RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497508.1

TMEM18-208, Transcript of transmembrane protein 18, human

TSL 2

Gene TMEM18, Length 1,706 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMEM18-208	ENST00000497508	NANOGNB	Q7Z5D8	188 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TMEM18-208	ENST00000497508	GPALPP1	Q8IXQ4	340 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TMEM18-208	ENST00000497508	SDR9C7	Q8NEX9	313 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TMEM18-208	ENST00000497508	DDO	Q99489	341 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TMEM18-208	ENST00000497508	SH3GL3	Q99963	347 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TMEM18-208	ENST00000497508	KATNB1	Q9BVA0	655 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TMEM18-208	ENST00000497508	ADGRL4	Q9HBW9	690 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TMEM18-208	ENST00000497508	TMED7	Q9Y3B3	224 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TMEM18-208	ENST00000497508	ADAM18	Q9Y3Q7	739 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TMEM18-208	ENST00000497508	SHANK1	Q9Y566	2161 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TMEM18-208	ENST00000497508	DAPL1	A0PJW8	107 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TMEM18-208	ENST00000497508	ZNF670-ZNF695	F2Z2N8	137 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TMEM18-208	ENST00000497508	BLOC1S5-TXNDC5	H3BN57	136 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TMEM18-208	ENST00000497508	TXNDC12	O95881	172 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TMEM18-208	ENST00000497508	HIST1H2AB	P04908	130 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TMEM18-208	ENST00000497508	DNASE1L1	P49184	302 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TMEM18-208	ENST00000497508	MEOX1	P50221	254 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TMEM18-208	ENST00000497508	SLC16A1	P53985	500 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TMEM18-208	ENST00000497508	DLX5	P56178	289 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TMEM18-208	ENST00000497508	ACTC1	P68032	377 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TMEM18-208	ENST00000497508	ACTA1	P68133	377 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TMEM18-208	ENST00000497508	NTRK2	Q16620	822 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TMEM18-208	ENST00000497508	ALG10	Q5BKT4	473 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TMEM18-208	ENST00000497508	RPUSD3	Q6P087	351 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
TMEM18-208	ENST00000497508	C5orf46	Q6UWT4	87 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TMEM18-208	ENST00000497508	HIST3H2A	Q7L7L0	130 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TMEM18-208	ENST00000497508	NPEPL1	Q8NDH3	523 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TMEM18-208	ENST00000497508	STK35	Q8TDR2	534 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TMEM18-208	ENST00000497508	SPRYD4	Q8WW59	207 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.3
TMEM18-208	ENST00000497508	TMEM234	Q8WY98	164 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TMEM18-208	ENST00000497508	ST8SIA1	Q92185	356 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TMEM18-208	ENST00000497508	HIST1H2AC	Q93077	130 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TMEM18-208	ENST00000497508	SGCZ	Q96LD1	299 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TMEM18-208	ENST00000497508	ALG8	Q9BVK2	526 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TMEM18-208	ENST00000497508	NMNAT2	Q9BZQ4	307 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TMEM18-208	ENST00000497508	TSPAN10	Q9H1Z9	355 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.3
TMEM18-208	ENST00000497508	KLF13	Q9Y2Y9	288 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.3
TMEM18-208	ENST00000497508	SF3B6	Q9Y3B4	125 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
TMEM18-208	ENST00000497508	CHCHD2	Q9Y6H1	151 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.3
TMEM18-208	ENST00000497508	FLNC	Q14315	2725 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TMEM18-208	ENST00000497508	TENM4	Q6N022	2769 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TMEM18-208	ENST00000497508	TMEM72	A0PK05	275 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508		A8MVM7	634 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	CDK2AP1	O14519	115 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	SUSD5	O60279	629 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	MT-ATP6	P00846	226 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	CLU	P10909	449 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	GABRA5	P31644	462 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	SOX6	P35712	828 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	CAPZA2	P47755	286 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	RPS25	P62851	125 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	GALE	Q14376	348 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	GGTLC2	Q14390	218 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	RNFT1	Q5M7Z0	435 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	SLC35D3	Q5M8T2	416 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	FAM180A	Q6UWF9	173 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	MFSD4A	Q8N468	514 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	OR10H4	Q8NGA5	316 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	PAQR8	Q8TEZ7	354 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	SMPDL3B	Q92485	455 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	CDADC1	Q9BWV3	514 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	ASPN	Q9BXN1	380 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	SH2D2A	Q9NP31	389 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	PCNX3	Q9H6A9	2034 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	FASN	P49327	2511 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	SNPH	O15079	494 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	NPIPB7	O75200	414 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	LALBA	P00709	142 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508		P04436	131 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	MSX1	P28360	303 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	RPS5	P46782	204 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	SLC25A1	P53007	311 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	CTXN1	P60606	82 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	RPL18	Q07020	188 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	GPR50	Q13585	617 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	EMC4	Q5J8M3	183 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	SLC22A10	Q63ZE4	541 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	MAMDC2	Q7Z304	686 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	FAM122B	Q7Z309	247 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	ADGRG3	Q86Y34	549 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	POMGNT2	Q8NAT1	580 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	OR2M7	Q8NG81	312 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	OR6S1	Q8NH40	331 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	RASD2	Q96D21	266 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	TRMT61A	Q96FX7	289 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	FRMD6	Q96NE9	622 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	COQ7	Q99807	217 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	PTDSS2	Q9BVG9	487 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	SACM1L	Q9NTJ5	587 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	TXNL4B	Q9NX01	149 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	IGLV3-32	A0A0A0MS00	114 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	TEX13C	A0A0J9YWL9	993 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	TRDV1	A0A1B0GX56	115 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	MT-ND5	P03915	603 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	GYPB	P06028	91 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	MRPL3	P09001	348 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	BMP4	P12644	408 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	SDHA	P31040	664 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	DIO1	P49895	249 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	PON3	Q15166	354 aa		13.13	□□□□□ -0.31

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