RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527644.1

TSPAN4-217, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN4, Length 968 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-217ENST00000527644 LRRC37BQ96QE4 947 aa23.01■■□□□ 1.27
TSPAN4-217ENST00000527644 DHRS9Q9BPW9 319 aa23.01■■□□□ 1.27
TSPAN4-217ENST00000527644 OR7A10O76100 309 aa23■■□□□ 1.27
TSPAN4-217ENST00000527644 BIDP55957 195 aa23■■□□□ 1.27
TSPAN4-217ENST00000527644 ATP5J2P56134 94 aa23■■□□□ 1.27
TSPAN4-217ENST00000527644 C3orf36Q3SXR2 165 aa23■■□□□ 1.27
TSPAN4-217ENST00000527644 FKBP9P1Q75LS8 142 aa23■■□□□ 1.27
TSPAN4-217ENST00000527644 WDFY1Q8IWB7 410 aa23■■□□□ 1.27
TSPAN4-217ENST00000527644 CCDC36Q8IYA8 594 aa23■■□□□ 1.27
TSPAN4-217ENST00000527644 FAM169BQ8N8A8 192 aa23■■□□□ 1.27
TSPAN4-217ENST00000527644 LIPHQ8WWY8 451 aa23■■□□□ 1.27
TSPAN4-217ENST00000527644 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
TSPAN4-217ENST00000527644 FAM162AQ96A26 154 aa23■■□□□ 1.27
TSPAN4-217ENST00000527644 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
TSPAN4-217ENST00000527644 SLC38A2Q96QD8 506 aa23■■□□□ 1.27
TSPAN4-217ENST00000527644 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
TSPAN4-217ENST00000527644 C20orf141Q9NUB4 165 aa23■■□□□ 1.27
TSPAN4-217ENST00000527644 ADA2Q9NZK5 511 aa23■■□□□ 1.27
TSPAN4-217ENST00000527644 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
TSPAN4-217ENST00000527644 HTR3EA5X5Y0 456 aa22.99■■□□□ 1.27
TSPAN4-217ENST00000527644 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa22.99■■□□□ 1.27
TSPAN4-217ENST00000527644 DCTN3O75935 186 aa22.99■■□□□ 1.27
TSPAN4-217ENST00000527644 CD8AP01732 235 aa22.99■■□□□ 1.27
TSPAN4-217ENST00000527644 AGAP6Q5VW22 663 aa22.99■■□□□ 1.27
TSPAN4-217ENST00000527644 OFCC1Q8IZS5 231 aa22.99■■□□□ 1.27
TSPAN4-217ENST00000527644 HSH2DQ96JZ2 352 aa22.99■■□□□ 1.27
TSPAN4-217ENST00000527644 FNDC11Q9BVV2 318 aa22.99■■□□□ 1.27
TSPAN4-217ENST00000527644 ULBP2Q9BZM5 246 aa22.99■■□□□ 1.27
TSPAN4-217ENST00000527644 SNX13Q9Y5W8 968 aa22.99■■□□□ 1.27
TSPAN4-217ENST00000527644 ATP23Q9Y6H3 246 aa22.99■■□□□ 1.27
TSPAN4-217ENST00000527644 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa22.98■■□□□ 1.27
TSPAN4-217ENST00000527644 NCK1P16333 377 aa22.98■■□□□ 1.27
TSPAN4-217ENST00000527644 TTKP33981 857 aa22.98■■□□□ 1.27
TSPAN4-217ENST00000527644 YAP1P46937 504 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
TSPAN4-217ENST00000527644 CSNK1A1P48729 337 aa22.98■■□□□ 1.27
TSPAN4-217ENST00000527644 TUBA1BP68363 451 aa22.98■■□□□ 1.27
TSPAN4-217ENST00000527644 TUBA4AP68366 448 aa22.98■■□□□ 1.27
TSPAN4-217ENST00000527644 B3GLCTQ6Y288 498 aa22.98■■□□□ 1.27
TSPAN4-217ENST00000527644 TUBA1AQ71U36 451 aa22.98■■□□□ 1.27
TSPAN4-217ENST00000527644 TAGLN3Q9UI15 199 aa22.98■■□□□ 1.27
TSPAN4-217ENST00000527644 RPS6KA6Q9UK32 745 aa22.98■■□□□ 1.27
TSPAN4-217ENST00000527644 POFUT2Q9Y2G5 429 aa22.98■■□□□ 1.27
TSPAN4-217ENST00000527644 BCL10O95999 233 aa22.97■■□□□ 1.27
TSPAN4-217ENST00000527644 FABP6P51161 128 aa22.97■■□□□ 1.27
TSPAN4-217ENST00000527644 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
TSPAN4-217ENST00000527644 GLYATQ6IB77 296 aa22.97■■□□□ 1.27
TSPAN4-217ENST00000527644 ZNF544Q6NX49 715 aa22.97■■□□□ 1.27
TSPAN4-217ENST00000527644 ZNF627Q7L945 461 aa22.97■■□□□ 1.27
TSPAN4-217ENST00000527644 FBXL14Q8N1E6 418 aa22.97■■□□□ 1.27
TSPAN4-217ENST00000527644 ANKS4BQ8N8V4 417 aa22.97■■□□□ 1.27
TSPAN4-217ENST00000527644 TMEM54Q969K7 222 aa22.97■■□□□ 1.27
TSPAN4-217ENST00000527644 ZNF566Q969W8 418 aa22.97■■□□□ 1.27
TSPAN4-217ENST00000527644 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
TSPAN4-217ENST00000527644 C18orf12Q96KH6 178 aa22.97■■□□□ 1.27
TSPAN4-217ENST00000527644 Q96MF0 132 aa22.97■■□□□ 1.27
TSPAN4-217ENST00000527644 KCNS3Q9BQ31 491 aa22.97■■□□□ 1.27
TSPAN4-217ENST00000527644 KATNB1Q9BVA0 655 aa22.97■■□□□ 1.27
TSPAN4-217ENST00000527644 EGFL7Q9UHF1 273 aa22.97■■□□□ 1.27
TSPAN4-217ENST00000527644 MOKQ9UQ07 419 aa22.97■■□□□ 1.27
TSPAN4-217ENST00000527644 A0A1W2PRG6 482 aa22.96■■□□□ 1.27
TSPAN4-217ENST00000527644 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa22.96■■□□□ 1.27
TSPAN4-217ENST00000527644 J3KTA2 159 aa22.96■■□□□ 1.27
TSPAN4-217ENST00000527644 FFAR1O14842 300 aa22.96■■□□□ 1.27
TSPAN4-217ENST00000527644 GMNNO75496 209 aa22.96■■□□□ 1.27
TSPAN4-217ENST00000527644 IGKV3-15P01624 115 aa22.96■■□□□ 1.27
TSPAN4-217ENST00000527644 IGLV1-44P01699 117 aa22.96■■□□□ 1.27
TSPAN4-217ENST00000527644 CBR1P16152 277 aa22.96■■□□□ 1.27
TSPAN4-217ENST00000527644 CDKN1AP38936 164 aa22.96■■□□□ 1.27
TSPAN4-217ENST00000527644 TRAM2Q15035 370 aa22.96■■□□□ 1.27
TSPAN4-217ENST00000527644 MUC15Q8N387 334 aa22.96■■□□□ 1.27
TSPAN4-217ENST00000527644 BDH2Q9BUT1 245 aa22.96■■□□□ 1.27
TSPAN4-217ENST00000527644 CBLN4Q9NTU7 201 aa22.96■■□□□ 1.27
TSPAN4-217ENST00000527644 ARL8BQ9NVJ2 186 aa22.96■■□□□ 1.27
TSPAN4-217ENST00000527644 GLTPQ9NZD2 209 aa22.96■■□□□ 1.27
TSPAN4-217ENST00000527644 RHCGQ9UBD6 479 aa22.96■■□□□ 1.27
TSPAN4-217ENST00000527644 CRYAAP02489 173 aa22.95■■□□□ 1.26
TSPAN4-217ENST00000527644 TSPAN19P0C672 248 aa22.95■■□□□ 1.26
TSPAN4-217ENST00000527644 ARR3P36575 388 aa22.95■■□□□ 1.26
TSPAN4-217ENST00000527644 AQP2P41181 271 aa22.95■■□□□ 1.26
TSPAN4-217ENST00000527644 MELKQ14680 651 aa22.95■■□□□ 1.26
TSPAN4-217ENST00000527644 ZNF813Q6ZN06 617 aa22.95■■□□□ 1.26
TSPAN4-217ENST00000527644 PGAM4Q8N0Y7 254 aa22.95■■□□□ 1.26
TSPAN4-217ENST00000527644 BPIFA2Q96DR5 249 aa22.95■■□□□ 1.26
TSPAN4-217ENST00000527644 CCT8L2Q96SF2 557 aa22.95■■□□□ 1.26
TSPAN4-217ENST00000527644 INIPQ9NRY2 104 aa22.95■■□□□ 1.26
TSPAN4-217ENST00000527644 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa22.95■■□□□ 1.26
TSPAN4-217ENST00000527644 PIP5K1CO60331 668 aa22.94■■□□□ 1.26
TSPAN4-217ENST00000527644 SEC14L2O76054 403 aa22.94■■□□□ 1.26
TSPAN4-217ENST00000527644 F13BP05160 661 aa22.94■■□□□ 1.26
TSPAN4-217ENST00000527644 CECR9P0C854 216 aa22.94■■□□□ 1.26
TSPAN4-217ENST00000527644 IFI30P13284 250 aa22.94■■□□□ 1.26
TSPAN4-217ENST00000527644 CAPZA2P47755 286 aa22.94■■□□□ 1.26
TSPAN4-217ENST00000527644 ETFDHQ16134 617 aa22.94■■□□□ 1.26
TSPAN4-217ENST00000527644 CYP4Z1Q86W10 505 aa22.94■■□□□ 1.26
TSPAN4-217ENST00000527644 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
TSPAN4-217ENST00000527644 RNF148Q8N7C7 305 aa22.94■■□□□ 1.26
TSPAN4-217ENST00000527644 FOXB1Q99853 325 aa22.94■■□□□ 1.26
TSPAN4-217ENST00000527644 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
TSPAN4-217ENST00000527644 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
TSPAN4-217ENST00000527644 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms