RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509870.1

HOXC-AS3-201, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 544 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ULBP2Q9BZM5 246 aa13.15□□□□□ -0.3
HOXC-AS3-201ENST00000509870 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
HOXC-AS3-201ENST00000509870 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF442Q9H7R0 627 aa13.15□□□□□ -0.3
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF229Q9UJW7 825 aa13.15□□□□□ -0.3
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SH3GLB1Q9Y371 365 aa13.15□□□□□ -0.3
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FKBP7Q9Y680 259 aa13.15□□□□□ -0.3
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LOC100653049A0A140TA62 436 aa13.14□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SLC22A2O15244 555 aa13.14□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ENTPD5O75356 428 aa13.14□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CRLF1O75462 422 aa13.14□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KRT34O76011 436 aa13.14□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 THY1P04216 161 aa13.14□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OR4A8P0C604 315 aa13.14□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 IFNGR1P15260 489 aa13.14□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CAPZA2P47755 286 aa13.14□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CRYBA2P53672 197 aa13.14□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CAMK2DQ13557 499 aa13.14□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ADIPOQQ15848 244 aa13.14□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HSP90B2PQ58FF3 399 aa13.14□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 REP15Q6BDI9 236 aa13.14□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF813Q6ZN06 617 aa13.14□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MDP1Q86V88 176 aa13.14□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF525Q8N782 197 aa13.14□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 C10orf82Q8WW14 230 aa13.14□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HTRA1Q92743 480 aa13.14□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF583Q96ND8 569 aa13.14□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa13.14□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PLK3Q9H4B4 646 aa13.14□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CCDC134Q9H6E4 229 aa13.14□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 B3GNT2Q9NY97 397 aa13.14□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TAS2R5Q9NYW4 299 aa13.14□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 AP3M1Q9Y2T2 418 aa13.14□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa13.13□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 C11orf98E9PRG8 122 aa13.13□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RNF13O43567 381 aa13.13□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SERPINI2O75830 405 aa13.13□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ASAH2BP0C7U1 165 aa13.13□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CALCRP30988 508 aa13.13□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RBM34P42696 430 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CSNK1A1P48729 337 aa13.13□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 BIDP55957 195 aa13.13□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HGFACQ04756 655 aa13.13□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NPRL3Q12980 569 aa13.13□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GSG1Q2KHT4 349 aa13.13□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 VHLLQ6RSH7 139 aa13.13□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SLC35D2Q76EJ3 337 aa13.13□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa13.13□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CARM1Q86X55 608 aa13.13□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 C10orf105Q8TEF2 133 aa13.13□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FOXB1Q99853 325 aa13.13□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF446Q9NWS9 450 aa13.13□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FBXL3Q9UKT7 428 aa13.13□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CAPN7Q9Y6W3 813 aa13.13□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 A0A096LNT2 108 aa13.12□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NDUFS8O00217 210 aa13.12□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SEC14L2O76054 403 aa13.12□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OR5F1O95221 314 aa13.12□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 IGF2P01344 180 aa13.12□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HLA-HP01893 362 aa13.12□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MT-ND1P03886 318 aa13.12□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CELA3BP08861 270 aa13.12□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 THRBP10828 461 aa13.12□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 UMPSP11172 480 aa13.12□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CD79AP11912 226 aa13.12□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NPR2P20594 1047 aa13.12□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KDELR2P33947 212 aa13.12□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PPOXP50336 477 aa13.12□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TAS2R41P59536 307 aa13.12□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GUCY1A3Q02108 690 aa13.12□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CGB2Q6NT52 195 aa13.12□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LRRC17Q8N6Y2 441 aa13.12□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TMEM54Q969K7 222 aa13.12□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF566Q969W8 418 aa13.12□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PRSS27Q9BQR3 290 aa13.12□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RAB1BQ9H0U4 201 aa13.12□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SEC61A2Q9H9S3 476 aa13.12□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 YAE1D1Q9NRH1 226 aa13.12□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GLTPQ9NZD2 209 aa13.12□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RIMS3Q9UJD0 308 aa13.12□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SPEF1Q9Y4P9 236 aa13.12□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ABCA1O95477 2261 aa13.12□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HTR3EA5X5Y0 456 aa13.11□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa13.11□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FAM220BPB1ANY3 271 aa13.11□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 UBL3O95164 117 aa13.11□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 BCL10O95999 233 aa13.11□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 B4GALT1P15291 398 aa13.11□□□□□ -0.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 USF1P22415 310 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87.3 ms