.06□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 TUBA1BP68363 451 aa10.06□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 TUBA4AP68366 448 aa10.06□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 ARF1P84077 181 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 SPIBQ01892 262 aa10.06□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 TBRG1Q3YBR2 411 aa10.06□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 NCMAPQ5T1S8 102 aa10.06□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 SLC22A25Q6T423 547 aa10.06□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 TMEM108Q6UXF1 575 aa10.06□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 TUBA1AQ71U36 451 aa10.06□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 LINGO2Q7L985 606 aa10.06□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 SSX8Q7RTT4 187 aa10.06□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa10.06□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 TMEM123Q8N131 208 aa10.06□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 KBTBD8Q8NFY9 601 aa10.06□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 OR52J3Q8NH60 311 aa10.06□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP10.06□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 PYURFQ96I23 114 aa10.06□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 RADILQ96JH8 1075 aa10.06□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 SEPHS2Q99611 448 aa10.06□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 KCNS3Q9BQ31 491 aa10.06□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 OCSTAMPQ9BR26 566 aa10.06□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 LINC00470Q9BZP3 86 aa10.06□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 GPR35Q9HC97 309 aa10.06□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 INIPQ9NRY2 104 aa10.06□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa10.06□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 NPAP1Q9NZP6 1156 aa10.06□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 CD300AQ9UGN4 299 aa10.06□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 POFUT2Q9Y2G5 429 aa10.06□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 ARID1AO14497 2285 aa10.05□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 PDZD2O15018 2839 aa10.05□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 TRAV27A0A087WT01 109 aa10.05□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa10.05□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 PDLIM1O00151 329 aa10.05□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 FFAR1O14842 300 aa10.05□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 ZNF432O94892 652 aa10.05□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 UBOX5O94941 541 aa10.05□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 ATE1O95260 518 aa10.05□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 FABP3P05413 133 aa10.05□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 ASAH2BP0C7U1 165 aa10.05□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 ATP6V1B2P21281 511 aa10.05□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 FUT4P22083 530 aa10.05□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 RPL4P36578 427 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 DAP3P51398 398 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 VLDLRP98155 873 aa10.05□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 ACKR1Q16570 336 aa10.05□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 SPATS1Q496A3 300 aa10.05□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 ANKRD16Q6P6B7 361 aa10.05□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 TBPL2Q6SJ96 375 aa10.05□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 C20orf204Q6ZNR8 217 aa10.05□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 HDDC2Q7Z4H3 204 aa10.05□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 IGFN1Q86VF2 1251 aa10.05□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 DHFR2Q86XF0 187 aa10.05□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 C20orf196Q8IYI0 205 aa10.05□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 DEPDC4Q8N2C3 294 aa10.05□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 OR13C2Q8NGS9 318 aa10.05□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 OR51A7Q8NH64 312 aa10.05□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 MOSPD2Q8NHP6 518 aa10.05□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 NINJ1Q92982 152 aa10.05□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 ZNF566Q969W8 418 aa10.05□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 LRGUKQ96M69 825 aa10.05□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 MUS81Q96NY9 551 aa10.05□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 PIP5K1AQ99755 562 aa10.05□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 GORASP2Q9H8Y8 452 aa10.05□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 TAS2R5Q9NYW4 299 aa10.05□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 NDUFAF4Q9P032 175 aa10.05□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 AURKCQ9UQB9 309 aa10.05□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 SLC25A15Q9Y619 301 aa10.05□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 PLCE1Q9P212 2302 aa10.05□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 DPRXA6NFQ7 191 aa10.04□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 HS3ST1O14792 307 aa10.04□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 GYG2O15488 501 aa10.04□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 SMPD2O60906 423 aa10.04□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 IGHG1P01857 330 aa10.04□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 B4GALT1P15291 398 aa10.04□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 RHCEP18577 417 aa10.04□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 MAKP20794 623 aa10.04□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 LOXP28300 417 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 MYBPC1Q00872 1141 aa10.04□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 SPOCK1Q08629 439 aa10.04□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 ZP4Q12836 540 aa10.04□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 NPRL3Q12980 569 aa10.04□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 TAF11Q15544 211 aa10.04□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 ALG10Q5BKT4 473 aa10.04□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 PHYHD1Q5SRE7 291 aa10.04□□□□□ -0.8
UBASH3B-208ENST00000533451 PODNL1Q6PEZ8 512 aa10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.8 ms