RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524481.5

PTPRK-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 3,157 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-216ENST00000524481 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 AMELYQ99218 206 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 MMP28Q9H239 520 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 HPF1Q9NWY4 346 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 MED13Q9UHV7 2174 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 A0A1W2PPL8 197 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 LCN1P1Q5VSP4 162 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 FNDC7Q5VTL7 733 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 LUZP2Q86TE4 346 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 OR52N1Q8NH53 320 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 NEDD4LQ96PU5 975 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 EXTL2Q9UBQ6 330 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 KLHL21Q9UJP4 597 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 EML6Q6ZMW3 1958 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 B4DXG7 233 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 IGHA1P01876 353 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 OR2T7P0C7T2 308 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 CCL3P10147 92 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 CTLA4P16410 223 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 ZNF823P16415 610 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 RGS19P49795 217 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 BIDP55957 195 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 IL11RAQ14626 422 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 TRIQKQ629K1 86 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 SLC23A3Q6PIS1 610 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 PLXDC2Q6UX71 529 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 Q6ZNX1 250 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 KRT77Q7Z794 578 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 GLCCI1Q86VQ1 547 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 FAM181AQ8N9Y4 354 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 OR2T27Q8NH04 317 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 HIF3AQ9Y2N7 669 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 ARID1AO14497 2285 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 A0A1W2PQ09 198 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 TMEM200CA6NKL6 621 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 PRR32B1ATL7 298 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 GLCEO94923 617 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 CASP3P42574 277 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 ZNF45Q02386 682 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 SRYQ05066 204 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 NRARPQ7Z6K4 114 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 CARFQ8N187 725 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 BEX2Q9BXY8 128 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 PTGES2Q9H7Z7 377 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 NOX4Q9NPH5 578 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 SLC22A13Q9Y226 551 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 SNPHO15079 494 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 SULT1C4O75897 302 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 IL1AP01583 271 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 ASAH2BP0C7U1 165 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 PNLIPP16233 465 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 F8A1P23610 371 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 CDAP32320 146 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 GALNSP34059 522 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 TALDO1P37837 337 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 PRKXP51817 358 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 GALK2Q01415 458 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 EFR3AQ14156 821 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 TGIF1Q15583 401 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 ZSWIM7Q19AV6 140 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 OR11G2Q8NGC1 345 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 OR10AC1Q8NH08 325 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 AP3S1Q92572 193 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 COQ7Q99807 217 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 EDEM2Q9BV94 578 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 ADAM19Q9H013 955 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 ELOVL3Q9HB03 270 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 ZFPL1O95159 310 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 UMODP07911 640 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 SLC2A1P11166 492 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 STARP49675 285 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 ACTC1P68032 377 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 ACTA1P68133 377 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 PSPHP78330 225 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRK-216ENST00000524481 PUDPQ08623 228 aa10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms