RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495588.2

GAPVD1-218, Transcript of GTPase activating protein and VPS9 domains 1, human

TSL 5

Gene GAPVD1, Length 274 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GAPVD1-218	ENST00000495588	IGFL2	Q6UWQ7	119 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	ARSK	Q6UWY0	536 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	PLEKHM3	Q6ZWE6	761 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	ZNF440	Q8IYI8	595 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	OFCC1	Q8IZS5	231 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	HS3ST5	Q8IZT8	346 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	CADM2	Q8N3J6	435 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	FADS6	Q8N9I5	356 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	ICA1L	Q8NDH6	482 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	OR2M3	Q8NG83	312 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	OR2T29	Q8NH02	315 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	OR52J3	Q8NH60	311 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	OR5W2	Q8NH69	310 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	B4GALNT2	Q8NHY0	566 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	ADAMTS16	Q8TE57	1224 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	SNRNP27	Q8WVK2	155 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	AKAP1	Q92667	903 aa	Known RBP eCLIP	4.94	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	HAS2	Q92819	552 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	SLC35B4	Q969S0	331 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	SLC41A3	Q96GZ6	507 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	CENPN	Q96H22	339 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	ZNF347	Q96SE7	839 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	BARD1	Q99728	777 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	PIP5K1A	Q99755	562 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	ZNF559	Q9BR84	538 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	FNDC11	Q9BVV2	318 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	DSN1	Q9H410	356 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	YY1AP1	Q9H869	796 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	EVA1A	Q9H8M9	152 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	NMNAT1	Q9HAN9	279 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	KLHL1	Q9NR64	748 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	SDHAF3	Q9NRP4	125 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	MAN2C1	Q9NTJ4	1040 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	ACER3	Q9NUN7	267 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	TUBA8	Q9NY65	449 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	CNIH4	Q9P003	139 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	C6orf203	Q9P0P8	240 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	DNAJB9	Q9UBS3	223 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	SLC7A7	Q9UM01	511 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	B3GNT3	Q9Y2A9	372 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	SAMHD1	Q9Y3Z3	626 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	FAM32A	Q9Y421	112 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	MAGED1	Q9Y5V3	778 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	LYVE1	Q9Y5Y7	322 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	PIEZO1	Q92508	2521 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	NCKAP5	O14513	1909 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	TRBV4-1	A0A0J9YWV2	114 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588		A0A1B0GWA3	101 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	TRAPPC13	A5PLN9	417 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	TMEM8B	A6NDV4	472 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	ANKUB1	A6NFN9	424 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588		A6NLC8	198 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	TNFRSF11B	O00300	401 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	FAAH	O00519	579 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	CASQ2	O14958	399 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	ADAMDEC1	O15204	470 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	DPM1	O60762	260 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	SNX4	O95219	450 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	OR5F1	O95221	314 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	GADD45G	O95257	159 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	LYPD3	O95274	346 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	APC2	O95996	2303 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	LDLR	P01130	860 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	H1F0	P07305	194 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	SP1	P08047	785 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	RFPL3S	P0C7P2	107 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	UQCRB	P14927	111 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	ZNF23	P17027	643 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	PGC	P20142	388 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	CNR1	P21554	472 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	TCEA1	P23193	301 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	ELAVL4	P26378	380 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	TACR3	P29371	465 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	RFC3	P40938	356 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	SLC6A8	P48029	635 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	NR1H2	P55055	460 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	COPZ1	P61923	177 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	SLC34A1	Q06495	639 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	ST3GAL3	Q11203	375 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	MFSD13A	Q14CX5	517 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	QPRT	Q15274	297 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	SEC23B	Q15437	767 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	TRIP10	Q15642	601 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	LRRC36	Q1X8D7	754 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	EXOC3L2	Q2M3D2	409 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	PLPPR5	Q32ZL2	321 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	LINC00303	Q3SY05	128 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	ZNF766	Q5HY98	468 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	ALG10B	Q5I7T1	473 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	FGD3	Q5JSP0	725 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	LPCAT4	Q643R3	524 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	TIGD3	Q6B0B8	471 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	WBP2NL	Q6ICG8	309 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	SLC25A25	Q6KCM7	469 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	ZNF613	Q6PF04	617 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	TBPL2	Q6SJ96	375 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	IGFL3	Q6UXB1	125 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GAPVD1-218	ENST00000495588	WDR88	Q6ZMY6	472 aa		4.93	□□□□□ -1.62

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