RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514178.5

PGGT1B-205, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 4

Gene PGGT1B, Length 553 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-205ENST00000514178 NEUROG2Q9H2A3 272 aa5.65□□□□□ -1.5
PGGT1B-205ENST00000514178 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PGGT1B-205ENST00000514178 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PGGT1B-205ENST00000514178 AIG1Q9NVV5 245 aa5.65□□□□□ -1.5
PGGT1B-205ENST00000514178 QPCTLQ9NXS2 382 aa5.65□□□□□ -1.5
PGGT1B-205ENST00000514178 TMEM9Q9P0T7 183 aa5.65□□□□□ -1.5
PGGT1B-205ENST00000514178 CLEC4EQ9ULY5 219 aa5.65□□□□□ -1.5
PGGT1B-205ENST00000514178 FANCIQ9NVI1 1328 aa5.65□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 CCDC88BA6NC98 1476 aa5.64□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 ADAMTSL3P82987 1691 aa5.64□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 TRAV25A0A0B4J276 109 aa5.64□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 GOLGA8TH3BQL2 631 aa5.64□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 TEX46H3BTG2 121 aa5.64□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 AIM2O14862 343 aa5.64□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 AGPAT2O15120 278 aa5.64□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 CHST1O43916 411 aa5.64□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 MAGEA1P43355 309 aa5.64□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 OR1G1P47890 313 aa5.64□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 RIPPLY3P57055 190 aa5.64□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 SPAG1Q07617 926 aa5.64□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 C22orf42Q6IC83 251 aa5.64□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa5.64□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 BCL7BQ9BQE9 202 aa5.64□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 TEKT3Q9BXF9 490 aa5.64□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 DNTTIP1Q9H147 329 aa5.64□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 SH2D2AQ9NP31 389 aa5.64□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa5.64□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 ASF1AQ9Y294 204 aa5.64□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 TEX14Q8IWB6 1497 aa5.64□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 AKR7A2O43488 359 aa5.63□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 CMA1P23946 247 aa5.63□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 STOMP27105 288 aa5.63□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 RORAP35398 523 aa5.63□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 NPBWR2P48146 333 aa5.63□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 DLX1P56177 255 aa5.63□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 SELENBP1Q13228 472 aa5.63□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 KYAT1Q16773 422 aa5.63□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa5.63□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 GPR157Q5UAW9 335 aa5.63□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 LHFPL3Q86UP9 236 aa5.63□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 PQLC3Q8N755 202 aa5.63□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 FBXL13Q8NEE6 735 aa5.63□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM122AQ96E09 287 aa5.63□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 IL26Q9NPH9 171 aa5.63□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa5.63□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa5.63□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 ADCY10Q96PN6 1610 aa5.63□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 C12orf77C9JDV5 145 aa5.62□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 DYNC1I1O14576 645 aa5.62□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 TNFSF11O14788 317 aa5.62□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 MGRN1O60291 552 aa5.62□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 CCNB1P14635 433 aa5.62□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 DCKP27707 260 aa5.62□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 RGRP47804 291 aa5.62□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 UQCRFS1P47985 274 aa5.62□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 RFX3P48380 749 aa5.62□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP5.62□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 SOHLH1Q5JUK2 328 aa5.62□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 REEP3Q6NUK4 255 aa5.62□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF620Q6ZNG0 422 aa5.62□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 GPD1LQ8N335 351 aa5.62□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 EID2Q8N6I1 236 aa5.62□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF740Q8NDX6 193 aa5.62□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 C7orf33Q8WU49 177 aa5.62□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 PRRC1Q96M27 445 aa5.62□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 RARRES2Q99969 163 aa5.62□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 TMEM246Q9BRR3 403 aa5.62□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 CWH43Q9H720 699 aa5.62□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 UGT1A10Q9HAW8 530 aa5.62□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 CALYQ9NYX4 217 aa5.62□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 NUP160Q12769 1436 aa5.62□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 RLFQ13129 1914 aa5.62□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 A0A0G2JLM5 398 aa5.61□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 SIRPB1O00241 398 aa5.61□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 PHOX2AO14813 284 aa5.61□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 POLR2MP0CAP2 368 aa5.61□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 GSTM3P21266 225 aa5.61□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 CLDN8P56748 225 aa5.61□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 CNTNAP1P78357 1384 aa5.61□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 MAB21L1Q13394 359 aa5.61□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 DOC2AQ14183 400 aa5.61□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 EOGTQ5NDL2 527 aa5.61□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 PPM1LQ5SGD2 360 aa5.61□□□□□ -1.51
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC25A30Q5SVS4 291 aa5.61□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms