RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497368.1

UBE3C-208, Transcript of ubiquitin protein ligase E3C, human

TSL 2

Gene UBE3C, Length 776 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBE3C-208	ENST00000497368	CPPED1	Q9BRF8	314 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	MANSC1	Q9H8J5	431 aa		4.77	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	TPT1P8	Q9HAU6	139 aa		4.77	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	TMBIM4	Q9HC24	238 aa		4.77	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	SLCO1B3	Q9NPD5	702 aa		4.77	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	TIGAR	Q9NQ88	270 aa		4.77	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	ST6GALNAC1	Q9NSC7	600 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	CBLN4	Q9NTU7	201 aa		4.77	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	ZIM2	Q9NZV7	527 aa		4.77	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	VAPA	Q9P0L0	249 aa		4.77	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	H2AFY2	Q9P0M6	372 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	PCDHGB4	Q9UN71	923 aa		4.77	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	SLC9A8	Q9Y2E8	581 aa		4.77	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	ARPC4-TTLL3	A0A0A6YYG9	625 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	FAM171A2	A8MVW0	826 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	KLF11	O14901	512 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	SEC14L2	O76054	403 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	AGR2	O95994	175 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	IGKV3-15	P01624	115 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	BGLAP	P02818	100 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	HLA-DOB	P13765	273 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	TNFRSF1A	P19438	455 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	PTAFR	P25105	342 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	MPG	P29372	298 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	CLK1	P49759	484 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	SLC18A1	P54219	525 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	MAGOH	P61326	146 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	SLC35A1	P78382	337 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	LOXL1	Q08397	574 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	NFYC	Q13952	458 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	ADIPOQ	Q15848	244 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	ETFDH	Q16134	617 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	ZSWIM7	Q19AV6	140 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	LIN52	Q52LA3	116 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	C1orf140	Q5VVS0	124 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	EPGN	Q6UW88	154 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	MSANTD1	Q6ZTZ1	278 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	IL17REL	Q6ZVW7	336 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	P2RY8	Q86VZ1	359 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	JAZF1	Q86VZ6	243 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	ZNF100	Q8IYN0	542 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	MUC15	Q8N387	334 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	C17orf78	Q8N4C9	275 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	GPR32P1	Q8NGA4	272 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	FGFBP3	Q8TAT2	258 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	DNAH3	Q8TD57	4116 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	CFHR4	Q92496	578 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	REXO5	Q96IC2	774 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	OR10A2	Q9H208	303 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	BCL2L10	Q9HD36	194 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	A4GALT	Q9NPC4	353 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	ASB6	Q9NWX5	421 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	EMC3	Q9P0I2	261 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	P2RX2	Q9UBL9	471 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	MOK	Q9UQ07	419 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	SPIN1	Q9Y657	262 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	GMEB1	Q9Y692	573 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	MEGF8	Q7Z7M0	2845 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	UQCRHL	A0A096LP55	91 aa		4.75	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368		A0A096LPI6	279 aa		4.75	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368		A0A0B4J2E0	115 aa		4.75	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368		A0A1B0GWA3	101 aa		4.75	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368		A0A1B0GX12	115 aa		4.75	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	FAM234B	A2RU67	622 aa		4.75	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	RPL36A-HNRNPH2	H7BZ11	118 aa		4.75	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	FXYD1	O00168	92 aa		4.75	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	RFXANK	O14593	260 aa		4.75	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	GPR171	O14626	319 aa		4.75	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	MRPL33	O75394	65 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	ERLIN1	O75477	346 aa		4.75	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	SLC22A3	O75751	556 aa		4.75	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	SNUPN	O95149	360 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	NR2F1	P10589	423 aa		4.75	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	IDO1	P14902	403 aa		4.75	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	MAGEA8	P43361	318 aa		4.75	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	HTR3A	P46098	478 aa		4.75	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	GZMM	P51124	257 aa		4.75	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	POLR2J	P52435	117 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	NAAA	Q02083	359 aa		4.75	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	ROM1	Q03395	351 aa		4.75	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	RGN	Q15493	299 aa		4.75	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	ATAD3B	Q5T9A4	648 aa		4.75	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	WBP2NL	Q6ICG8	309 aa		4.75	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	ZNF544	Q6NX49	715 aa		4.75	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	DHRS4L2	Q6PKH6	230 aa		4.75	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	SLC22A25	Q6T423	547 aa		4.75	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		4.75	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	DLEU7	Q6UYE1	221 aa		4.75	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	ZNF621	Q6ZSS3	439 aa		4.75	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	ZNF584	Q8IVC4	421 aa		4.75	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	CDK20	Q8IZL9	346 aa		4.75	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	ZCCHC24	Q8N2G6	241 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	UBE2J2	Q8N2K1	259 aa		4.75	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	CADM2	Q8N3J6	435 aa		4.75	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	GLB1L3	Q8NCI6	653 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	NFKBID	Q8NI38	313 aa		4.75	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	TAAR8	Q969N4	342 aa		4.75	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	SLC41A3	Q96GZ6	507 aa		4.75	□□□□□ -1.65
UBE3C-208	ENST00000497368	C16orf92	Q96LL3	132 aa		4.75	□□□□□ -1.65

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